Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G052000.1
Synonym Sb07g004210
Functional annotation zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed
UniProt A0A1B6PFW0
Pfam PF00097
Panther DB PTHR12313
NCBI CDD KOG4172; Predicted E3 ubiquitin ligase
KEGG Orthology K10666; E3 ubiquitin-protein ligase RNF5
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G42030 : RING/U-box superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g06510.1 : zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a036085 , Zm00025a055094 , Zm00025a024328
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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20 Sobic.002G226200 - -


Gene co-expression network
sample Sobic007G052000 Sobic007G052000 Sobic010G054150 Sobic010G054150 Sobic007G052000--Sobic010G054150 Sobic001G245100 Sobic001G245100 Sobic007G052000--Sobic001G245100 Sobic003G335000 Sobic003G335000 Sobic007G052000--Sobic003G335000 Sobic009G186300 Sobic009G186300 Sobic007G052000--Sobic009G186300 Sobic008G170800 Sobic008G170800 Sobic007G052000--Sobic008G170800 Sobic002G309300 Sobic002G309300 Sobic007G052000--Sobic002G309300 Sobic006G248450 Sobic006G248450 Sobic007G052000--Sobic006G248450 Sobic008G142200 Sobic008G142200 Sobic007G052000--Sobic008G142200 Sobic001G191500 Sobic001G191500 Sobic007G052000--Sobic001G191500 Sobic010G054150--Sobic006G248450 Sobic010G054150--Sobic007G052000 Sobic004G070150 Sobic004G070150 Sobic010G054150--Sobic004G070150 Sobic010G274700 Sobic010G274700 Sobic010G054150--Sobic010G274700 Sobic002G226200 Sobic002G226200 Sobic010G054150--Sobic002G226200 Sobic007G016200 Sobic007G016200 Sobic010G054150--Sobic007G016200 Sobic007G137750 Sobic007G137750 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Octagon: transcription factors


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