Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G159250.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5S5S2
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G008500 - -
2 Sobic.001G018550 - -
3 Sobic.004G205900 - -
4 Sobic.010G088100 ADP-ribosylation factor 1, putative, expressed K07977: Arf/Sar family, other
5 Sobic.007G046600 - -
6 Sobic.001G485901 - -
7 Sobic.001G090700 expressed protein -
8 Sobic.002G033200 ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type, putative, expressed -
9 Sobic.002G206900 GEX2, putative, expressed -
10 Sobic.001G483001 - -
11 Sobic.009G074800 - -
12 Sobic.001G454600 expressed protein -
13 Sobic.009G026700 expressed protein -
14 Sobic.002G231400 - -
15 Sobic.003G336550 - -
16 Sobic.004G030850 - -
17 Sobic.008G078500 - -
18 Sobic.008G113200 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@pentatricopeptide, putative, expressed -
19 Sobic.003G241600 - -
20 Sobic.004G118300 OsFBD15 - F-box and FBD domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G159250 Sobic001G159250 Sobic006G008500 Sobic006G008500 Sobic001G159250--Sobic006G008500 Sobic001G018550 Sobic001G018550 Sobic001G159250--Sobic001G018550 Sobic004G205900 Sobic004G205900 Sobic001G159250--Sobic004G205900 Sobic010G088100 Sobic010G088100 Sobic001G159250--Sobic010G088100 Sobic007G046600 Sobic007G046600 Sobic001G159250--Sobic007G046600 Sobic001G485901 Sobic001G485901 Sobic001G159250--Sobic001G485901 Sobic001G090700 Sobic001G090700 Sobic001G159250--Sobic001G090700 Sobic002G033200 Sobic002G033200 Sobic001G159250--Sobic002G033200 Sobic002G206900 Sobic002G206900 Sobic001G159250--Sobic002G206900 Sobic003G241600 Sobic003G241600 Sobic006G008500--Sobic003G241600 Sobic006G008500--Sobic001G159250 Sobic006G008500--Sobic001G018550 Sobic006G008500--Sobic007G046600 Sobic003G150700 Sobic003G150700 Sobic006G008500--Sobic003G150700 Sobic005G063600 Sobic005G063600 Sobic006G008500--Sobic005G063600 Sobic002G231400 Sobic002G231400 Sobic006G008500--Sobic002G231400 Sobic002G013600 Sobic002G013600 Sobic006G008500--Sobic002G013600 Sobic004G165600 Sobic004G165600 Sobic006G008500--Sobic004G165600 Sobic001G018550--Sobic002G231400 Sobic001G018550--Sobic003G241600 Sobic004G200000 Sobic004G200000 Sobic001G018550--Sobic004G200000 Sobic005G096201 Sobic005G096201 Sobic001G018550--Sobic005G096201 Sobic003G043650 Sobic003G043650 Sobic001G018550--Sobic003G043650 Sobic002G209450 Sobic002G209450 Sobic001G018550--Sobic002G209450 Sobic005G083866 Sobic005G083866 Sobic001G018550--Sobic005G083866 Sobic007G016300 Sobic007G016300 Sobic001G018550--Sobic007G016300 Sobic002G346250 Sobic002G346250 Sobic001G018550--Sobic002G346250 Sobic003G267600 Sobic003G267600 Sobic004G205900--Sobic003G267600 Sobic009G192400 Sobic009G192400 Sobic004G205900--Sobic009G192400 Sobic007G203800 Sobic007G203800 Sobic004G205900--Sobic007G203800 Sobic004G205900--Sobic007G046600 Sobic004G205900--Sobic003G241600 Sobic007G089566 Sobic007G089566 Sobic004G205900--Sobic007G089566 Sobic004G118000 Sobic004G118000 Sobic004G205900--Sobic004G118000 Sobic009G252500 Sobic009G252500 Sobic004G205900--Sobic009G252500 Sobic007G206400 Sobic007G206400 Sobic004G205900--Sobic007G206400 Sobic004G030850 Sobic004G030850 Sobic010G088100--Sobic004G030850 Sobic004G084600 Sobic004G084600 Sobic010G088100--Sobic004G084600 Sobic003G058300 Sobic003G058300 Sobic010G088100--Sobic003G058300 Sobic010G088100--Sobic004G118000 Sobic002G171901 Sobic002G171901 Sobic010G088100--Sobic002G171901 Sobic010G088100--Sobic002G033200 Sobic009G137401 Sobic009G137401 Sobic010G088100--Sobic009G137401 Sobic003G336550 Sobic003G336550 Sobic010G088100--Sobic003G336550 Sobic001G191500 Sobic001G191500 Sobic010G088100--Sobic001G191500 Sobic007G046600--Sobic009G252500 Sobic003G298000 Sobic003G298000 Sobic007G046600--Sobic003G298000 Sobic007G046600--Sobic002G209450 Sobic007G046600--Sobic003G241600 Sobic008G170800 Sobic008G170800 Sobic007G046600--Sobic008G170800 Sobic004G053600 Sobic004G053600 Sobic007G046600--Sobic004G053600 Sobic003G155000 Sobic003G155000 Sobic007G046600--Sobic003G155000 Sobic004G190800 Sobic004G190800 Sobic007G046600--Sobic004G190800 Sobic001G010900 Sobic001G010900 Sobic007G046600--Sobic001G010900 Sobic001G485901--Sobic003G336550 Sobic007G108600 Sobic007G108600 Sobic001G485901--Sobic007G108600 Sobic001G485901--Sobic004G030850 Sobic003G313600 Sobic003G313600 Sobic001G485901--Sobic003G313600 Sobic003G253100 Sobic003G253100 Sobic001G485901--Sobic003G253100 Sobic001G485901--Sobic004G118000 Sobic008G113200 Sobic008G113200 Sobic001G485901--Sobic008G113200 Sobic009G026700 Sobic009G026700 Sobic001G485901--Sobic009G026700 Sobic004G255550 Sobic004G255550 Sobic001G485901--Sobic004G255550 Sobic001G090700--Sobic008G170800 Sobic001G454600 Sobic001G454600 Sobic001G090700--Sobic001G454600 Sobic010G042300 Sobic010G042300 Sobic001G090700--Sobic010G042300 Sobic001G038700 Sobic001G038700 Sobic001G090700--Sobic001G038700 Sobic006G279100 Sobic006G279100 Sobic001G090700--Sobic006G279100 Sobic009G026600 Sobic009G026600 Sobic001G090700--Sobic009G026600 Sobic001G460900 Sobic001G460900 Sobic001G090700--Sobic001G460900 Sobic010G012200 Sobic010G012200 Sobic001G090700--Sobic010G012200 Sobic008G190600 Sobic008G190600 Sobic001G090700--Sobic008G190600 Sobic004G118300 Sobic004G118300 Sobic002G033200--Sobic004G118300 Sobic003G329300 Sobic003G329300 Sobic002G033200--Sobic003G329300 Sobic002G033200--Sobic004G030850 Sobic004G117850 Sobic004G117850 Sobic002G033200--Sobic004G117850 Sobic006G111000 Sobic006G111000 Sobic002G033200--Sobic006G111000 Sobic002G033200--Sobic009G137401 Sobic002G033200--Sobic008G113200 Sobic002G033200--Sobic010G088100 Sobic002G033200--Sobic001G090700 Sobic002G206900--Sobic001G454600 Sobic002G206900--Sobic003G155000 Sobic003G155800 Sobic003G155800 Sobic002G206900--Sobic003G155800 Sobic003G362800 Sobic003G362800 Sobic002G206900--Sobic003G362800 Sobic003G253700 Sobic003G253700 Sobic002G206900--Sobic003G253700 Sobic001G483001 Sobic001G483001 Sobic002G206900--Sobic001G483001 Sobic001G520000 Sobic001G520000 Sobic002G206900--Sobic001G520000 Sobic002G206900--Sobic008G170800 Sobic009G252600 Sobic009G252600 Sobic002G206900--Sobic009G252600
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.