Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G506066.1,Sobic.001G506066.2
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5SBC8 , A0A1Z5SBE7
Pfam PF00320
Panther DB PTHR10071 PTHR10071:SF173
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0008270; zinc ion binding GO:0006355regulation of transcription, DNA-templated GO:0003700DNA-binding transcription factor activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G25830 : GATA transcription factor 12
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g05160.1 : GATA zinc finger domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a008505 , Zm00025a025762 , Zm00025a053408 , Zm00025a054028 , Zm00025a054029 , Zm00025a054027 , Zm00025a003323
Brachypodium KQK23690
Barley HORVU5Hr1G036330.4 , HORVU5Hr1G036330.5 , HORVU5Hr1G036330.6 , HORVU5Hr1G036330.1 , HORVU5Hr1G036330.2 , HORVU5Hr1G036330.3 , HORVU4Hr1G079070.5 , HORVU4Hr1G079070.4 , HORVU4Hr1G079070.3 , HORVU4Hr1G079070.2 , HORVU4Hr1G079070.1
Wheat TraesCS2D02G386100 , TraesCS4D02G362800 , TraesCS4A02G409600 , TraesCS2A02G388300 , TraesCS4B02G374400
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Gene co-expression network
sample Sobic001G506066 Sobic001G506066 Sobic003G053750 Sobic003G053750 Sobic001G506066--Sobic003G053750 Sobic006G140450 Sobic006G140450 Sobic001G506066--Sobic006G140450 Sobic009G252600 Sobic009G252600 Sobic001G506066--Sobic009G252600 Sobic007G075600 Sobic007G075600 Sobic001G506066--Sobic007G075600 Sobic002G413800 Sobic002G413800 Sobic001G506066--Sobic002G413800 Sobic001G093732 Sobic001G093732 Sobic001G506066--Sobic001G093732 Sobic005G182100 Sobic005G182100 Sobic001G506066--Sobic005G182100 Sobic006G280250 Sobic006G280250 Sobic001G506066--Sobic006G280250 Sobic010G201444 Sobic010G201444 Sobic001G506066--Sobic010G201444 Sobic004G030850 Sobic004G030850 Sobic003G053750--Sobic004G030850 Sobic003G429600 Sobic003G429600 Sobic003G053750--Sobic003G429600 Sobic009G137401 Sobic009G137401 Sobic003G053750--Sobic009G137401 Sobic006G021100 Sobic006G021100 Sobic003G053750--Sobic006G021100 Sobic009G176100 Sobic009G176100 Sobic003G053750--Sobic009G176100 Sobic002G033200 Sobic002G033200 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Octagon: transcription factors


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