Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G265400.1
Synonym ATRAB-A3, RABA3, ATRABA3, Sb10g030070
Functional annotation ras-related protein, putative, expressed
UniProt C5Z1U8
Pfam PF08477
Panther DB PTHR24073 PTHR24073:SF345
NCBI CDD KOG0087; GTPase Rab11/YPT3, small G protein superfamily
KEGG Orthology K07904; Ras-related protein Rab-11A
Gene Ontology GO:0007264; small GTPase mediated signal transduction GO:0005525GTP binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G01200 : RAB GTPase homolog A3
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g50060.1 : ras-related protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a036613 , Zm00025a001034 , Zm00025a005207 , Zm00025a018479 , Zm00025a044575 , Zm00025a013755 , Zm00025a053218
Brachypodium KQK04867 , KQK17534 , PNT64397
Barley HORVU7Hr1G052840.4 , HORVU7Hr1G052840.2 , HORVU7Hr1G052840.3 , HORVU7Hr1G052840.1 , HORVU7Hr1G091490.1 , HORVU7Hr1G091490.2 , HORVU7Hr1G091490.3 , HORVU5Hr1G080990.1 , HORVU5Hr1G080990.3 , HORVU5Hr1G080990.2
Wheat TraesCS1B02G152100 , TraesCS1D02G136900 , TraesCS1D02G405900 , TraesCS5D02G321800 , TraesCS7D02G254400 , TraesCS7A02G256000 , TraesCS1A02G398400 , TraesCS1B02G426300 , TraesCS7B02G152600 , TraesCS5A02G315700 , TraesCS5B02G316300 , TraesCS1A02G131500 , TraesCS1A02G131500
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
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Gene co-expression network
sample Sobic010G265400 Sobic010G265400 Sobic001G036400 Sobic001G036400 Sobic010G265400--Sobic001G036400 Sobic001G079150 Sobic001G079150 Sobic010G265400--Sobic001G079150 Sobic009G209150 Sobic009G209150 Sobic010G265400--Sobic009G209150 Sobic006G128150 Sobic006G128150 Sobic010G265400--Sobic006G128150 Sobic010G028333 Sobic010G028333 Sobic010G265400--Sobic010G028333 Sobic001G431600 Sobic001G431600 Sobic010G265400--Sobic001G431600 Sobic002G256250 Sobic002G256250 Sobic010G265400--Sobic002G256250 Sobic002G170000 Sobic002G170000 Sobic010G265400--Sobic002G170000 Sobic005G118500 Sobic005G118500 Sobic010G265400--Sobic005G118500 Sobic001G036400--Sobic006G128150 Sobic001G036400--Sobic002G256250 Sobic001G036400--Sobic010G265400 Sobic010G155000 Sobic010G155000 Sobic001G036400--Sobic010G155000 Sobic001G036400--Sobic001G431600 Sobic001G378900 Sobic001G378900 Sobic001G036400--Sobic001G378900 Sobic002G053300 Sobic002G053300 Sobic001G036400--Sobic002G053300 Sobic001G036400--Sobic010G028333 Sobic007G190466 Sobic007G190466 Sobic001G036400--Sobic007G190466 Sobic008G082550 Sobic008G082550 Sobic001G079150--Sobic008G082550 Sobic001G079150--Sobic010G265400 Sobic001G079150--Sobic006G128150 Sobic001G352633 Sobic001G352633 Sobic001G079150--Sobic001G352633 Sobic009G192400 Sobic009G192400 Sobic001G079150--Sobic009G192400 Sobic001G079150--Sobic005G118500 Sobic001G079150--Sobic010G028333 Sobic001G079150--Sobic010G155000 Sobic002G200400 Sobic002G200400 Sobic001G079150--Sobic002G200400 Sobic009G209150--Sobic002G170000 Sobic001G089900 Sobic001G089900 Sobic009G209150--Sobic001G089900 Sobic009G209150--Sobic010G265400 Sobic009G209150--Sobic010G028333 Sobic009G209150--Sobic005G118500 Sobic009G058900 Sobic009G058900 Sobic009G209150--Sobic009G058900 Sobic003G334400 Sobic003G334400 Sobic009G209150--Sobic003G334400 Sobic010G053700 Sobic010G053700 Sobic009G209150--Sobic010G053700 Sobic009G209150--Sobic007G190466 Sobic006G128150--Sobic001G036400 Sobic006G128150--Sobic002G256250 Sobic006G128150--Sobic010G028333 Sobic006G128150--Sobic008G082550 Sobic006G128150--Sobic002G200400 Sobic006G128150--Sobic001G079150 Sobic006G128150--Sobic009G192400 Sobic006G128150--Sobic001G378900 Sobic006G128150--Sobic010G155000 Sobic010G028333--Sobic002G256250 Sobic010G028333--Sobic001G089900 Sobic010G264150 Sobic010G264150 Sobic010G028333--Sobic010G264150 Sobic002G317001 Sobic002G317001 Sobic010G028333--Sobic002G317001 Sobic010G028333--Sobic005G118500 Sobic010G028333--Sobic006G128150 Sobic007G046700 Sobic007G046700 Sobic010G028333--Sobic007G046700 Sobic007G054200 Sobic007G054200 Sobic010G028333--Sobic007G054200 Sobic010G028333--Sobic010G265400 Sobic007G004400 Sobic007G004400 Sobic001G431600--Sobic007G004400 Sobic006G223101 Sobic006G223101 Sobic001G431600--Sobic006G223101 Sobic008G119600 Sobic008G119600 Sobic001G431600--Sobic008G119600 Sobic003G335100 Sobic003G335100 Sobic001G431600--Sobic003G335100 Sobic002G074900 Sobic002G074900 Sobic001G431600--Sobic002G074900 Sobic001G431600--Sobic002G053300 Sobic001G431600--Sobic007G190466 Sobic004G138100 Sobic004G138100 Sobic001G431600--Sobic004G138100 Sobic001G431600--Sobic002G256250 Sobic002G256250--Sobic002G074900 Sobic003G187600 Sobic003G187600 Sobic002G256250--Sobic003G187600 Sobic002G256250--Sobic010G028333 Sobic002G256250--Sobic007G046700 Sobic002G256250--Sobic008G119600 Sobic002G256250--Sobic006G128150 Sobic002G256250--Sobic007G004400 Sobic004G274300 Sobic004G274300 Sobic002G256250--Sobic004G274300 Sobic002G256250--Sobic005G118500 Sobic002G170000--Sobic009G209150 Sobic002G170000--Sobic001G089900 Sobic008G156800 Sobic008G156800 Sobic002G170000--Sobic008G156800 Sobic003G123950 Sobic003G123950 Sobic002G170000--Sobic003G123950 Sobic003G396050 Sobic003G396050 Sobic002G170000--Sobic003G396050 Sobic003G112100 Sobic003G112100 Sobic002G170000--Sobic003G112100 Sobic004G143550 Sobic004G143550 Sobic002G170000--Sobic004G143550 Sobic002G170000--Sobic009G058900 Sobic002G170000--Sobic010G053700 Sobic005G118500--Sobic007G046700 Sobic005G118500--Sobic008G119600 Sobic003G394701 Sobic003G394701 Sobic005G118500--Sobic003G394701 Sobic005G118500--Sobic007G004400 Sobic003G029150 Sobic003G029150 Sobic005G118500--Sobic003G029150 Sobic005G118500--Sobic003G335100 Sobic005G118500--Sobic003G112100 Sobic006G107766 Sobic006G107766 Sobic005G118500--Sobic006G107766 Sobic005G118500--Sobic002G256250
Octagon: transcription factors


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