Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G234800.1
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6QD26
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g10500.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.002G234800


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G181000 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
2 Sobic.006G111400 nodulation receptor kinase precursor, putative, expressed K04730: interleukin-1 receptor-associated kinase 1
3 Sobic.009G223900 protein binding protein, putative, expressed -
4 Sobic.008G103400 universal stress protein domain containing protein, putative, expressed -
5 Sobic.003G251900 expressed protein -
6 Sobic.002G110600 regulatory protein, putative, expressed -
7 Sobic.002G001500 pentatricopeptide containing protein, putative, expressed -
8 Sobic.006G169600 expressed protein -
9 Sobic.003G155800 dnaJ homolog subfamily B member 11 precursor, putative, expressed K09517: DnaJ homolog subfamily B member 11
10 Sobic.003G362800 - -
11 Sobic.008G192900 -(PubMedID : 29751546)@sodium/hydrogen exchanger 7, putative, expressed -
12 Sobic.006G109000 integral membrane protein, putative, expressed -
13 Sobic.002G398600 cytochrome P450 72A1, putative, expressed K15639: CYP734A1, PHYB activation tagged suppressor 1
14 Sobic.009G252600 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@mitochondrial chaperone BCS1, putative, expressed K08900: mitochondrial chaperone BCS1
15 Sobic.009G160100 "Expressed in drought, salt and oxidative stress"(PubMedID : 29862293)@amino acid kinase, putative, expressed K12657: ALDH18A1, delta-1-pyrroline-5-carboxylate synthetase
16 Sobic.001G503700 DUF677 domain containing protein, putative, expressed -
17 Sobic.001G191300 bile acid sodium symporter family protein, putative, expressed K03453: bile acid:Na+ symporter, BASS family
18 Sobic.009G183650 - -
19 Sobic.006G140450 - -
20 Sobic.003G149400 lipase, putative, expressed -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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