Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G205900.2
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RND5
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G267600 potassium channel protein, putative, expressed -
2 Sobic.009G192400 - -
3 Sobic.007G203800 - -
4 Sobic.007G046600 - -
5 Sobic.003G241600 - -
6 Sobic.007G089566 - -
7 Sobic.004G118000 glutamate receptor 2.6 precursor, putative, expressed K05387: glutamate receptor, ionotropic, plant
8 Sobic.009G252500 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@mitochondrial chaperone BCS1, putative, expressed K08900: mitochondrial chaperone BCS1
9 Sobic.007G206400 - -
10 Sobic.003G305250 - -
11 Sobic.001G018550 - -
12 Sobic.002G226200 - -
13 Sobic.007G016200 expressed protein -
14 Sobic.003G298000 - -
15 Sobic.007G225050 - -
16 Sobic.003G336550 - -
17 Sobic.002G231400 - -
18 Sobic.006G021100 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@L-ascorbate peroxidase (Os)(PubMedID : 27208977)@Up-reguralion under heat(PubMedID : 24916767)@Up-reguralion under combine stress of drought and heat(PubMedID : 24916767)@OsAPx3 - Peroxisomal Ascorbate Peroxidase encoding gene 5,8, expressed K00434: L-ascorbate peroxidase
19 Sobic.001G159250 - -
20 Sobic.003G334400 verticillium wilt disease resistance protein precursor, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic004G205900 Sobic004G205900 Sobic003G267600 Sobic003G267600 Sobic004G205900--Sobic003G267600 Sobic009G192400 Sobic009G192400 Sobic004G205900--Sobic009G192400 Sobic007G203800 Sobic007G203800 Sobic004G205900--Sobic007G203800 Sobic007G046600 Sobic007G046600 Sobic004G205900--Sobic007G046600 Sobic003G241600 Sobic003G241600 Sobic004G205900--Sobic003G241600 Sobic007G089566 Sobic007G089566 Sobic004G205900--Sobic007G089566 Sobic004G118000 Sobic004G118000 Sobic004G205900--Sobic004G118000 Sobic009G252500 Sobic009G252500 Sobic004G205900--Sobic009G252500 Sobic007G206400 Sobic007G206400 Sobic004G205900--Sobic007G206400 Sobic003G267600--Sobic004G205900 Sobic003G267600--Sobic009G192400 Sobic002G226200 Sobic002G226200 Sobic003G267600--Sobic002G226200 Sobic001G283400 Sobic001G283400 Sobic003G267600--Sobic001G283400 Sobic007G016200 Sobic007G016200 Sobic003G267600--Sobic007G016200 Sobic003G267600--Sobic007G206400 Sobic007G078900 Sobic007G078900 Sobic003G267600--Sobic007G078900 Sobic010G155000 Sobic010G155000 Sobic003G267600--Sobic010G155000 Sobic009G199750 Sobic009G199750 Sobic003G267600--Sobic009G199750 Sobic009G192400--Sobic010G155000 Sobic009G192400--Sobic003G267600 Sobic003G334400 Sobic003G334400 Sobic009G192400--Sobic003G334400 Sobic009G192400--Sobic001G283400 Sobic007G182300 Sobic007G182300 Sobic009G192400--Sobic007G182300 Sobic006G041200 Sobic006G041200 Sobic009G192400--Sobic006G041200 Sobic009G192400--Sobic007G206400 Sobic009G192400--Sobic007G203800 Sobic006G128150 Sobic006G128150 Sobic009G192400--Sobic006G128150 Sobic002G171901 Sobic002G171901 Sobic007G203800--Sobic002G171901 Sobic004G084600 Sobic004G084600 Sobic007G203800--Sobic004G084600 Sobic007G203800--Sobic009G192400 Sobic007G203800--Sobic006G041200 Sobic007G225050 Sobic007G225050 Sobic007G203800--Sobic007G225050 Sobic007G203800--Sobic007G206400 Sobic003G336550 Sobic003G336550 Sobic007G203800--Sobic003G336550 Sobic006G021100 Sobic006G021100 Sobic007G203800--Sobic006G021100 Sobic008G085800 Sobic008G085800 Sobic007G203800--Sobic008G085800 Sobic007G046600--Sobic009G252500 Sobic003G298000 Sobic003G298000 Sobic007G046600--Sobic003G298000 Sobic002G209450 Sobic002G209450 Sobic007G046600--Sobic002G209450 Sobic007G046600--Sobic003G241600 Sobic008G170800 Sobic008G170800 Sobic007G046600--Sobic008G170800 Sobic004G053600 Sobic004G053600 Sobic007G046600--Sobic004G053600 Sobic003G155000 Sobic003G155000 Sobic007G046600--Sobic003G155000 Sobic004G190800 Sobic004G190800 Sobic007G046600--Sobic004G190800 Sobic001G010900 Sobic001G010900 Sobic007G046600--Sobic001G010900 Sobic002G231400 Sobic002G231400 Sobic003G241600--Sobic002G231400 Sobic001G018550 Sobic001G018550 Sobic003G241600--Sobic001G018550 Sobic003G241600--Sobic009G252500 Sobic003G241600--Sobic007G046600 Sobic003G429600 Sobic003G429600 Sobic003G241600--Sobic003G429600 Sobic002G013600 Sobic002G013600 Sobic003G241600--Sobic002G013600 Sobic004G288900 Sobic004G288900 Sobic003G241600--Sobic004G288900 Sobic003G305250 Sobic003G305250 Sobic003G241600--Sobic003G305250 Sobic005G096201 Sobic005G096201 Sobic003G241600--Sobic005G096201 Sobic007G089566--Sobic006G021100 Sobic002G413700 Sobic002G413700 Sobic007G089566--Sobic002G413700 Sobic001G191500 Sobic001G191500 Sobic007G089566--Sobic001G191500 Sobic007G089566--Sobic007G203800 Sobic007G089566--Sobic002G209450 Sobic007G089566--Sobic004G205900 Sobic007G089566--Sobic003G336550 Sobic007G089566--Sobic004G118000 Sobic007G089566--Sobic004G084600 Sobic004G033650 Sobic004G033650 Sobic004G118000--Sobic004G033650 Sobic004G118000--Sobic001G191500 Sobic004G118000--Sobic002G209450 Sobic006G072701 Sobic006G072701 Sobic004G118000--Sobic006G072701 Sobic010G088100 Sobic010G088100 Sobic004G118000--Sobic010G088100 Sobic004G118000--Sobic006G041200 Sobic004G118000--Sobic002G413700 Sobic008G083100 Sobic008G083100 Sobic004G118000--Sobic008G083100 Sobic009G026700 Sobic009G026700 Sobic004G118000--Sobic009G026700 Sobic009G252500--Sobic007G046600 Sobic009G252500--Sobic003G298000 Sobic009G252500--Sobic002G209450 Sobic009G252500--Sobic003G241600 Sobic009G252500--Sobic004G190800 Sobic009G049100 Sobic009G049100 Sobic009G252500--Sobic009G049100 Sobic010G261500 Sobic010G261500 Sobic009G252500--Sobic010G261500 Sobic001G494400 Sobic001G494400 Sobic009G252500--Sobic001G494400 Sobic009G252500--Sobic008G170800 Sobic007G206400--Sobic009G199750 Sobic004G180950 Sobic004G180950 Sobic007G206400--Sobic004G180950 Sobic007G206400--Sobic001G283400 Sobic007G206400--Sobic010G155000 Sobic007G206400--Sobic009G192400 Sobic002G200400 Sobic002G200400 Sobic007G206400--Sobic002G200400 Sobic007G206400--Sobic007G203800 Sobic003G230800 Sobic003G230800 Sobic007G206400--Sobic003G230800 Sobic007G206400--Sobic003G267600
Octagon: transcription factors


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