Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G304000.1
Synonym Sb03g035260
Functional annotation peptide transporter PTR2, putative, expressed
UniProt C5XKU2
Pfam PF00854
Panther DB PTHR11654 PTHR11654:SF111
NCBI CDD KOG1237; H+/oligopeptide symporter
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0016020; membrane GO:0006810transport GO:0005215transporter activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G52190 : Major facilitator superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g55600.1 : peptide transporter PTR2, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a027463
Brachypodium KQK09861
Barley HORVU3Hr1G073520.4 , HORVU3Hr1G073520.2 , HORVU3Hr1G073520.3
Wheat TraesCS3A02G304500 , TraesCS3B02G332000 , TraesCS3D02G297400
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.003G304000


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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Gene co-expression network
sample Sobic003G304000 Sobic003G304000 Sobic001G334400 Sobic001G334400 Sobic003G304000--Sobic001G334400 Sobic004G218400 Sobic004G218400 Sobic003G304000--Sobic004G218400 Sobic002G274000 Sobic002G274000 Sobic003G304000--Sobic002G274000 Sobic003G001650 Sobic003G001650 Sobic003G304000--Sobic003G001650 Sobic003G067600 Sobic003G067600 Sobic003G304000--Sobic003G067600 Sobic006G268100 Sobic006G268100 Sobic003G304000--Sobic006G268100 Sobic010G042300 Sobic010G042300 Sobic003G304000--Sobic010G042300 Sobic009G183650 Sobic009G183650 Sobic003G304000--Sobic009G183650 Sobic002G127300 Sobic002G127300 Sobic003G304000--Sobic002G127300 Sobic001G334400--Sobic009G183650 Sobic001G334400--Sobic002G274000 Sobic009G088300 Sobic009G088300 Sobic001G334400--Sobic009G088300 Sobic001G424650 Sobic001G424650 Sobic001G334400--Sobic001G424650 Sobic001G334400--Sobic004G218400 Sobic001G334400--Sobic006G268100 Sobic002G398600 Sobic002G398600 Sobic001G334400--Sobic002G398600 Sobic004G072201 Sobic004G072201 Sobic001G334400--Sobic004G072201 Sobic006G255200 Sobic006G255200 Sobic001G334400--Sobic006G255200 Sobic002G309300 Sobic002G309300 Sobic004G218400--Sobic002G309300 Sobic001G038700 Sobic001G038700 Sobic004G218400--Sobic001G038700 Sobic004G218400--Sobic006G268100 Sobic001G370800 Sobic001G370800 Sobic004G218400--Sobic001G370800 Sobic004G218400--Sobic006G255200 Sobic004G218400--Sobic003G001650 Sobic004G218400--Sobic002G274000 Sobic004G218400--Sobic003G067600 Sobic004G218400--Sobic004G072201 Sobic002G274000--Sobic004G218400 Sobic002G274000--Sobic001G334400 Sobic002G274000--Sobic006G268100 Sobic002G274000--Sobic003G067600 Sobic002G274000--Sobic003G001650 Sobic004G173200 Sobic004G173200 Sobic002G274000--Sobic004G173200 Sobic005G110553 Sobic005G110553 Sobic002G274000--Sobic005G110553 Sobic002G274000--Sobic002G309300 Sobic002G274000--Sobic001G370800 Sobic003G362800 Sobic003G362800 Sobic003G001650--Sobic003G362800 Sobic003G001650--Sobic004G218400 Sobic008G170800 Sobic008G170800 Sobic003G001650--Sobic008G170800 Sobic003G001650--Sobic010G042300 Sobic001G454600 Sobic001G454600 Sobic003G001650--Sobic001G454600 Sobic002G001500 Sobic002G001500 Sobic003G001650--Sobic002G001500 Sobic008G192900 Sobic008G192900 Sobic003G001650--Sobic008G192900 Sobic008G103400 Sobic008G103400 Sobic003G001650--Sobic008G103400 Sobic004G144300 Sobic004G144300 Sobic003G001650--Sobic004G144300 Sobic003G067600--Sobic004G218400 Sobic002G228300 Sobic002G228300 Sobic003G067600--Sobic002G228300 Sobic003G067600--Sobic002G274000 Sobic006G138300 Sobic006G138300 Sobic003G067600--Sobic006G138300 Sobic003G067600--Sobic001G370800 Sobic003G067600--Sobic001G038700 Sobic003G067600--Sobic001G334400 Sobic003G067600--Sobic006G268100 Sobic003G067600--Sobic003G304000 Sobic006G268100--Sobic004G218400 Sobic006G268100--Sobic002G309300 Sobic006G268100--Sobic005G110553 Sobic006G268100--Sobic002G274000 Sobic006G268100--Sobic001G334400 Sobic006G268100--Sobic004G072201 Sobic006G268100--Sobic010G042300 Sobic001G383200 Sobic001G383200 Sobic006G268100--Sobic001G383200 Sobic006G268100--Sobic006G255200 Sobic006G279100 Sobic006G279100 Sobic010G042300--Sobic006G279100 Sobic001G090700 Sobic001G090700 Sobic010G042300--Sobic001G090700 Sobic010G042300--Sobic008G170800 Sobic010G042300--Sobic008G103400 Sobic010G042300--Sobic003G001650 Sobic002G208700 Sobic002G208700 Sobic010G042300--Sobic002G208700 Sobic010G042300--Sobic001G383200 Sobic010G042300--Sobic004G072201 Sobic010G042300--Sobic002G309300 Sobic009G183650--Sobic001G334400 Sobic009G183650--Sobic001G424650 Sobic002G110600 Sobic002G110600 Sobic009G183650--Sobic002G110600 Sobic009G183650--Sobic005G110553 Sobic010G019500 Sobic010G019500 Sobic009G183650--Sobic010G019500 Sobic009G183650--Sobic004G072201 Sobic004G068600 Sobic004G068600 Sobic009G183650--Sobic004G068600 Sobic009G183650--Sobic009G088300 Sobic009G183650--Sobic002G274000 Sobic002G127300--Sobic006G255200 Sobic002G127300--Sobic002G309300 Sobic010G129100 Sobic010G129100 Sobic002G127300--Sobic010G129100 Sobic002G127300--Sobic004G218400 Sobic002G127300--Sobic001G038700 Sobic001G442000 Sobic001G442000 Sobic002G127300--Sobic001G442000 Sobic002G127300--Sobic001G370800 Sobic001G261452 Sobic001G261452 Sobic002G127300--Sobic001G261452 Sobic002G127300--Sobic009G088300
Octagon: transcription factors


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