Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G008500.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PJD5
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G241600 - -
2 Sobic.001G159250 - -
3 Sobic.001G018550 - -
4 Sobic.007G046600 - -
5 Sobic.003G150700 pectinacetylesterase domain containing protein, expressed -
6 Sobic.005G063600 protein kinase domain containing protein, expressed K04733: interleukin-1 receptor-associated kinase 4
7 Sobic.002G231400 - -
8 Sobic.002G013600 expressed protein -
9 Sobic.004G165600 glycosyl hydrolases family 17, putative, expressed -
10 Sobic.003G429600 - -
11 Sobic.009G137401 - -
12 Sobic.003G155800 dnaJ homolog subfamily B member 11 precursor, putative, expressed K09517: DnaJ homolog subfamily B member 11
13 Sobic.004G342600 cytidylyltransferase domain containing protein, expressed K06210: nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase
14 Sobic.009G252500 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@mitochondrial chaperone BCS1, putative, expressed K08900: mitochondrial chaperone BCS1
15 Sobic.002G206900 GEX2, putative, expressed -
16 Sobic.001G093732 - -
17 Sobic.001G454600 expressed protein -
18 Sobic.005G096201 - -
19 Sobic.002G033200 ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type, putative, expressed -
20 Sobic.008G078500 - -


Gene co-expression network
sample Sobic006G008500 Sobic006G008500 Sobic003G241600 Sobic003G241600 Sobic006G008500--Sobic003G241600 Sobic001G159250 Sobic001G159250 Sobic006G008500--Sobic001G159250 Sobic001G018550 Sobic001G018550 Sobic006G008500--Sobic001G018550 Sobic007G046600 Sobic007G046600 Sobic006G008500--Sobic007G046600 Sobic003G150700 Sobic003G150700 Sobic006G008500--Sobic003G150700 Sobic005G063600 Sobic005G063600 Sobic006G008500--Sobic005G063600 Sobic002G231400 Sobic002G231400 Sobic006G008500--Sobic002G231400 Sobic002G013600 Sobic002G013600 Sobic006G008500--Sobic002G013600 Sobic004G165600 Sobic004G165600 Sobic006G008500--Sobic004G165600 Sobic003G241600--Sobic002G231400 Sobic003G241600--Sobic001G018550 Sobic009G252500 Sobic009G252500 Sobic003G241600--Sobic009G252500 Sobic003G241600--Sobic007G046600 Sobic003G429600 Sobic003G429600 Sobic003G241600--Sobic003G429600 Sobic003G241600--Sobic002G013600 Sobic004G288900 Sobic004G288900 Sobic003G241600--Sobic004G288900 Sobic003G305250 Sobic003G305250 Sobic003G241600--Sobic003G305250 Sobic005G096201 Sobic005G096201 Sobic003G241600--Sobic005G096201 Sobic001G159250--Sobic006G008500 Sobic001G159250--Sobic001G018550 Sobic004G205900 Sobic004G205900 Sobic001G159250--Sobic004G205900 Sobic010G088100 Sobic010G088100 Sobic001G159250--Sobic010G088100 Sobic001G159250--Sobic007G046600 Sobic001G485901 Sobic001G485901 Sobic001G159250--Sobic001G485901 Sobic001G090700 Sobic001G090700 Sobic001G159250--Sobic001G090700 Sobic002G033200 Sobic002G033200 Sobic001G159250--Sobic002G033200 Sobic002G206900 Sobic002G206900 Sobic001G159250--Sobic002G206900 Sobic001G018550--Sobic002G231400 Sobic001G018550--Sobic003G241600 Sobic004G200000 Sobic004G200000 Sobic001G018550--Sobic004G200000 Sobic001G018550--Sobic005G096201 Sobic003G043650 Sobic003G043650 Sobic001G018550--Sobic003G043650 Sobic002G209450 Sobic002G209450 Sobic001G018550--Sobic002G209450 Sobic005G083866 Sobic005G083866 Sobic001G018550--Sobic005G083866 Sobic007G016300 Sobic007G016300 Sobic001G018550--Sobic007G016300 Sobic002G346250 Sobic002G346250 Sobic001G018550--Sobic002G346250 Sobic007G046600--Sobic009G252500 Sobic003G298000 Sobic003G298000 Sobic007G046600--Sobic003G298000 Sobic007G046600--Sobic002G209450 Sobic007G046600--Sobic003G241600 Sobic008G170800 Sobic008G170800 Sobic007G046600--Sobic008G170800 Sobic004G053600 Sobic004G053600 Sobic007G046600--Sobic004G053600 Sobic003G155000 Sobic003G155000 Sobic007G046600--Sobic003G155000 Sobic004G190800 Sobic004G190800 Sobic007G046600--Sobic004G190800 Sobic001G010900 Sobic001G010900 Sobic007G046600--Sobic001G010900 Sobic009G208000 Sobic009G208000 Sobic003G150700--Sobic009G208000 Sobic003G079600 Sobic003G079600 Sobic003G150700--Sobic003G079600 Sobic004G203600 Sobic004G203600 Sobic003G150700--Sobic004G203600 Sobic009G160100 Sobic009G160100 Sobic003G150700--Sobic009G160100 Sobic006G121200 Sobic006G121200 Sobic003G150700--Sobic006G121200 Sobic006G169600 Sobic006G169600 Sobic003G150700--Sobic006G169600 Sobic003G106100 Sobic003G106100 Sobic003G150700--Sobic003G106100 Sobic001G033200 Sobic001G033200 Sobic003G150700--Sobic001G033200 Sobic003G150700--Sobic006G008500 Sobic003G155800 Sobic003G155800 Sobic005G063600--Sobic003G155800 Sobic004G231501 Sobic004G231501 Sobic005G063600--Sobic004G231501 Sobic001G028500 Sobic001G028500 Sobic005G063600--Sobic001G028500 Sobic005G063600--Sobic006G169600 Sobic005G063600--Sobic003G106100 Sobic009G199900 Sobic009G199900 Sobic005G063600--Sobic009G199900 Sobic001G060200 Sobic001G060200 Sobic005G063600--Sobic001G060200 Sobic007G061500 Sobic007G061500 Sobic005G063600--Sobic007G061500 Sobic004G314100 Sobic004G314100 Sobic005G063600--Sobic004G314100 Sobic002G231400--Sobic001G018550 Sobic002G231400--Sobic003G241600 Sobic002G231400--Sobic003G429600 Sobic002G231400--Sobic005G096201 Sobic002G231400--Sobic004G200000 Sobic002G231400--Sobic003G043650 Sobic002G231400--Sobic002G209450 Sobic010G217001 Sobic010G217001 Sobic002G231400--Sobic010G217001 Sobic002G231400--Sobic003G305250 Sobic002G013600--Sobic004G190800 Sobic004G224100 Sobic004G224100 Sobic002G013600--Sobic004G224100 Sobic002G013600--Sobic005G096201 Sobic003G139100 Sobic003G139100 Sobic002G013600--Sobic003G139100 Sobic002G013600--Sobic004G165600 Sobic001G494400 Sobic001G494400 Sobic002G013600--Sobic001G494400 Sobic002G013600--Sobic007G061500 Sobic002G013600--Sobic002G346250 Sobic002G013600--Sobic003G241600 Sobic004G342600 Sobic004G342600 Sobic004G165600--Sobic004G342600 Sobic006G152900 Sobic006G152900 Sobic004G165600--Sobic006G152900 Sobic004G165600--Sobic002G013600 Sobic010G150000 Sobic010G150000 Sobic004G165600--Sobic010G150000 Sobic004G165600--Sobic005G096201 Sobic004G165600--Sobic004G053600 Sobic002G038200 Sobic002G038200 Sobic004G165600--Sobic002G038200 Sobic004G165600--Sobic007G046600 Sobic004G165600--Sobic001G494400
Octagon: transcription factors


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