Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G399800.2,Sobic.003G399800.1
Synonym STOMAGEN, SbEPFL9, EPFL9, epidermal patterning factor/EPF-like, Sb03g043620
Functional annotation Homologous to EPF/EPFL genes in Arabidopsis. Modelling of protein structure. (PubMedID : 23755192)
expressed protein
UniProt C5XG62 , A0A1W0W131
Pfam PF16851
Panther DB PTHR37239 PTHR37239:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G12970 : stomagen
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g68598.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a039361 , Zm00025a026317
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G237900 no apical meristem protein, putative, expressed -
2 Sobic.004G258450 - -
3 Sobic.001G245100 - -
4 Sobic.009G049100 - -
5 Sobic.002G107700 - -
6 Sobic.004G070150 - -
7 Sobic.007G052000 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed K10666: E3 ubiquitin-protein ligase RNF5
8 Sobic.003G298000 - -
9 Sobic.003G336300 C2 domain containing protein, putative, expressed -
10 Sobic.008G132550 - -
11 Sobic.002G208301 - K05387: glutamate receptor, ionotropic, plant
12 Sobic.001G385132 - -
13 Sobic.010G184201 - -
14 Sobic.001G460150 - -
15 Sobic.010G054150 - -
16 Sobic.007G016200 expressed protein -
17 Sobic.006G165501 - -
18 Sobic.004G144300 - -
19 Sobic.009G252500 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@mitochondrial chaperone BCS1, putative, expressed K08900: mitochondrial chaperone BCS1
20 Sobic.008G170800 OsWAK126 - OsWAK receptor-like protein kinase, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic003G399800 Sobic003G399800 Sobic004G237900 Sobic004G237900 Sobic003G399800--Sobic004G237900 Sobic004G258450 Sobic004G258450 Sobic003G399800--Sobic004G258450 Sobic001G245100 Sobic001G245100 Sobic003G399800--Sobic001G245100 Sobic009G049100 Sobic009G049100 Sobic003G399800--Sobic009G049100 Sobic002G107700 Sobic002G107700 Sobic003G399800--Sobic002G107700 Sobic004G070150 Sobic004G070150 Sobic003G399800--Sobic004G070150 Sobic007G052000 Sobic007G052000 Sobic003G399800--Sobic007G052000 Sobic003G298000 Sobic003G298000 Sobic003G399800--Sobic003G298000 Sobic003G336300 Sobic003G336300 Sobic003G399800--Sobic003G336300 Sobic004G237900--Sobic003G399800 Sobic004G237900--Sobic004G258450 Sobic004G237900--Sobic001G245100 Sobic004G237900--Sobic002G107700 Sobic008G132550 Sobic008G132550 Sobic004G237900--Sobic008G132550 Sobic010G184201 Sobic010G184201 Sobic004G237900--Sobic010G184201 Sobic004G237900--Sobic004G070150 Sobic004G237900--Sobic009G049100 Sobic001G385132 Sobic001G385132 Sobic004G237900--Sobic001G385132 Sobic004G258450--Sobic004G237900 Sobic004G258450--Sobic003G399800 Sobic004G258450--Sobic003G336300 Sobic001G460150 Sobic001G460150 Sobic004G258450--Sobic001G460150 Sobic004G258450--Sobic009G049100 Sobic004G258450--Sobic003G298000 Sobic002G429200 Sobic002G429200 Sobic004G258450--Sobic002G429200 Sobic004G144300 Sobic004G144300 Sobic004G258450--Sobic004G144300 Sobic004G258450--Sobic004G070150 Sobic001G245100--Sobic007G052000 Sobic006G157450 Sobic006G157450 Sobic001G245100--Sobic006G157450 Sobic001G245100--Sobic003G399800 Sobic001G245100--Sobic004G237900 Sobic005G228650 Sobic005G228650 Sobic001G245100--Sobic005G228650 Sobic008G190600 Sobic008G190600 Sobic001G245100--Sobic008G190600 Sobic006G213350 Sobic006G213350 Sobic001G245100--Sobic006G213350 Sobic008G170800 Sobic008G170800 Sobic001G245100--Sobic008G170800 Sobic001G483001 Sobic001G483001 Sobic001G245100--Sobic001G483001 Sobic008G024700 Sobic008G024700 Sobic009G049100--Sobic008G024700 Sobic009G049100--Sobic001G460150 Sobic009G049100--Sobic003G336300 Sobic004G190800 Sobic004G190800 Sobic009G049100--Sobic004G190800 Sobic009G049100--Sobic004G144300 Sobic009G252500 Sobic009G252500 Sobic009G049100--Sobic009G252500 Sobic009G049100--Sobic003G298000 Sobic004G310400 Sobic004G310400 Sobic009G049100--Sobic004G310400 Sobic007G046600 Sobic007G046600 Sobic009G049100--Sobic007G046600 Sobic002G107700--Sobic010G184201 Sobic002G107700--Sobic004G237900 Sobic002G107700--Sobic004G070150 Sobic002G107700--Sobic003G399800 Sobic002G107700--Sobic001G385132 Sobic002G315450 Sobic002G315450 Sobic002G107700--Sobic002G315450 Sobic002G208301 Sobic002G208301 Sobic002G107700--Sobic002G208301 Sobic007G038200 Sobic007G038200 Sobic002G107700--Sobic007G038200 Sobic003G276700 Sobic003G276700 Sobic002G107700--Sobic003G276700 Sobic010G054150 Sobic010G054150 Sobic004G070150--Sobic010G054150 Sobic004G070150--Sobic003G276700 Sobic004G070150--Sobic002G107700 Sobic004G070150--Sobic003G399800 Sobic004G070150--Sobic004G237900 Sobic007G137750 Sobic007G137750 Sobic004G070150--Sobic007G137750 Sobic010G084900 Sobic010G084900 Sobic004G070150--Sobic010G084900 Sobic004G070150--Sobic007G052000 Sobic001G296600 Sobic001G296600 Sobic004G070150--Sobic001G296600 Sobic007G052000--Sobic010G054150 Sobic007G052000--Sobic001G245100 Sobic003G335000 Sobic003G335000 Sobic007G052000--Sobic003G335000 Sobic009G186300 Sobic009G186300 Sobic007G052000--Sobic009G186300 Sobic007G052000--Sobic008G170800 Sobic002G309300 Sobic002G309300 Sobic007G052000--Sobic002G309300 Sobic006G248450 Sobic006G248450 Sobic007G052000--Sobic006G248450 Sobic008G142200 Sobic008G142200 Sobic007G052000--Sobic008G142200 Sobic001G191500 Sobic001G191500 Sobic007G052000--Sobic001G191500 Sobic003G298000--Sobic009G252500 Sobic001G494400 Sobic001G494400 Sobic003G298000--Sobic001G494400 Sobic003G298000--Sobic007G046600 Sobic002G209450 Sobic002G209450 Sobic003G298000--Sobic002G209450 Sobic001G010900 Sobic001G010900 Sobic003G298000--Sobic001G010900 Sobic003G298000--Sobic009G049100 Sobic003G298000--Sobic004G144300 Sobic003G298000--Sobic004G310400 Sobic001G520000 Sobic001G520000 Sobic003G298000--Sobic001G520000 Sobic003G336300--Sobic009G049100 Sobic003G336300--Sobic004G258450 Sobic003G336300--Sobic001G460150 Sobic003G336300--Sobic004G310400 Sobic003G336300--Sobic004G144300 Sobic003G336300--Sobic008G024700 Sobic006G121200 Sobic006G121200 Sobic003G336300--Sobic006G121200 Sobic003G336300--Sobic003G298000 Sobic003G336300--Sobic003G399800
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