Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G243800.1
Synonym TGA3
Functional annotation transcription factor, putative, expressed
UniProt A0A1B6QKQ0
Pfam PF00170 PF14144
Panther DB PTHR22952 PTHR22952:SF160
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0006355; regulation of transcription, DNA-templated GO:0003700DNA-binding transcription factor activity GO:0006351transcription, DNA-templated


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G22070 : TGA1A-related gene 3
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g07970.1 : transcription factor, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a054662
Brachypodium KQJ84872 , KQJ95170 , KQJ84861
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G082550 - -
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18 Sobic.004G180950 - -
19 Sobic.004G072300 - -
20 Sobic.004G186950 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G243800 Sobic001G243800 Sobic008G082550 Sobic008G082550 Sobic001G243800--Sobic008G082550 Sobic001G378900 Sobic001G378900 Sobic001G243800--Sobic001G378900 Sobic003G230800 Sobic003G230800 Sobic001G243800--Sobic003G230800 Sobic006G128150 Sobic006G128150 Sobic001G243800--Sobic006G128150 Sobic003G028700 Sobic003G028700 Sobic001G243800--Sobic003G028700 Sobic002G200400 Sobic002G200400 Sobic001G243800--Sobic002G200400 Sobic007G167600 Sobic007G167600 Sobic001G243800--Sobic007G167600 Sobic008G132550 Sobic008G132550 Sobic001G243800--Sobic008G132550 Sobic001G036400 Sobic001G036400 Sobic001G243800--Sobic001G036400 Sobic001G079150 Sobic001G079150 Sobic008G082550--Sobic001G079150 Sobic008G082550--Sobic006G128150 Sobic008G082550--Sobic002G200400 Sobic008G082550--Sobic003G028700 Sobic008G082550--Sobic001G378900 Sobic010G155000 Sobic010G155000 Sobic008G082550--Sobic010G155000 Sobic007G206400 Sobic007G206400 Sobic008G082550--Sobic007G206400 Sobic001G283400 Sobic001G283400 Sobic008G082550--Sobic001G283400 Sobic001G352633 Sobic001G352633 Sobic008G082550--Sobic001G352633 Sobic001G378900--Sobic006G128150 Sobic001G378900--Sobic008G082550 Sobic001G378900--Sobic001G036400 Sobic001G378900--Sobic002G200400 Sobic001G378900--Sobic010G155000 Sobic002G256250 Sobic002G256250 Sobic001G378900--Sobic002G256250 Sobic001G378900--Sobic001G283400 Sobic001G378900--Sobic001G243800 Sobic005G019250 Sobic005G019250 Sobic001G378900--Sobic005G019250 Sobic004G180950 Sobic004G180950 Sobic003G230800--Sobic004G180950 Sobic003G230800--Sobic001G283400 Sobic004G160750 Sobic004G160750 Sobic003G230800--Sobic004G160750 Sobic003G230800--Sobic002G200400 Sobic009G199750 Sobic009G199750 Sobic003G230800--Sobic009G199750 Sobic002G129900 Sobic002G129900 Sobic003G230800--Sobic002G129900 Sobic003G085533 Sobic003G085533 Sobic003G230800--Sobic003G085533 Sobic006G215650 Sobic006G215650 Sobic003G230800--Sobic006G215650 Sobic004G072300 Sobic004G072300 Sobic003G230800--Sobic004G072300 Sobic006G128150--Sobic001G036400 Sobic006G128150--Sobic002G256250 Sobic010G028333 Sobic010G028333 Sobic006G128150--Sobic010G028333 Sobic006G128150--Sobic008G082550 Sobic006G128150--Sobic002G200400 Sobic006G128150--Sobic001G079150 Sobic009G192400 Sobic009G192400 Sobic006G128150--Sobic009G192400 Sobic006G128150--Sobic001G378900 Sobic006G128150--Sobic010G155000 Sobic003G028700--Sobic007G167600 Sobic003G028700--Sobic008G082550 Sobic003G028700--Sobic007G206400 Sobic003G028700--Sobic009G199750 Sobic002G202350 Sobic002G202350 Sobic003G028700--Sobic002G202350 Sobic004G186950 Sobic004G186950 Sobic003G028700--Sobic004G186950 Sobic003G028700--Sobic002G200400 Sobic003G028700--Sobic004G180950 Sobic003G028700--Sobic003G230800 Sobic002G200400--Sobic004G180950 Sobic002G200400--Sobic001G283400 Sobic002G200400--Sobic009G199750 Sobic002G200400--Sobic010G155000 Sobic002G200400--Sobic004G072300 Sobic006G205300 Sobic006G205300 Sobic002G200400--Sobic006G205300 Sobic004G183701 Sobic004G183701 Sobic002G200400--Sobic004G183701 Sobic002G200400--Sobic003G085533 Sobic002G200400--Sobic001G352633 Sobic009G145200 Sobic009G145200 Sobic007G167600--Sobic009G145200 Sobic007G167600--Sobic003G028700 Sobic001G401750 Sobic001G401750 Sobic007G167600--Sobic001G401750 Sobic007G167600--Sobic004G072300 Sobic004G249950 Sobic004G249950 Sobic007G167600--Sobic004G249950 Sobic007G098050 Sobic007G098050 Sobic007G167600--Sobic007G098050 Sobic001G081450 Sobic001G081450 Sobic007G167600--Sobic001G081450 Sobic002G112500 Sobic002G112500 Sobic007G167600--Sobic002G112500 Sobic004G223700 Sobic004G223700 Sobic007G167600--Sobic004G223700 Sobic001G406200 Sobic001G406200 Sobic008G132550--Sobic001G406200 Sobic008G132550--Sobic006G128150 Sobic003G267600 Sobic003G267600 Sobic008G132550--Sobic003G267600 Sobic008G132550--Sobic008G082550 Sobic008G132550--Sobic009G192400 Sobic008G132550--Sobic007G206400 Sobic007G052000 Sobic007G052000 Sobic008G132550--Sobic007G052000 Sobic008G132550--Sobic001G079150 Sobic004G237900 Sobic004G237900 Sobic008G132550--Sobic004G237900 Sobic001G036400--Sobic006G128150 Sobic001G036400--Sobic002G256250 Sobic010G265400 Sobic010G265400 Sobic001G036400--Sobic010G265400 Sobic001G036400--Sobic010G155000 Sobic001G431600 Sobic001G431600 Sobic001G036400--Sobic001G431600 Sobic001G036400--Sobic001G378900 Sobic002G053300 Sobic002G053300 Sobic001G036400--Sobic002G053300 Sobic001G036400--Sobic010G028333 Sobic007G190466 Sobic007G190466 Sobic001G036400--Sobic007G190466
Octagon: transcription factors


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