Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G317001.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0W6R2
Pfam PF07893
Panther DB PTHR33085 PTHR33085:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g10880.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G028333 - -
2 Sobic.002G256250 - -
3 Sobic.010G154801 - -
4 Sobic.001G036400 expressed protein -
5 Sobic.010G155000 NAC domain containing protein, putative, expressed -
6 Sobic.006G128150 - -
7 Sobic.009G192400 - -
8 Sobic.003G334400 verticillium wilt disease resistance protein precursor, putative, expressed -
9 Sobic.002G074900 receptor kinase, putative, expressed -
10 Sobic.001G378900 AP2 domain containing protein, expressed -
11 Sobic.010G265400 ras-related protein, putative, expressed K07904: Ras-related protein Rab-11A
12 Sobic.002G053300 mla1, putative, expressed -
13 Sobic.003G335000 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@leucine-rich repeat family protein, putative, expressed -
14 Sobic.001G089900 leucine aminopeptidase, chloroplast precursor, putative, expressed -
15 Sobic.003G335100 leucine-rich repeat family protein, putative, expressed -
16 Sobic.004G223800 membrane-associated salt-inducible protein like, putative, expressed -
17 Sobic.001G283400 CSLD1 - cellulose synthase-like family D, expressed -
18 Sobic.010G264150 - -
19 Sobic.001G431600 lectin-like receptor kinase, putative, expressed -
20 Sobic.003G267600 potassium channel protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic002G317001 Sobic002G317001 Sobic010G028333 Sobic010G028333 Sobic002G317001--Sobic010G028333 Sobic002G256250 Sobic002G256250 Sobic002G317001--Sobic002G256250 Sobic010G154801 Sobic010G154801 Sobic002G317001--Sobic010G154801 Sobic001G036400 Sobic001G036400 Sobic002G317001--Sobic001G036400 Sobic010G155000 Sobic010G155000 Sobic002G317001--Sobic010G155000 Sobic006G128150 Sobic006G128150 Sobic002G317001--Sobic006G128150 Sobic009G192400 Sobic009G192400 Sobic002G317001--Sobic009G192400 Sobic003G334400 Sobic003G334400 Sobic002G317001--Sobic003G334400 Sobic002G074900 Sobic002G074900 Sobic002G317001--Sobic002G074900 Sobic010G028333--Sobic002G256250 Sobic001G089900 Sobic001G089900 Sobic010G028333--Sobic001G089900 Sobic010G264150 Sobic010G264150 Sobic010G028333--Sobic010G264150 Sobic010G028333--Sobic002G317001 Sobic005G118500 Sobic005G118500 Sobic010G028333--Sobic005G118500 Sobic010G028333--Sobic006G128150 Sobic007G046700 Sobic007G046700 Sobic010G028333--Sobic007G046700 Sobic007G054200 Sobic007G054200 Sobic010G028333--Sobic007G054200 Sobic010G265400 Sobic010G265400 Sobic010G028333--Sobic010G265400 Sobic002G256250--Sobic002G074900 Sobic003G187600 Sobic003G187600 Sobic002G256250--Sobic003G187600 Sobic002G256250--Sobic010G028333 Sobic002G256250--Sobic007G046700 Sobic008G119600 Sobic008G119600 Sobic002G256250--Sobic008G119600 Sobic002G256250--Sobic006G128150 Sobic007G004400 Sobic007G004400 Sobic002G256250--Sobic007G004400 Sobic004G274300 Sobic004G274300 Sobic002G256250--Sobic004G274300 Sobic002G256250--Sobic005G118500 Sobic001G406200 Sobic001G406200 Sobic010G154801--Sobic001G406200 Sobic010G154801--Sobic009G192400 Sobic009G026700 Sobic009G026700 Sobic010G154801--Sobic009G026700 Sobic001G250750 Sobic001G250750 Sobic010G154801--Sobic001G250750 Sobic010G154801--Sobic003G334400 Sobic010G154801--Sobic002G317001 Sobic008G083100 Sobic008G083100 Sobic010G154801--Sobic008G083100 Sobic010G154801--Sobic010G028333 Sobic007G182300 Sobic007G182300 Sobic010G154801--Sobic007G182300 Sobic001G036400--Sobic006G128150 Sobic001G036400--Sobic002G256250 Sobic001G036400--Sobic010G265400 Sobic001G036400--Sobic010G155000 Sobic001G431600 Sobic001G431600 Sobic001G036400--Sobic001G431600 Sobic001G378900 Sobic001G378900 Sobic001G036400--Sobic001G378900 Sobic002G053300 Sobic002G053300 Sobic001G036400--Sobic002G053300 Sobic001G036400--Sobic010G028333 Sobic007G190466 Sobic007G190466 Sobic001G036400--Sobic007G190466 Sobic004G180950 Sobic004G180950 Sobic010G155000--Sobic004G180950 Sobic001G283400 Sobic001G283400 Sobic010G155000--Sobic001G283400 Sobic010G155000--Sobic009G192400 Sobic002G200400 Sobic002G200400 Sobic010G155000--Sobic002G200400 Sobic009G199750 Sobic009G199750 Sobic010G155000--Sobic009G199750 Sobic007G206400 Sobic007G206400 Sobic010G155000--Sobic007G206400 Sobic010G155000--Sobic002G256250 Sobic010G254401 Sobic010G254401 Sobic010G155000--Sobic010G254401 Sobic006G041200 Sobic006G041200 Sobic010G155000--Sobic006G041200 Sobic006G128150--Sobic001G036400 Sobic006G128150--Sobic002G256250 Sobic006G128150--Sobic010G028333 Sobic008G082550 Sobic008G082550 Sobic006G128150--Sobic008G082550 Sobic006G128150--Sobic002G200400 Sobic001G079150 Sobic001G079150 Sobic006G128150--Sobic001G079150 Sobic006G128150--Sobic009G192400 Sobic006G128150--Sobic001G378900 Sobic006G128150--Sobic010G155000 Sobic009G192400--Sobic010G155000 Sobic003G267600 Sobic003G267600 Sobic009G192400--Sobic003G267600 Sobic009G192400--Sobic003G334400 Sobic009G192400--Sobic001G283400 Sobic009G192400--Sobic007G182300 Sobic009G192400--Sobic006G041200 Sobic009G192400--Sobic007G206400 Sobic007G203800 Sobic007G203800 Sobic009G192400--Sobic007G203800 Sobic009G192400--Sobic006G128150 Sobic002G171901 Sobic002G171901 Sobic003G334400--Sobic002G171901 Sobic003G334400--Sobic009G192400 Sobic003G335000 Sobic003G335000 Sobic003G334400--Sobic003G335000 Sobic008G085800 Sobic008G085800 Sobic003G334400--Sobic008G085800 Sobic003G334400--Sobic007G182300 Sobic003G334400--Sobic010G264150 Sobic004G084600 Sobic004G084600 Sobic003G334400--Sobic004G084600 Sobic006G072701 Sobic006G072701 Sobic003G334400--Sobic006G072701 Sobic010G163666 Sobic010G163666 Sobic003G334400--Sobic010G163666 Sobic002G074900--Sobic002G256250 Sobic002G074900--Sobic007G004400 Sobic002G074900--Sobic007G046700 Sobic008G115200 Sobic008G115200 Sobic002G074900--Sobic008G115200 Sobic003G335100 Sobic003G335100 Sobic002G074900--Sobic003G335100 Sobic002G074900--Sobic008G119600 Sobic001G340100 Sobic001G340100 Sobic002G074900--Sobic001G340100 Sobic004G133201 Sobic004G133201 Sobic002G074900--Sobic004G133201 Sobic003G169550 Sobic003G169550 Sobic002G074900--Sobic003G169550
Octagon: transcription factors


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