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Transcriptome id Sobic.003G053750.1
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UniProt A0A1W0VVS3
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NCBI CDD -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G030850 - -
2 Sobic.003G429600 - -
3 Sobic.009G137401 - -
4 Sobic.006G021100 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@L-ascorbate peroxidase (Os)(PubMedID : 27208977)@Up-reguralion under heat(PubMedID : 24916767)@Up-reguralion under combine stress of drought and heat(PubMedID : 24916767)@OsAPx3 - Peroxisomal Ascorbate Peroxidase encoding gene 5,8, expressed K00434: L-ascorbate peroxidase
5 Sobic.009G176100 - -
6 Sobic.002G033200 ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type, putative, expressed -
7 Sobic.003G329300 disease resistance RPP13-like protein 1, putative, expressed -
8 Sobic.001G191500 expressed protein -
9 Sobic.008G113200 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@pentatricopeptide, putative, expressed -
10 Sobic.003G336550 - -
11 Sobic.007G075600 pectinesterase, putative, expressed -
12 Sobic.010G142501 - -
13 Sobic.006G165501 - -
14 Sobic.006G215650 - -
15 Sobic.003G241600 - -
16 Sobic.001G506066 - -
17 Sobic.004G084600 similar to Putative uncharacterized protein(PubMedID : 29862293)@AP2 domain containing protein, expressed -
18 Sobic.004G118300 OsFBD15 - F-box and FBD domain containing protein, expressed -
19 Sobic.002G171901 - -
20 Sobic.002G226200 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G053750 Sobic003G053750 Sobic004G030850 Sobic004G030850 Sobic003G053750--Sobic004G030850 Sobic003G429600 Sobic003G429600 Sobic003G053750--Sobic003G429600 Sobic009G137401 Sobic009G137401 Sobic003G053750--Sobic009G137401 Sobic006G021100 Sobic006G021100 Sobic003G053750--Sobic006G021100 Sobic009G176100 Sobic009G176100 Sobic003G053750--Sobic009G176100 Sobic002G033200 Sobic002G033200 Sobic003G053750--Sobic002G033200 Sobic003G329300 Sobic003G329300 Sobic003G053750--Sobic003G329300 Sobic001G191500 Sobic001G191500 Sobic003G053750--Sobic001G191500 Sobic008G113200 Sobic008G113200 Sobic003G053750--Sobic008G113200 Sobic003G336550 Sobic003G336550 Sobic004G030850--Sobic003G336550 Sobic004G084600 Sobic004G084600 Sobic004G030850--Sobic004G084600 Sobic010G088100 Sobic010G088100 Sobic004G030850--Sobic010G088100 Sobic004G030850--Sobic008G113200 Sobic006G072701 Sobic006G072701 Sobic004G030850--Sobic006G072701 Sobic004G255550 Sobic004G255550 Sobic004G030850--Sobic004G255550 Sobic002G171901 Sobic002G171901 Sobic004G030850--Sobic002G171901 Sobic004G030850--Sobic003G053750 Sobic006G041200 Sobic006G041200 Sobic004G030850--Sobic006G041200 Sobic002G231400 Sobic002G231400 Sobic003G429600--Sobic002G231400 Sobic003G241600 Sobic003G241600 Sobic003G429600--Sobic003G241600 Sobic003G429600--Sobic003G053750 Sobic003G429600--Sobic009G137401 Sobic005G096201 Sobic005G096201 Sobic003G429600--Sobic005G096201 Sobic002G413800 Sobic002G413800 Sobic003G429600--Sobic002G413800 Sobic002G209450 Sobic002G209450 Sobic003G429600--Sobic002G209450 Sobic010G150000 Sobic010G150000 Sobic003G429600--Sobic010G150000 Sobic003G429600--Sobic004G030850 Sobic009G137401--Sobic001G191500 Sobic001G190900 Sobic001G190900 Sobic009G137401--Sobic001G190900 Sobic009G137401--Sobic003G053750 Sobic009G137401--Sobic004G030850 Sobic009G137401--Sobic003G429600 Sobic009G137401--Sobic008G113200 Sobic001G528900 Sobic001G528900 Sobic009G137401--Sobic001G528900 Sobic008G083100 Sobic008G083100 Sobic009G137401--Sobic008G083100 Sobic009G137401--Sobic006G072701 Sobic006G021100--Sobic003G336550 Sobic006G021100--Sobic006G041200 Sobic007G089566 Sobic007G089566 Sobic006G021100--Sobic007G089566 Sobic003G219300 Sobic003G219300 Sobic006G021100--Sobic003G219300 Sobic007G203800 Sobic007G203800 Sobic006G021100--Sobic007G203800 Sobic002G226200 Sobic002G226200 Sobic006G021100--Sobic002G226200 Sobic006G021100--Sobic004G030850 Sobic006G111000 Sobic006G111000 Sobic006G021100--Sobic006G111000 Sobic006G021100--Sobic004G084600 Sobic008G085800 Sobic008G085800 Sobic009G176100--Sobic008G085800 Sobic009G176100--Sobic006G111000 Sobic007G096833 Sobic007G096833 Sobic009G176100--Sobic007G096833 Sobic009G176100--Sobic003G329300 Sobic009G176100--Sobic002G171901 Sobic008G100900 Sobic008G100900 Sobic009G176100--Sobic008G100900 Sobic007G174500 Sobic007G174500 Sobic009G176100--Sobic007G174500 Sobic004G117850 Sobic004G117850 Sobic009G176100--Sobic004G117850 Sobic010G142501 Sobic010G142501 Sobic009G176100--Sobic010G142501 Sobic004G118300 Sobic004G118300 Sobic002G033200--Sobic004G118300 Sobic002G033200--Sobic003G329300 Sobic002G033200--Sobic004G030850 Sobic002G033200--Sobic004G117850 Sobic002G033200--Sobic006G111000 Sobic002G033200--Sobic009G137401 Sobic002G033200--Sobic008G113200 Sobic002G033200--Sobic010G088100 Sobic001G090700 Sobic001G090700 Sobic002G033200--Sobic001G090700 Sobic007G137100 Sobic007G137100 Sobic003G329300--Sobic007G137100 Sobic003G329300--Sobic008G085800 Sobic010G274700 Sobic010G274700 Sobic003G329300--Sobic010G274700 Sobic003G329300--Sobic009G176100 Sobic003G329300--Sobic007G174500 Sobic003G329300--Sobic002G171901 Sobic005G182100 Sobic005G182100 Sobic003G329300--Sobic005G182100 Sobic003G358150 Sobic003G358150 Sobic003G329300--Sobic003G358150 Sobic003G329300--Sobic002G033200 Sobic008G190600 Sobic008G190600 Sobic001G191500--Sobic008G190600 Sobic008G142200 Sobic008G142200 Sobic001G191500--Sobic008G142200 Sobic001G191500--Sobic009G137401 Sobic006G157450 Sobic006G157450 Sobic001G191500--Sobic006G157450 Sobic001G191500--Sobic006G072701 Sobic001G191500--Sobic001G190900 Sobic001G191500--Sobic008G083100 Sobic004G033650 Sobic004G033650 Sobic001G191500--Sobic004G033650 Sobic009G074800 Sobic009G074800 Sobic001G191500--Sobic009G074800 Sobic008G113200--Sobic004G255550 Sobic008G113200--Sobic008G083100 Sobic008G113200--Sobic004G030850 Sobic008G113200--Sobic006G111000 Sobic008G113200--Sobic003G336550 Sobic008G113200--Sobic002G226200 Sobic008G113200--Sobic004G084600 Sobic009G192400 Sobic009G192400 Sobic008G113200--Sobic009G192400 Sobic008G113200--Sobic009G137401
Octagon: transcription factors


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