Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G172800.1
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt C5X9V7
Pfam -
Panther DB PTHR33472 PTHR33472:SF4
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G75260 : oxidoreductases, acting on NADH or NADPH
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g15830.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a046512
Brachypodium PNT64405
Barley HORVU5Hr1G056380.1
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G406200 - -
2 Sobic.001G243800 transcription factor, putative, expressed -
3 Sobic.010G154801 - -
4 Sobic.003G267600 potassium channel protein, putative, expressed -
5 Sobic.001G378900 AP2 domain containing protein, expressed -
6 Sobic.008G132550 - -
7 Sobic.008G082550 - -
8 Sobic.007G167600 expressed protein -
9 Sobic.003G028700 - -
10 Sobic.003G230800 - -
11 Sobic.002G200400 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
12 Sobic.009G199750 - -
13 Sobic.006G128150 - -
14 Sobic.001G283400 CSLD1 - cellulose synthase-like family D, expressed -
15 Sobic.004G150300 - -
16 Sobic.002G317001 - -
17 Sobic.001G245100 - -
18 Sobic.004G205900 - -
19 Sobic.004G237900 no apical meristem protein, putative, expressed -
20 Sobic.009G192400 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G172800 Sobic002G172800 Sobic001G406200 Sobic001G406200 Sobic002G172800--Sobic001G406200 Sobic001G243800 Sobic001G243800 Sobic002G172800--Sobic001G243800 Sobic010G154801 Sobic010G154801 Sobic002G172800--Sobic010G154801 Sobic003G267600 Sobic003G267600 Sobic002G172800--Sobic003G267600 Sobic001G378900 Sobic001G378900 Sobic002G172800--Sobic001G378900 Sobic008G132550 Sobic008G132550 Sobic002G172800--Sobic008G132550 Sobic008G082550 Sobic008G082550 Sobic002G172800--Sobic008G082550 Sobic007G167600 Sobic007G167600 Sobic002G172800--Sobic007G167600 Sobic003G028700 Sobic003G028700 Sobic002G172800--Sobic003G028700 Sobic001G406200--Sobic010G154801 Sobic004G150300 Sobic004G150300 Sobic001G406200--Sobic004G150300 Sobic006G128150 Sobic006G128150 Sobic001G406200--Sobic006G128150 Sobic001G352633 Sobic001G352633 Sobic001G406200--Sobic001G352633 Sobic001G406200--Sobic008G132550 Sobic001G406200--Sobic008G082550 Sobic001G406200--Sobic002G172800 Sobic009G192400 Sobic009G192400 Sobic001G406200--Sobic009G192400 Sobic003G253100 Sobic003G253100 Sobic001G406200--Sobic003G253100 Sobic001G243800--Sobic008G082550 Sobic001G243800--Sobic001G378900 Sobic003G230800 Sobic003G230800 Sobic001G243800--Sobic003G230800 Sobic001G243800--Sobic006G128150 Sobic001G243800--Sobic003G028700 Sobic002G200400 Sobic002G200400 Sobic001G243800--Sobic002G200400 Sobic001G243800--Sobic007G167600 Sobic001G243800--Sobic008G132550 Sobic001G036400 Sobic001G036400 Sobic001G243800--Sobic001G036400 Sobic010G154801--Sobic001G406200 Sobic010G154801--Sobic009G192400 Sobic009G026700 Sobic009G026700 Sobic010G154801--Sobic009G026700 Sobic001G250750 Sobic001G250750 Sobic010G154801--Sobic001G250750 Sobic003G334400 Sobic003G334400 Sobic010G154801--Sobic003G334400 Sobic002G317001 Sobic002G317001 Sobic010G154801--Sobic002G317001 Sobic008G083100 Sobic008G083100 Sobic010G154801--Sobic008G083100 Sobic010G028333 Sobic010G028333 Sobic010G154801--Sobic010G028333 Sobic007G182300 Sobic007G182300 Sobic010G154801--Sobic007G182300 Sobic004G205900 Sobic004G205900 Sobic003G267600--Sobic004G205900 Sobic003G267600--Sobic009G192400 Sobic002G226200 Sobic002G226200 Sobic003G267600--Sobic002G226200 Sobic001G283400 Sobic001G283400 Sobic003G267600--Sobic001G283400 Sobic007G016200 Sobic007G016200 Sobic003G267600--Sobic007G016200 Sobic007G206400 Sobic007G206400 Sobic003G267600--Sobic007G206400 Sobic007G078900 Sobic007G078900 Sobic003G267600--Sobic007G078900 Sobic010G155000 Sobic010G155000 Sobic003G267600--Sobic010G155000 Sobic009G199750 Sobic009G199750 Sobic003G267600--Sobic009G199750 Sobic001G378900--Sobic006G128150 Sobic001G378900--Sobic008G082550 Sobic001G378900--Sobic001G036400 Sobic001G378900--Sobic002G200400 Sobic001G378900--Sobic010G155000 Sobic002G256250 Sobic002G256250 Sobic001G378900--Sobic002G256250 Sobic001G378900--Sobic001G283400 Sobic001G378900--Sobic001G243800 Sobic005G019250 Sobic005G019250 Sobic001G378900--Sobic005G019250 Sobic008G132550--Sobic001G406200 Sobic008G132550--Sobic006G128150 Sobic008G132550--Sobic003G267600 Sobic008G132550--Sobic008G082550 Sobic008G132550--Sobic009G192400 Sobic008G132550--Sobic007G206400 Sobic007G052000 Sobic007G052000 Sobic008G132550--Sobic007G052000 Sobic001G079150 Sobic001G079150 Sobic008G132550--Sobic001G079150 Sobic004G237900 Sobic004G237900 Sobic008G132550--Sobic004G237900 Sobic008G082550--Sobic001G079150 Sobic008G082550--Sobic006G128150 Sobic008G082550--Sobic002G200400 Sobic008G082550--Sobic003G028700 Sobic008G082550--Sobic001G378900 Sobic008G082550--Sobic010G155000 Sobic008G082550--Sobic007G206400 Sobic008G082550--Sobic001G283400 Sobic008G082550--Sobic001G352633 Sobic009G145200 Sobic009G145200 Sobic007G167600--Sobic009G145200 Sobic007G167600--Sobic003G028700 Sobic001G401750 Sobic001G401750 Sobic007G167600--Sobic001G401750 Sobic004G072300 Sobic004G072300 Sobic007G167600--Sobic004G072300 Sobic004G249950 Sobic004G249950 Sobic007G167600--Sobic004G249950 Sobic007G098050 Sobic007G098050 Sobic007G167600--Sobic007G098050 Sobic001G081450 Sobic001G081450 Sobic007G167600--Sobic001G081450 Sobic002G112500 Sobic002G112500 Sobic007G167600--Sobic002G112500 Sobic004G223700 Sobic004G223700 Sobic007G167600--Sobic004G223700 Sobic003G028700--Sobic007G167600 Sobic003G028700--Sobic008G082550 Sobic003G028700--Sobic007G206400 Sobic003G028700--Sobic009G199750 Sobic002G202350 Sobic002G202350 Sobic003G028700--Sobic002G202350 Sobic004G186950 Sobic004G186950 Sobic003G028700--Sobic004G186950 Sobic003G028700--Sobic002G200400 Sobic004G180950 Sobic004G180950 Sobic003G028700--Sobic004G180950 Sobic003G028700--Sobic003G230800
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