Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G429600.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6Q888
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G231400 - -
2 Sobic.003G241600 - -
3 Sobic.003G053750 - -
4 Sobic.009G137401 - -
5 Sobic.005G096201 - -
6 Sobic.002G413800 Spc97 / Spc98 family protein, putative, expressed -
7 Sobic.002G209450 - -
8 Sobic.010G150000 - -
9 Sobic.004G030850 - -
10 Sobic.003G305250 - -
11 Sobic.003G336550 - -
12 Sobic.001G018550 - -
13 Sobic.009G252500 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@mitochondrial chaperone BCS1, putative, expressed K08900: mitochondrial chaperone BCS1
14 Sobic.006G021100 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@L-ascorbate peroxidase (Os)(PubMedID : 27208977)@Up-reguralion under heat(PubMedID : 24916767)@Up-reguralion under combine stress of drought and heat(PubMedID : 24916767)@OsAPx3 - Peroxisomal Ascorbate Peroxidase encoding gene 5,8, expressed K00434: L-ascorbate peroxidase
15 Sobic.004G327200 pheophorbide a oxygenase, chloroplast precursor, putative, expressed -
16 Sobic.002G013600 expressed protein -
17 Sobic.007G078900 - -
18 Sobic.004G084600 similar to Putative uncharacterized protein(PubMedID : 29862293)@AP2 domain containing protein, expressed -
19 Sobic.010G088100 ADP-ribosylation factor 1, putative, expressed K07977: Arf/Sar family, other
20 Sobic.001G311700 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G429600 Sobic003G429600 Sobic002G231400 Sobic002G231400 Sobic003G429600--Sobic002G231400 Sobic003G241600 Sobic003G241600 Sobic003G429600--Sobic003G241600 Sobic003G053750 Sobic003G053750 Sobic003G429600--Sobic003G053750 Sobic009G137401 Sobic009G137401 Sobic003G429600--Sobic009G137401 Sobic005G096201 Sobic005G096201 Sobic003G429600--Sobic005G096201 Sobic002G413800 Sobic002G413800 Sobic003G429600--Sobic002G413800 Sobic002G209450 Sobic002G209450 Sobic003G429600--Sobic002G209450 Sobic010G150000 Sobic010G150000 Sobic003G429600--Sobic010G150000 Sobic004G030850 Sobic004G030850 Sobic003G429600--Sobic004G030850 Sobic001G018550 Sobic001G018550 Sobic002G231400--Sobic001G018550 Sobic002G231400--Sobic003G241600 Sobic002G231400--Sobic003G429600 Sobic002G231400--Sobic005G096201 Sobic004G200000 Sobic004G200000 Sobic002G231400--Sobic004G200000 Sobic003G043650 Sobic003G043650 Sobic002G231400--Sobic003G043650 Sobic002G231400--Sobic002G209450 Sobic010G217001 Sobic010G217001 Sobic002G231400--Sobic010G217001 Sobic003G305250 Sobic003G305250 Sobic002G231400--Sobic003G305250 Sobic003G241600--Sobic002G231400 Sobic003G241600--Sobic001G018550 Sobic009G252500 Sobic009G252500 Sobic003G241600--Sobic009G252500 Sobic007G046600 Sobic007G046600 Sobic003G241600--Sobic007G046600 Sobic003G241600--Sobic003G429600 Sobic002G013600 Sobic002G013600 Sobic003G241600--Sobic002G013600 Sobic004G288900 Sobic004G288900 Sobic003G241600--Sobic004G288900 Sobic003G241600--Sobic003G305250 Sobic003G241600--Sobic005G096201 Sobic003G053750--Sobic004G030850 Sobic003G053750--Sobic003G429600 Sobic003G053750--Sobic009G137401 Sobic006G021100 Sobic006G021100 Sobic003G053750--Sobic006G021100 Sobic009G176100 Sobic009G176100 Sobic003G053750--Sobic009G176100 Sobic002G033200 Sobic002G033200 Sobic003G053750--Sobic002G033200 Sobic003G329300 Sobic003G329300 Sobic003G053750--Sobic003G329300 Sobic001G191500 Sobic001G191500 Sobic003G053750--Sobic001G191500 Sobic008G113200 Sobic008G113200 Sobic003G053750--Sobic008G113200 Sobic009G137401--Sobic001G191500 Sobic001G190900 Sobic001G190900 Sobic009G137401--Sobic001G190900 Sobic009G137401--Sobic003G053750 Sobic009G137401--Sobic004G030850 Sobic009G137401--Sobic003G429600 Sobic009G137401--Sobic008G113200 Sobic001G528900 Sobic001G528900 Sobic009G137401--Sobic001G528900 Sobic008G083100 Sobic008G083100 Sobic009G137401--Sobic008G083100 Sobic006G072701 Sobic006G072701 Sobic009G137401--Sobic006G072701 Sobic005G096201--Sobic002G209450 Sobic004G224100 Sobic004G224100 Sobic005G096201--Sobic004G224100 Sobic005G096201--Sobic002G013600 Sobic003G139100 Sobic003G139100 Sobic005G096201--Sobic003G139100 Sobic005G096201--Sobic010G150000 Sobic005G096201--Sobic002G231400 Sobic004G165600 Sobic004G165600 Sobic005G096201--Sobic004G165600 Sobic001G494400 Sobic001G494400 Sobic005G096201--Sobic001G494400 Sobic005G096201--Sobic003G429600 Sobic002G413800--Sobic003G429600 Sobic004G327200 Sobic004G327200 Sobic002G413800--Sobic004G327200 Sobic002G413800--Sobic005G096201 Sobic002G413800--Sobic002G209450 Sobic002G413800--Sobic002G013600 Sobic001G312801 Sobic001G312801 Sobic002G413800--Sobic001G312801 Sobic002G413800--Sobic004G224100 Sobic008G096300 Sobic008G096300 Sobic002G413800--Sobic008G096300 Sobic009G147600 Sobic009G147600 Sobic002G413800--Sobic009G147600 Sobic002G209450--Sobic005G096201 Sobic002G209450--Sobic009G252500 Sobic003G253700 Sobic003G253700 Sobic002G209450--Sobic003G253700 Sobic003G298000 Sobic003G298000 Sobic002G209450--Sobic003G298000 Sobic002G209450--Sobic007G046600 Sobic003G155000 Sobic003G155000 Sobic002G209450--Sobic003G155000 Sobic001G520000 Sobic001G520000 Sobic002G209450--Sobic001G520000 Sobic002G209450--Sobic001G494400 Sobic002G209450--Sobic001G191500 Sobic006G152900 Sobic006G152900 Sobic010G150000--Sobic006G152900 Sobic010G150000--Sobic004G165600 Sobic010G150000--Sobic005G096201 Sobic004G342600 Sobic004G342600 Sobic010G150000--Sobic004G342600 Sobic010G150000--Sobic002G209450 Sobic002G038200 Sobic002G038200 Sobic010G150000--Sobic002G038200 Sobic009G215350 Sobic009G215350 Sobic010G150000--Sobic009G215350 Sobic007G099300 Sobic007G099300 Sobic010G150000--Sobic007G099300 Sobic010G150000--Sobic003G429600 Sobic003G336550 Sobic003G336550 Sobic004G030850--Sobic003G336550 Sobic004G084600 Sobic004G084600 Sobic004G030850--Sobic004G084600 Sobic010G088100 Sobic010G088100 Sobic004G030850--Sobic010G088100 Sobic004G030850--Sobic008G113200 Sobic004G030850--Sobic006G072701 Sobic004G255550 Sobic004G255550 Sobic004G030850--Sobic004G255550 Sobic002G171901 Sobic002G171901 Sobic004G030850--Sobic002G171901 Sobic004G030850--Sobic003G053750 Sobic006G041200 Sobic006G041200 Sobic004G030850--Sobic006G041200
Octagon: transcription factors


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