Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G184201.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0VTS9
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G107700 - -
2 Sobic.004G237900 no apical meristem protein, putative, expressed -
3 Sobic.003G399800 Homologous to EPF/EPFL genes in Arabidopsis. Modelling of protein structure.(PubMedID : 23755192)@expressed protein -
4 Sobic.001G385132 - -
5 Sobic.002G315450 - -
6 Sobic.001G494950 - -
7 Sobic.004G070150 - -
8 Sobic.004G258450 - -
9 Sobic.002G208301 - K05387: glutamate receptor, ionotropic, plant
10 Sobic.004G051800 - -
11 Sobic.001G065400 - -
12 Sobic.002G427201 - -
13 Sobic.009G235100 GTP-binding protein, putative, expressed K03595: era, GTPase
14 Sobic.003G336300 C2 domain containing protein, putative, expressed -
15 Sobic.001G396550 - -
16 Sobic.002G262500 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@osFTL4 FT-Like4 homologous to Flowering Locus T gene@ contains Pfam profile PF01161: Phosphatidylethanolamine-binding protein, expressed K16223: protein FLOWERING LOCUS T
17 Sobic.006G119100 expressed protein -
18 Sobic.009G049100 - -
19 Sobic.002G189350 - -
20 Sobic.007G044350 - -


Gene co-expression network
sample Sobic010G184201 Sobic010G184201 Sobic002G107700 Sobic002G107700 Sobic010G184201--Sobic002G107700 Sobic004G237900 Sobic004G237900 Sobic010G184201--Sobic004G237900 Sobic003G399800 Sobic003G399800 Sobic010G184201--Sobic003G399800 Sobic001G385132 Sobic001G385132 Sobic010G184201--Sobic001G385132 Sobic002G315450 Sobic002G315450 Sobic010G184201--Sobic002G315450 Sobic001G494950 Sobic001G494950 Sobic010G184201--Sobic001G494950 Sobic004G070150 Sobic004G070150 Sobic010G184201--Sobic004G070150 Sobic004G258450 Sobic004G258450 Sobic010G184201--Sobic004G258450 Sobic002G208301 Sobic002G208301 Sobic010G184201--Sobic002G208301 Sobic002G107700--Sobic010G184201 Sobic002G107700--Sobic004G237900 Sobic002G107700--Sobic004G070150 Sobic002G107700--Sobic003G399800 Sobic002G107700--Sobic001G385132 Sobic002G107700--Sobic002G315450 Sobic002G107700--Sobic002G208301 Sobic007G038200 Sobic007G038200 Sobic002G107700--Sobic007G038200 Sobic003G276700 Sobic003G276700 Sobic002G107700--Sobic003G276700 Sobic004G237900--Sobic003G399800 Sobic004G237900--Sobic004G258450 Sobic001G245100 Sobic001G245100 Sobic004G237900--Sobic001G245100 Sobic004G237900--Sobic002G107700 Sobic008G132550 Sobic008G132550 Sobic004G237900--Sobic008G132550 Sobic004G237900--Sobic010G184201 Sobic004G237900--Sobic004G070150 Sobic009G049100 Sobic009G049100 Sobic004G237900--Sobic009G049100 Sobic004G237900--Sobic001G385132 Sobic003G399800--Sobic004G237900 Sobic003G399800--Sobic004G258450 Sobic003G399800--Sobic001G245100 Sobic003G399800--Sobic009G049100 Sobic003G399800--Sobic002G107700 Sobic003G399800--Sobic004G070150 Sobic007G052000 Sobic007G052000 Sobic003G399800--Sobic007G052000 Sobic003G298000 Sobic003G298000 Sobic003G399800--Sobic003G298000 Sobic003G336300 Sobic003G336300 Sobic003G399800--Sobic003G336300 Sobic001G385132--Sobic002G107700 Sobic001G385132--Sobic004G237900 Sobic001G385132--Sobic003G399800 Sobic001G385132--Sobic010G184201 Sobic001G385132--Sobic002G208301 Sobic001G285100 Sobic001G285100 Sobic001G385132--Sobic001G285100 Sobic001G385132--Sobic001G245100 Sobic001G385132--Sobic004G258450 Sobic001G187900 Sobic001G187900 Sobic001G385132--Sobic001G187900 Sobic006G119100 Sobic006G119100 Sobic002G315450--Sobic006G119100 Sobic002G202350 Sobic002G202350 Sobic002G315450--Sobic002G202350 Sobic002G315450--Sobic002G107700 Sobic002G315450--Sobic010G184201 Sobic001G065400 Sobic001G065400 Sobic002G315450--Sobic001G065400 Sobic003G028700 Sobic003G028700 Sobic002G315450--Sobic003G028700 Sobic003G068200 Sobic003G068200 Sobic002G315450--Sobic003G068200 Sobic008G165500 Sobic008G165500 Sobic002G315450--Sobic008G165500 Sobic001G104050 Sobic001G104050 Sobic002G315450--Sobic001G104050 Sobic004G051800 Sobic004G051800 Sobic001G494950--Sobic004G051800 Sobic001G494950--Sobic010G184201 Sobic002G207601 Sobic002G207601 Sobic001G494950--Sobic002G207601 Sobic005G230600 Sobic005G230600 Sobic001G494950--Sobic005G230600 Sobic001G494950--Sobic003G336300 Sobic009G235100 Sobic009G235100 Sobic001G494950--Sobic009G235100 Sobic001G494950--Sobic003G399800 Sobic001G494950--Sobic004G237900 Sobic001G494950--Sobic001G385132 Sobic010G054150 Sobic010G054150 Sobic004G070150--Sobic010G054150 Sobic004G070150--Sobic003G276700 Sobic004G070150--Sobic002G107700 Sobic004G070150--Sobic003G399800 Sobic004G070150--Sobic004G237900 Sobic007G137750 Sobic007G137750 Sobic004G070150--Sobic007G137750 Sobic010G084900 Sobic010G084900 Sobic004G070150--Sobic010G084900 Sobic004G070150--Sobic007G052000 Sobic001G296600 Sobic001G296600 Sobic004G070150--Sobic001G296600 Sobic004G258450--Sobic004G237900 Sobic004G258450--Sobic003G399800 Sobic004G258450--Sobic003G336300 Sobic001G460150 Sobic001G460150 Sobic004G258450--Sobic001G460150 Sobic004G258450--Sobic009G049100 Sobic004G258450--Sobic003G298000 Sobic002G429200 Sobic002G429200 Sobic004G258450--Sobic002G429200 Sobic004G144300 Sobic004G144300 Sobic004G258450--Sobic004G144300 Sobic004G258450--Sobic004G070150 Sobic002G208301--Sobic003G399800 Sobic002G208301--Sobic009G049100 Sobic001G227601 Sobic001G227601 Sobic002G208301--Sobic001G227601 Sobic002G208301--Sobic002G107700 Sobic003G276400 Sobic003G276400 Sobic002G208301--Sobic003G276400 Sobic006G165501 Sobic006G165501 Sobic002G208301--Sobic006G165501 Sobic002G208301--Sobic001G385132 Sobic002G208301--Sobic004G237900 Sobic002G208301--Sobic010G184201
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.