Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G132550.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5R6C5
Pfam PF00005
Panther DB PTHR19241
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0016887; ATPase activity GO:0005524ATP binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G29940 : pleiotropic drug resistance 3
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g11760.1 : pleiotropic drug resistance protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G406200 - -
2 Sobic.006G128150 - -
3 Sobic.003G267600 potassium channel protein, putative, expressed -
4 Sobic.008G082550 - -
5 Sobic.009G192400 - -
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7 Sobic.007G052000 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed K10666: E3 ubiquitin-protein ligase RNF5
8 Sobic.001G079150 - -
9 Sobic.004G237900 no apical meristem protein, putative, expressed -
10 Sobic.001G283400 CSLD1 - cellulose synthase-like family D, expressed -
11 Sobic.010G154801 - -
12 Sobic.001G036400 expressed protein -
13 Sobic.001G296600 - -
14 Sobic.003G399800 Homologous to EPF/EPFL genes in Arabidopsis. Modelling of protein structure.(PubMedID : 23755192)@expressed protein -
15 Sobic.003G334400 verticillium wilt disease resistance protein precursor, putative, expressed -
16 Sobic.002G200400 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
17 Sobic.001G243800 transcription factor, putative, expressed -
18 Sobic.001G245100 - -
19 Sobic.010G265400 ras-related protein, putative, expressed K07904: Ras-related protein Rab-11A
20 Sobic.003G230800 - -


Gene co-expression network
sample Sobic008G132550 Sobic008G132550 Sobic001G406200 Sobic001G406200 Sobic008G132550--Sobic001G406200 Sobic006G128150 Sobic006G128150 Sobic008G132550--Sobic006G128150 Sobic003G267600 Sobic003G267600 Sobic008G132550--Sobic003G267600 Sobic008G082550 Sobic008G082550 Sobic008G132550--Sobic008G082550 Sobic009G192400 Sobic009G192400 Sobic008G132550--Sobic009G192400 Sobic007G206400 Sobic007G206400 Sobic008G132550--Sobic007G206400 Sobic007G052000 Sobic007G052000 Sobic008G132550--Sobic007G052000 Sobic001G079150 Sobic001G079150 Sobic008G132550--Sobic001G079150 Sobic004G237900 Sobic004G237900 Sobic008G132550--Sobic004G237900 Sobic010G154801 Sobic010G154801 Sobic001G406200--Sobic010G154801 Sobic004G150300 Sobic004G150300 Sobic001G406200--Sobic004G150300 Sobic001G406200--Sobic006G128150 Sobic001G352633 Sobic001G352633 Sobic001G406200--Sobic001G352633 Sobic001G406200--Sobic008G132550 Sobic001G406200--Sobic008G082550 Sobic002G172800 Sobic002G172800 Sobic001G406200--Sobic002G172800 Sobic001G406200--Sobic009G192400 Sobic003G253100 Sobic003G253100 Sobic001G406200--Sobic003G253100 Sobic001G036400 Sobic001G036400 Sobic006G128150--Sobic001G036400 Sobic002G256250 Sobic002G256250 Sobic006G128150--Sobic002G256250 Sobic010G028333 Sobic010G028333 Sobic006G128150--Sobic010G028333 Sobic006G128150--Sobic008G082550 Sobic002G200400 Sobic002G200400 Sobic006G128150--Sobic002G200400 Sobic006G128150--Sobic001G079150 Sobic006G128150--Sobic009G192400 Sobic001G378900 Sobic001G378900 Sobic006G128150--Sobic001G378900 Sobic010G155000 Sobic010G155000 Sobic006G128150--Sobic010G155000 Sobic004G205900 Sobic004G205900 Sobic003G267600--Sobic004G205900 Sobic003G267600--Sobic009G192400 Sobic002G226200 Sobic002G226200 Sobic003G267600--Sobic002G226200 Sobic001G283400 Sobic001G283400 Sobic003G267600--Sobic001G283400 Sobic007G016200 Sobic007G016200 Sobic003G267600--Sobic007G016200 Sobic003G267600--Sobic007G206400 Sobic007G078900 Sobic007G078900 Sobic003G267600--Sobic007G078900 Sobic003G267600--Sobic010G155000 Sobic009G199750 Sobic009G199750 Sobic003G267600--Sobic009G199750 Sobic008G082550--Sobic001G079150 Sobic008G082550--Sobic006G128150 Sobic008G082550--Sobic002G200400 Sobic003G028700 Sobic003G028700 Sobic008G082550--Sobic003G028700 Sobic008G082550--Sobic001G378900 Sobic008G082550--Sobic010G155000 Sobic008G082550--Sobic007G206400 Sobic008G082550--Sobic001G283400 Sobic008G082550--Sobic001G352633 Sobic009G192400--Sobic010G155000 Sobic009G192400--Sobic003G267600 Sobic003G334400 Sobic003G334400 Sobic009G192400--Sobic003G334400 Sobic009G192400--Sobic001G283400 Sobic007G182300 Sobic007G182300 Sobic009G192400--Sobic007G182300 Sobic006G041200 Sobic006G041200 Sobic009G192400--Sobic006G041200 Sobic009G192400--Sobic007G206400 Sobic007G203800 Sobic007G203800 Sobic009G192400--Sobic007G203800 Sobic009G192400--Sobic006G128150 Sobic007G206400--Sobic009G199750 Sobic004G180950 Sobic004G180950 Sobic007G206400--Sobic004G180950 Sobic007G206400--Sobic001G283400 Sobic007G206400--Sobic010G155000 Sobic007G206400--Sobic009G192400 Sobic007G206400--Sobic002G200400 Sobic007G206400--Sobic007G203800 Sobic003G230800 Sobic003G230800 Sobic007G206400--Sobic003G230800 Sobic007G206400--Sobic003G267600 Sobic010G054150 Sobic010G054150 Sobic007G052000--Sobic010G054150 Sobic001G245100 Sobic001G245100 Sobic007G052000--Sobic001G245100 Sobic003G335000 Sobic003G335000 Sobic007G052000--Sobic003G335000 Sobic009G186300 Sobic009G186300 Sobic007G052000--Sobic009G186300 Sobic008G170800 Sobic008G170800 Sobic007G052000--Sobic008G170800 Sobic002G309300 Sobic002G309300 Sobic007G052000--Sobic002G309300 Sobic006G248450 Sobic006G248450 Sobic007G052000--Sobic006G248450 Sobic008G142200 Sobic008G142200 Sobic007G052000--Sobic008G142200 Sobic001G191500 Sobic001G191500 Sobic007G052000--Sobic001G191500 Sobic001G079150--Sobic008G082550 Sobic010G265400 Sobic010G265400 Sobic001G079150--Sobic010G265400 Sobic001G079150--Sobic006G128150 Sobic001G079150--Sobic001G352633 Sobic001G079150--Sobic009G192400 Sobic005G118500 Sobic005G118500 Sobic001G079150--Sobic005G118500 Sobic001G079150--Sobic010G028333 Sobic001G079150--Sobic010G155000 Sobic001G079150--Sobic002G200400 Sobic003G399800 Sobic003G399800 Sobic004G237900--Sobic003G399800 Sobic004G258450 Sobic004G258450 Sobic004G237900--Sobic004G258450 Sobic004G237900--Sobic001G245100 Sobic002G107700 Sobic002G107700 Sobic004G237900--Sobic002G107700 Sobic004G237900--Sobic008G132550 Sobic010G184201 Sobic010G184201 Sobic004G237900--Sobic010G184201 Sobic004G070150 Sobic004G070150 Sobic004G237900--Sobic004G070150 Sobic009G049100 Sobic009G049100 Sobic004G237900--Sobic009G049100 Sobic001G385132 Sobic001G385132 Sobic004G237900--Sobic001G385132
Octagon: transcription factors


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