Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G378900.1
Synonym
Functional annotation AP2 domain containing protein, expressed
UniProt C5X0R1
Pfam PF00847
Panther DB PTHR31241 PTHR31241:SF8
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0006355; regulation of transcription, DNA-templated GO:0003700DNA-binding transcription factor activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G18450 : Integrase-type DNA-binding superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g45110.1 : AP2 domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a030489 , Zm00025a005513
Brachypodium KQJ90021
Barley HORVU2Hr1G111510.1
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.001G378900


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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16 Sobic.010G028333 - -
17 Sobic.003G230800 - -
18 Sobic.009G192400 - -
19 Sobic.004G072300 - -
20 Sobic.001G283800 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G378900 Sobic001G378900 Sobic006G128150 Sobic006G128150 Sobic001G378900--Sobic006G128150 Sobic008G082550 Sobic008G082550 Sobic001G378900--Sobic008G082550 Sobic001G036400 Sobic001G036400 Sobic001G378900--Sobic001G036400 Sobic002G200400 Sobic002G200400 Sobic001G378900--Sobic002G200400 Sobic010G155000 Sobic010G155000 Sobic001G378900--Sobic010G155000 Sobic002G256250 Sobic002G256250 Sobic001G378900--Sobic002G256250 Sobic001G283400 Sobic001G283400 Sobic001G378900--Sobic001G283400 Sobic001G243800 Sobic001G243800 Sobic001G378900--Sobic001G243800 Sobic005G019250 Sobic005G019250 Sobic001G378900--Sobic005G019250 Sobic006G128150--Sobic001G036400 Sobic006G128150--Sobic002G256250 Sobic010G028333 Sobic010G028333 Sobic006G128150--Sobic010G028333 Sobic006G128150--Sobic008G082550 Sobic006G128150--Sobic002G200400 Sobic001G079150 Sobic001G079150 Sobic006G128150--Sobic001G079150 Sobic009G192400 Sobic009G192400 Sobic006G128150--Sobic009G192400 Sobic006G128150--Sobic001G378900 Sobic006G128150--Sobic010G155000 Sobic008G082550--Sobic001G079150 Sobic008G082550--Sobic006G128150 Sobic008G082550--Sobic002G200400 Sobic003G028700 Sobic003G028700 Sobic008G082550--Sobic003G028700 Sobic008G082550--Sobic001G378900 Sobic008G082550--Sobic010G155000 Sobic007G206400 Sobic007G206400 Sobic008G082550--Sobic007G206400 Sobic008G082550--Sobic001G283400 Sobic001G352633 Sobic001G352633 Sobic008G082550--Sobic001G352633 Sobic001G036400--Sobic006G128150 Sobic001G036400--Sobic002G256250 Sobic010G265400 Sobic010G265400 Sobic001G036400--Sobic010G265400 Sobic001G036400--Sobic010G155000 Sobic001G431600 Sobic001G431600 Sobic001G036400--Sobic001G431600 Sobic001G036400--Sobic001G378900 Sobic002G053300 Sobic002G053300 Sobic001G036400--Sobic002G053300 Sobic001G036400--Sobic010G028333 Sobic007G190466 Sobic007G190466 Sobic001G036400--Sobic007G190466 Sobic004G180950 Sobic004G180950 Sobic002G200400--Sobic004G180950 Sobic002G200400--Sobic001G283400 Sobic009G199750 Sobic009G199750 Sobic002G200400--Sobic009G199750 Sobic002G200400--Sobic010G155000 Sobic004G072300 Sobic004G072300 Sobic002G200400--Sobic004G072300 Sobic006G205300 Sobic006G205300 Sobic002G200400--Sobic006G205300 Sobic004G183701 Sobic004G183701 Sobic002G200400--Sobic004G183701 Sobic003G085533 Sobic003G085533 Sobic002G200400--Sobic003G085533 Sobic002G200400--Sobic001G352633 Sobic010G155000--Sobic004G180950 Sobic010G155000--Sobic001G283400 Sobic010G155000--Sobic009G192400 Sobic010G155000--Sobic002G200400 Sobic010G155000--Sobic009G199750 Sobic010G155000--Sobic007G206400 Sobic010G155000--Sobic002G256250 Sobic010G254401 Sobic010G254401 Sobic010G155000--Sobic010G254401 Sobic006G041200 Sobic006G041200 Sobic010G155000--Sobic006G041200 Sobic002G074900 Sobic002G074900 Sobic002G256250--Sobic002G074900 Sobic003G187600 Sobic003G187600 Sobic002G256250--Sobic003G187600 Sobic002G256250--Sobic010G028333 Sobic007G046700 Sobic007G046700 Sobic002G256250--Sobic007G046700 Sobic008G119600 Sobic008G119600 Sobic002G256250--Sobic008G119600 Sobic002G256250--Sobic006G128150 Sobic007G004400 Sobic007G004400 Sobic002G256250--Sobic007G004400 Sobic004G274300 Sobic004G274300 Sobic002G256250--Sobic004G274300 Sobic005G118500 Sobic005G118500 Sobic002G256250--Sobic005G118500 Sobic001G283400--Sobic004G180950 Sobic001G283400--Sobic002G200400 Sobic001G283400--Sobic009G199750 Sobic001G283400--Sobic010G155000 Sobic001G283400--Sobic007G206400 Sobic003G230800 Sobic003G230800 Sobic001G283400--Sobic003G230800 Sobic001G283400--Sobic009G192400 Sobic001G283400--Sobic006G041200 Sobic002G129900 Sobic002G129900 Sobic001G283400--Sobic002G129900 Sobic001G243800--Sobic008G082550 Sobic001G243800--Sobic001G378900 Sobic001G243800--Sobic003G230800 Sobic001G243800--Sobic006G128150 Sobic001G243800--Sobic003G028700 Sobic001G243800--Sobic002G200400 Sobic007G167600 Sobic007G167600 Sobic001G243800--Sobic007G167600 Sobic008G132550 Sobic008G132550 Sobic001G243800--Sobic008G132550 Sobic001G243800--Sobic001G036400 Sobic004G310350 Sobic004G310350 Sobic005G019250--Sobic004G310350 Sobic001G202450 Sobic001G202450 Sobic005G019250--Sobic001G202450 Sobic002G214000 Sobic002G214000 Sobic005G019250--Sobic002G214000 Sobic006G053550 Sobic006G053550 Sobic005G019250--Sobic006G053550 Sobic001G373850 Sobic001G373850 Sobic005G019250--Sobic001G373850 Sobic009G077000 Sobic009G077000 Sobic005G019250--Sobic009G077000 Sobic005G045250 Sobic005G045250 Sobic005G019250--Sobic005G045250 Sobic003G163000 Sobic003G163000 Sobic005G019250--Sobic003G163000 Sobic001G497400 Sobic001G497400 Sobic005G019250--Sobic001G497400
Octagon: transcription factors


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