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Transcriptome id Sobic.001G104050.1
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UniProt A0A1Z5S5M5
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G296600 - -
2 Sobic.010G265400 ras-related protein, putative, expressed K07904: Ras-related protein Rab-11A
3 Sobic.004G357600 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@Sucrose synthase genes(PubMedID : 24456189)@sucrose synthase(PubMedID : 26616172)@Sugar synthesis(PubMedID : 27330561)@sucrose synthase, putative, expressed K00695: sucrose synthase
4 Sobic.002G411700 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@pentatricopeptide, putative, expressed -
5 Sobic.007G044350 - -
6 Sobic.004G070400 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@metallo-beta-lactamase, putative, expressed -
7 Sobic.004G249200 NADPH-dependent oxidoreductase, putative, expressed K03883: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 5
8 Sobic.001G036400 expressed protein -
9 Sobic.004G070150 - -
10 Sobic.002G317001 - -
11 Sobic.008G132550 - -
12 Sobic.005G222000 protein transporter, putative, expressed -
13 Sobic.009G209150 - -
14 Sobic.001G079150 - -
15 Sobic.010G028333 - -
16 Sobic.002G170000 - -
17 Sobic.001G089900 leucine aminopeptidase, chloroplast precursor, putative, expressed -
18 Sobic.003G267600 potassium channel protein, putative, expressed -
19 Sobic.009G192400 - -
20 Sobic.002G315450 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G104050 Sobic001G104050 Sobic001G296600 Sobic001G296600 Sobic001G104050--Sobic001G296600 Sobic010G265400 Sobic010G265400 Sobic001G104050--Sobic010G265400 Sobic004G357600 Sobic004G357600 Sobic001G104050--Sobic004G357600 Sobic002G411700 Sobic002G411700 Sobic001G104050--Sobic002G411700 Sobic007G044350 Sobic007G044350 Sobic001G104050--Sobic007G044350 Sobic004G070400 Sobic004G070400 Sobic001G104050--Sobic004G070400 Sobic004G249200 Sobic004G249200 Sobic001G104050--Sobic004G249200 Sobic001G036400 Sobic001G036400 Sobic001G104050--Sobic001G036400 Sobic004G070150 Sobic004G070150 Sobic001G104050--Sobic004G070150 Sobic001G296600--Sobic001G104050 Sobic001G296600--Sobic007G044350 Sobic004G223350 Sobic004G223350 Sobic001G296600--Sobic004G223350 Sobic001G296600--Sobic004G357600 Sobic003G267600 Sobic003G267600 Sobic001G296600--Sobic003G267600 Sobic007G173901 Sobic007G173901 Sobic001G296600--Sobic007G173901 Sobic004G205900 Sobic004G205900 Sobic001G296600--Sobic004G205900 Sobic003G276700 Sobic003G276700 Sobic001G296600--Sobic003G276700 Sobic002G008701 Sobic002G008701 Sobic001G296600--Sobic002G008701 Sobic010G265400--Sobic001G036400 Sobic001G079150 Sobic001G079150 Sobic010G265400--Sobic001G079150 Sobic009G209150 Sobic009G209150 Sobic010G265400--Sobic009G209150 Sobic006G128150 Sobic006G128150 Sobic010G265400--Sobic006G128150 Sobic010G028333 Sobic010G028333 Sobic010G265400--Sobic010G028333 Sobic001G431600 Sobic001G431600 Sobic010G265400--Sobic001G431600 Sobic002G256250 Sobic002G256250 Sobic010G265400--Sobic002G256250 Sobic002G170000 Sobic002G170000 Sobic010G265400--Sobic002G170000 Sobic005G118500 Sobic005G118500 Sobic010G265400--Sobic005G118500 Sobic004G357600--Sobic004G249200 Sobic004G357600--Sobic001G296600 Sobic004G357600--Sobic001G104050 Sobic005G222000 Sobic005G222000 Sobic004G357600--Sobic005G222000 Sobic007G174500 Sobic007G174500 Sobic004G357600--Sobic007G174500 Sobic007G174000 Sobic007G174000 Sobic004G357600--Sobic007G174000 Sobic004G138100 Sobic004G138100 Sobic004G357600--Sobic004G138100 Sobic004G357600--Sobic010G265400 Sobic009G011100 Sobic009G011100 Sobic004G357600--Sobic009G011100 Sobic006G116600 Sobic006G116600 Sobic002G411700--Sobic006G116600 Sobic003G398900 Sobic003G398900 Sobic002G411700--Sobic003G398900 Sobic002G411700--Sobic001G104050 Sobic002G411700--Sobic001G296600 Sobic010G217466 Sobic010G217466 Sobic002G411700--Sobic010G217466 Sobic002G246950 Sobic002G246950 Sobic002G411700--Sobic002G246950 Sobic002G149550 Sobic002G149550 Sobic002G411700--Sobic002G149550 Sobic002G411700--Sobic007G044350 Sobic004G060000 Sobic004G060000 Sobic002G411700--Sobic004G060000 Sobic007G044350--Sobic001G296600 Sobic007G044350--Sobic004G060000 Sobic007G044350--Sobic010G217466 Sobic007G044350--Sobic001G104050 Sobic006G108900 Sobic006G108900 Sobic007G044350--Sobic006G108900 Sobic002G262500 Sobic002G262500 Sobic007G044350--Sobic002G262500 Sobic007G044350--Sobic003G276700 Sobic006G119100 Sobic006G119100 Sobic007G044350--Sobic006G119100 Sobic007G044350--Sobic004G357600 Sobic004G070400--Sobic001G104050 Sobic004G045100 Sobic004G045100 Sobic004G070400--Sobic004G045100 Sobic004G070400--Sobic004G070150 Sobic004G070400--Sobic001G296600 Sobic004G070400--Sobic004G357600 Sobic004G139201 Sobic004G139201 Sobic004G070400--Sobic004G139201 Sobic004G070400--Sobic003G276700 Sobic004G084800 Sobic004G084800 Sobic004G070400--Sobic004G084800 Sobic004G070400--Sobic010G265400 Sobic004G249200--Sobic006G108900 Sobic004G249200--Sobic005G222000 Sobic004G249200--Sobic004G357600 Sobic004G249200--Sobic009G011100 Sobic004G249200--Sobic004G138100 Sobic002G290900 Sobic002G290900 Sobic004G249200--Sobic002G290900 Sobic004G249200--Sobic001G296600 Sobic009G011000 Sobic009G011000 Sobic004G249200--Sobic009G011000 Sobic009G011200 Sobic009G011200 Sobic004G249200--Sobic009G011200 Sobic001G036400--Sobic006G128150 Sobic001G036400--Sobic002G256250 Sobic001G036400--Sobic010G265400 Sobic010G155000 Sobic010G155000 Sobic001G036400--Sobic010G155000 Sobic001G036400--Sobic001G431600 Sobic001G378900 Sobic001G378900 Sobic001G036400--Sobic001G378900 Sobic002G053300 Sobic002G053300 Sobic001G036400--Sobic002G053300 Sobic001G036400--Sobic010G028333 Sobic007G190466 Sobic007G190466 Sobic001G036400--Sobic007G190466 Sobic010G054150 Sobic010G054150 Sobic004G070150--Sobic010G054150 Sobic004G070150--Sobic003G276700 Sobic002G107700 Sobic002G107700 Sobic004G070150--Sobic002G107700 Sobic003G399800 Sobic003G399800 Sobic004G070150--Sobic003G399800 Sobic004G237900 Sobic004G237900 Sobic004G070150--Sobic004G237900 Sobic007G137750 Sobic007G137750 Sobic004G070150--Sobic007G137750 Sobic010G084900 Sobic010G084900 Sobic004G070150--Sobic010G084900 Sobic007G052000 Sobic007G052000 Sobic004G070150--Sobic007G052000 Sobic004G070150--Sobic001G296600
Octagon: transcription factors


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