Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G028333.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0VR83
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G256250 - -
2 Sobic.001G089900 leucine aminopeptidase, chloroplast precursor, putative, expressed -
3 Sobic.010G264150 - -
4 Sobic.002G317001 - -
5 Sobic.005G118500 expressed protein -
6 Sobic.006G128150 - -
7 Sobic.007G046700 - -
8 Sobic.007G054200 harpin-induced protein 1 domain containing protein, expressed -
9 Sobic.010G265400 ras-related protein, putative, expressed K07904: Ras-related protein Rab-11A
10 Sobic.002G074900 receptor kinase, putative, expressed -
11 Sobic.003G187600 PPR repeat containing protein, expressed -
12 Sobic.003G029150 - -
13 Sobic.003G334400 verticillium wilt disease resistance protein precursor, putative, expressed -
14 Sobic.001G036400 expressed protein -
15 Sobic.003G335100 leucine-rich repeat family protein, putative, expressed -
16 Sobic.010G155000 NAC domain containing protein, putative, expressed -
17 Sobic.009G192400 - -
18 Sobic.001G079150 - -
19 Sobic.010G154801 - -
20 Sobic.008G119600 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic010G028333 Sobic010G028333 Sobic002G256250 Sobic002G256250 Sobic010G028333--Sobic002G256250 Sobic001G089900 Sobic001G089900 Sobic010G028333--Sobic001G089900 Sobic010G264150 Sobic010G264150 Sobic010G028333--Sobic010G264150 Sobic002G317001 Sobic002G317001 Sobic010G028333--Sobic002G317001 Sobic005G118500 Sobic005G118500 Sobic010G028333--Sobic005G118500 Sobic006G128150 Sobic006G128150 Sobic010G028333--Sobic006G128150 Sobic007G046700 Sobic007G046700 Sobic010G028333--Sobic007G046700 Sobic007G054200 Sobic007G054200 Sobic010G028333--Sobic007G054200 Sobic010G265400 Sobic010G265400 Sobic010G028333--Sobic010G265400 Sobic002G074900 Sobic002G074900 Sobic002G256250--Sobic002G074900 Sobic003G187600 Sobic003G187600 Sobic002G256250--Sobic003G187600 Sobic002G256250--Sobic010G028333 Sobic002G256250--Sobic007G046700 Sobic008G119600 Sobic008G119600 Sobic002G256250--Sobic008G119600 Sobic002G256250--Sobic006G128150 Sobic007G004400 Sobic007G004400 Sobic002G256250--Sobic007G004400 Sobic004G274300 Sobic004G274300 Sobic002G256250--Sobic004G274300 Sobic002G256250--Sobic005G118500 Sobic001G089900--Sobic010G028333 Sobic009G209150 Sobic009G209150 Sobic001G089900--Sobic009G209150 Sobic002G170000 Sobic002G170000 Sobic001G089900--Sobic002G170000 Sobic001G089900--Sobic005G118500 Sobic001G089900--Sobic010G264150 Sobic001G089900--Sobic007G046700 Sobic001G089900--Sobic007G054200 Sobic001G089900--Sobic010G265400 Sobic003G168700 Sobic003G168700 Sobic001G089900--Sobic003G168700 Sobic010G163666 Sobic010G163666 Sobic010G264150--Sobic010G163666 Sobic010G264150--Sobic007G046700 Sobic010G264150--Sobic007G054200 Sobic010G264150--Sobic010G028333 Sobic010G264150--Sobic002G256250 Sobic010G264150--Sobic005G118500 Sobic003G334400 Sobic003G334400 Sobic010G264150--Sobic003G334400 Sobic009G192400 Sobic009G192400 Sobic010G264150--Sobic009G192400 Sobic010G264150--Sobic002G074900 Sobic002G317001--Sobic010G028333 Sobic002G317001--Sobic002G256250 Sobic010G154801 Sobic010G154801 Sobic002G317001--Sobic010G154801 Sobic001G036400 Sobic001G036400 Sobic002G317001--Sobic001G036400 Sobic010G155000 Sobic010G155000 Sobic002G317001--Sobic010G155000 Sobic002G317001--Sobic006G128150 Sobic002G317001--Sobic009G192400 Sobic002G317001--Sobic003G334400 Sobic002G317001--Sobic002G074900 Sobic005G118500--Sobic007G046700 Sobic005G118500--Sobic008G119600 Sobic003G394701 Sobic003G394701 Sobic005G118500--Sobic003G394701 Sobic005G118500--Sobic007G004400 Sobic003G029150 Sobic003G029150 Sobic005G118500--Sobic003G029150 Sobic003G335100 Sobic003G335100 Sobic005G118500--Sobic003G335100 Sobic003G112100 Sobic003G112100 Sobic005G118500--Sobic003G112100 Sobic006G107766 Sobic006G107766 Sobic005G118500--Sobic006G107766 Sobic005G118500--Sobic002G256250 Sobic006G128150--Sobic001G036400 Sobic006G128150--Sobic002G256250 Sobic006G128150--Sobic010G028333 Sobic008G082550 Sobic008G082550 Sobic006G128150--Sobic008G082550 Sobic002G200400 Sobic002G200400 Sobic006G128150--Sobic002G200400 Sobic001G079150 Sobic001G079150 Sobic006G128150--Sobic001G079150 Sobic006G128150--Sobic009G192400 Sobic001G378900 Sobic001G378900 Sobic006G128150--Sobic001G378900 Sobic006G128150--Sobic010G155000 Sobic007G046700--Sobic003G394701 Sobic007G046700--Sobic007G054200 Sobic007G046700--Sobic003G187600 Sobic004G133201 Sobic004G133201 Sobic007G046700--Sobic004G133201 Sobic009G257000 Sobic009G257000 Sobic007G046700--Sobic009G257000 Sobic007G046700--Sobic006G107766 Sobic007G046700--Sobic005G118500 Sobic004G129400 Sobic004G129400 Sobic007G046700--Sobic004G129400 Sobic007G046700--Sobic004G274300 Sobic007G054200--Sobic007G046700 Sobic007G054200--Sobic003G394701 Sobic009G058900 Sobic009G058900 Sobic007G054200--Sobic009G058900 Sobic003G169550 Sobic003G169550 Sobic007G054200--Sobic003G169550 Sobic001G323101 Sobic001G323101 Sobic007G054200--Sobic001G323101 Sobic008G156800 Sobic008G156800 Sobic007G054200--Sobic008G156800 Sobic007G054200--Sobic004G133201 Sobic007G054200--Sobic004G274300 Sobic007G054200--Sobic003G187600 Sobic010G265400--Sobic001G036400 Sobic010G265400--Sobic001G079150 Sobic010G265400--Sobic009G209150 Sobic010G265400--Sobic006G128150 Sobic010G265400--Sobic010G028333 Sobic001G431600 Sobic001G431600 Sobic010G265400--Sobic001G431600 Sobic010G265400--Sobic002G256250 Sobic010G265400--Sobic002G170000 Sobic010G265400--Sobic005G118500
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.