Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G137750.2,Sobic.007G137750.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5R9U0 , A0A1Z5RAC2
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G054150 - -
2 Sobic.002G290800 no apical meristem protein, putative, expressed -
3 Sobic.006G165501 - -
4 Sobic.003G001650 - -
5 Sobic.006G248450 - -
6 Sobic.004G070150 - -
7 Sobic.006G268100 UDP-glucoronosyl/UDP-glucosyl transferase, putative, expressed -
8 Sobic.010G042300 DTA2, putative, expressed -
9 Sobic.003G304000 peptide transporter PTR2, putative, expressed -
10 Sobic.007G194000 microtubule associated protein, putative, expressed K16732: protein regulator of cytokinesis 1
11 Sobic.004G218400 - -
12 Sobic.003G276400 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@Alpha-amylase isozime 2 precursor AMY3 (Os)(PubMedID : 27208977)@alpha-amylase precursor, putative, expressed -
13 Sobic.008G170800 OsWAK126 - OsWAK receptor-like protein kinase, expressed -
14 Sobic.002G309300 beta-expansin precursor, putative, expressed -
15 Sobic.009G181000 - -
16 Sobic.001G090700 expressed protein -
17 Sobic.007G052000 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed K10666: E3 ubiquitin-protein ligase RNF5
18 Sobic.003G399800 Homologous to EPF/EPFL genes in Arabidopsis. Modelling of protein structure.(PubMedID : 23755192)@expressed protein -
19 Sobic.005G182100 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
20 Sobic.009G192933 - -


Gene co-expression network
sample Sobic007G137750 Sobic007G137750 Sobic010G054150 Sobic010G054150 Sobic007G137750--Sobic010G054150 Sobic002G290800 Sobic002G290800 Sobic007G137750--Sobic002G290800 Sobic006G165501 Sobic006G165501 Sobic007G137750--Sobic006G165501 Sobic003G001650 Sobic003G001650 Sobic007G137750--Sobic003G001650 Sobic006G248450 Sobic006G248450 Sobic007G137750--Sobic006G248450 Sobic004G070150 Sobic004G070150 Sobic007G137750--Sobic004G070150 Sobic006G268100 Sobic006G268100 Sobic007G137750--Sobic006G268100 Sobic010G042300 Sobic010G042300 Sobic007G137750--Sobic010G042300 Sobic003G304000 Sobic003G304000 Sobic007G137750--Sobic003G304000 Sobic010G054150--Sobic006G248450 Sobic007G052000 Sobic007G052000 Sobic010G054150--Sobic007G052000 Sobic010G054150--Sobic004G070150 Sobic010G274700 Sobic010G274700 Sobic010G054150--Sobic010G274700 Sobic002G226200 Sobic002G226200 Sobic010G054150--Sobic002G226200 Sobic007G016200 Sobic007G016200 Sobic010G054150--Sobic007G016200 Sobic010G054150--Sobic007G137750 Sobic005G182100 Sobic005G182100 Sobic010G054150--Sobic005G182100 Sobic002G208500 Sobic002G208500 Sobic010G054150--Sobic002G208500 Sobic002G290800--Sobic007G137750 Sobic002G290800--Sobic010G054150 Sobic002G290800--Sobic004G070150 Sobic007G194000 Sobic007G194000 Sobic002G290800--Sobic007G194000 Sobic002G290800--Sobic006G248450 Sobic002G290800--Sobic006G165501 Sobic002G290800--Sobic005G182100 Sobic002G290800--Sobic007G052000 Sobic002G208301 Sobic002G208301 Sobic002G290800--Sobic002G208301 Sobic002G086900 Sobic002G086900 Sobic006G165501--Sobic002G086900 Sobic001G187900 Sobic001G187900 Sobic006G165501--Sobic001G187900 Sobic006G165501--Sobic010G042300 Sobic005G014400 Sobic005G014400 Sobic006G165501--Sobic005G014400 Sobic003G053750 Sobic003G053750 Sobic006G165501--Sobic003G053750 Sobic008G170800 Sobic008G170800 Sobic006G165501--Sobic008G170800 Sobic001G093732 Sobic001G093732 Sobic006G165501--Sobic001G093732 Sobic006G165501--Sobic007G137750 Sobic006G165501--Sobic005G182100 Sobic003G362800 Sobic003G362800 Sobic003G001650--Sobic003G362800 Sobic004G218400 Sobic004G218400 Sobic003G001650--Sobic004G218400 Sobic003G001650--Sobic008G170800 Sobic003G001650--Sobic010G042300 Sobic001G454600 Sobic001G454600 Sobic003G001650--Sobic001G454600 Sobic002G001500 Sobic002G001500 Sobic003G001650--Sobic002G001500 Sobic008G192900 Sobic008G192900 Sobic003G001650--Sobic008G192900 Sobic008G103400 Sobic008G103400 Sobic003G001650--Sobic008G103400 Sobic004G144300 Sobic004G144300 Sobic003G001650--Sobic004G144300 Sobic006G248450--Sobic010G054150 Sobic006G248450--Sobic010G274700 Sobic003G335000 Sobic003G335000 Sobic006G248450--Sobic003G335000 Sobic003G312800 Sobic003G312800 Sobic006G248450--Sobic003G312800 Sobic001G431600 Sobic001G431600 Sobic006G248450--Sobic001G431600 Sobic002G297100 Sobic002G297100 Sobic006G248450--Sobic002G297100 Sobic002G398300 Sobic002G398300 Sobic006G248450--Sobic002G398300 Sobic006G248450--Sobic007G052000 Sobic003G329300 Sobic003G329300 Sobic006G248450--Sobic003G329300 Sobic004G070150--Sobic010G054150 Sobic003G276700 Sobic003G276700 Sobic004G070150--Sobic003G276700 Sobic002G107700 Sobic002G107700 Sobic004G070150--Sobic002G107700 Sobic003G399800 Sobic003G399800 Sobic004G070150--Sobic003G399800 Sobic004G237900 Sobic004G237900 Sobic004G070150--Sobic004G237900 Sobic004G070150--Sobic007G137750 Sobic010G084900 Sobic010G084900 Sobic004G070150--Sobic010G084900 Sobic004G070150--Sobic007G052000 Sobic001G296600 Sobic001G296600 Sobic004G070150--Sobic001G296600 Sobic006G268100--Sobic004G218400 Sobic002G309300 Sobic002G309300 Sobic006G268100--Sobic002G309300 Sobic005G110553 Sobic005G110553 Sobic006G268100--Sobic005G110553 Sobic002G274000 Sobic002G274000 Sobic006G268100--Sobic002G274000 Sobic001G334400 Sobic001G334400 Sobic006G268100--Sobic001G334400 Sobic004G072201 Sobic004G072201 Sobic006G268100--Sobic004G072201 Sobic006G268100--Sobic010G042300 Sobic001G383200 Sobic001G383200 Sobic006G268100--Sobic001G383200 Sobic006G255200 Sobic006G255200 Sobic006G268100--Sobic006G255200 Sobic006G279100 Sobic006G279100 Sobic010G042300--Sobic006G279100 Sobic001G090700 Sobic001G090700 Sobic010G042300--Sobic001G090700 Sobic010G042300--Sobic008G170800 Sobic010G042300--Sobic008G103400 Sobic010G042300--Sobic003G001650 Sobic002G208700 Sobic002G208700 Sobic010G042300--Sobic002G208700 Sobic010G042300--Sobic001G383200 Sobic010G042300--Sobic004G072201 Sobic010G042300--Sobic002G309300 Sobic003G304000--Sobic001G334400 Sobic003G304000--Sobic004G218400 Sobic003G304000--Sobic002G274000 Sobic003G304000--Sobic003G001650 Sobic003G067600 Sobic003G067600 Sobic003G304000--Sobic003G067600 Sobic003G304000--Sobic006G268100 Sobic003G304000--Sobic010G042300 Sobic009G183650 Sobic009G183650 Sobic003G304000--Sobic009G183650 Sobic002G127300 Sobic002G127300 Sobic003G304000--Sobic002G127300
Octagon: transcription factors


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