Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G119100.1
Synonym Sb06g020010
Functional annotation expressed protein
UniProt C5YAF4
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g14130.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium KQK03559
Barley -
Wheat TraesCS3A02G168300
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G038200 lectin-like receptor kinase, putative, expressed -
2 Sobic.002G380150 - -
3 Sobic.007G174701 - -
4 Sobic.002G315450 - -
5 Sobic.007G206600 - -
6 Sobic.007G044350 - -
7 Sobic.001G296600 - -
8 Sobic.008G086100 - -
9 Sobic.006G045301 - -
10 Sobic.007G081400 - -
11 Sobic.002G142350 - -
12 Sobic.004G357600 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@Sucrose synthase genes(PubMedID : 24456189)@sucrose synthase(PubMedID : 26616172)@Sugar synthesis(PubMedID : 27330561)@sucrose synthase, putative, expressed K00695: sucrose synthase
13 Sobic.003G015800 endoglucanase precursor, putative, expressed -
14 Sobic.007G203850 - -
15 Sobic.008G169500 - -
16 Sobic.002G202350 - -
17 Sobic.002G107700 - -
18 Sobic.007G225050 - -
19 Sobic.004G223350 - -
20 Sobic.007G206400 - -


Gene co-expression network
sample Sobic006G119100 Sobic006G119100 Sobic007G038200 Sobic007G038200 Sobic006G119100--Sobic007G038200 Sobic002G380150 Sobic002G380150 Sobic006G119100--Sobic002G380150 Sobic007G174701 Sobic007G174701 Sobic006G119100--Sobic007G174701 Sobic002G315450 Sobic002G315450 Sobic006G119100--Sobic002G315450 Sobic007G206600 Sobic007G206600 Sobic006G119100--Sobic007G206600 Sobic007G044350 Sobic007G044350 Sobic006G119100--Sobic007G044350 Sobic001G296600 Sobic001G296600 Sobic006G119100--Sobic001G296600 Sobic008G086100 Sobic008G086100 Sobic006G119100--Sobic008G086100 Sobic006G045301 Sobic006G045301 Sobic006G119100--Sobic006G045301 Sobic007G038200--Sobic002G380150 Sobic007G038200--Sobic006G119100 Sobic008G169500 Sobic008G169500 Sobic007G038200--Sobic008G169500 Sobic002G208900 Sobic002G208900 Sobic007G038200--Sobic002G208900 Sobic007G038100 Sobic007G038100 Sobic007G038200--Sobic007G038100 Sobic007G137100 Sobic007G137100 Sobic007G038200--Sobic007G137100 Sobic007G174500 Sobic007G174500 Sobic007G038200--Sobic007G174500 Sobic003G399200 Sobic003G399200 Sobic007G038200--Sobic003G399200 Sobic002G142350 Sobic002G142350 Sobic007G038200--Sobic002G142350 Sobic007G081400 Sobic007G081400 Sobic002G380150--Sobic007G081400 Sobic002G380150--Sobic006G045301 Sobic001G150100 Sobic001G150100 Sobic002G380150--Sobic001G150100 Sobic002G030001 Sobic002G030001 Sobic002G380150--Sobic002G030001 Sobic002G380150--Sobic002G142350 Sobic007G203850 Sobic007G203850 Sobic002G380150--Sobic007G203850 Sobic002G380150--Sobic007G038200 Sobic007G225050 Sobic007G225050 Sobic002G380150--Sobic007G225050 Sobic002G380150--Sobic006G119100 Sobic007G174701--Sobic007G206600 Sobic007G174701--Sobic008G086100 Sobic007G174701--Sobic006G119100 Sobic004G223350 Sobic004G223350 Sobic007G174701--Sobic004G223350 Sobic007G173901 Sobic007G173901 Sobic007G174701--Sobic007G173901 Sobic007G174701--Sobic002G142350 Sobic002G262500 Sobic002G262500 Sobic007G174701--Sobic002G262500 Sobic004G357600 Sobic004G357600 Sobic007G174701--Sobic004G357600 Sobic007G174701--Sobic007G038200 Sobic002G315450--Sobic006G119100 Sobic002G202350 Sobic002G202350 Sobic002G315450--Sobic002G202350 Sobic002G107700 Sobic002G107700 Sobic002G315450--Sobic002G107700 Sobic010G184201 Sobic010G184201 Sobic002G315450--Sobic010G184201 Sobic001G065400 Sobic001G065400 Sobic002G315450--Sobic001G065400 Sobic003G028700 Sobic003G028700 Sobic002G315450--Sobic003G028700 Sobic003G068200 Sobic003G068200 Sobic002G315450--Sobic003G068200 Sobic008G165500 Sobic008G165500 Sobic002G315450--Sobic008G165500 Sobic001G104050 Sobic001G104050 Sobic002G315450--Sobic001G104050 Sobic007G206600--Sobic007G174701 Sobic007G206600--Sobic008G086100 Sobic007G206600--Sobic006G119100 Sobic007G206600--Sobic002G142350 Sobic001G487250 Sobic001G487250 Sobic007G206600--Sobic001G487250 Sobic003G276700 Sobic003G276700 Sobic007G206600--Sobic003G276700 Sobic003G096400 Sobic003G096400 Sobic007G206600--Sobic003G096400 Sobic010G011001 Sobic010G011001 Sobic007G206600--Sobic010G011001 Sobic007G206600--Sobic004G223350 Sobic007G044350--Sobic001G296600 Sobic004G060000 Sobic004G060000 Sobic007G044350--Sobic004G060000 Sobic010G217466 Sobic010G217466 Sobic007G044350--Sobic010G217466 Sobic007G044350--Sobic001G104050 Sobic006G108900 Sobic006G108900 Sobic007G044350--Sobic006G108900 Sobic007G044350--Sobic002G262500 Sobic007G044350--Sobic003G276700 Sobic007G044350--Sobic006G119100 Sobic007G044350--Sobic004G357600 Sobic001G296600--Sobic001G104050 Sobic001G296600--Sobic007G044350 Sobic001G296600--Sobic004G223350 Sobic001G296600--Sobic004G357600 Sobic003G267600 Sobic003G267600 Sobic001G296600--Sobic003G267600 Sobic001G296600--Sobic007G173901 Sobic004G205900 Sobic004G205900 Sobic001G296600--Sobic004G205900 Sobic001G296600--Sobic003G276700 Sobic002G008701 Sobic002G008701 Sobic001G296600--Sobic002G008701 Sobic008G086100--Sobic004G223350 Sobic008G086100--Sobic007G173901 Sobic008G086100--Sobic007G174701 Sobic008G086100--Sobic002G262500 Sobic008G096300 Sobic008G096300 Sobic008G086100--Sobic008G096300 Sobic001G400101 Sobic001G400101 Sobic008G086100--Sobic001G400101 Sobic008G086100--Sobic002G142350 Sobic008G175600 Sobic008G175600 Sobic008G086100--Sobic008G175600 Sobic008G086100--Sobic007G206600 Sobic006G045301--Sobic007G225050 Sobic003G015800 Sobic003G015800 Sobic006G045301--Sobic003G015800 Sobic006G045301--Sobic007G203850 Sobic001G311700 Sobic001G311700 Sobic006G045301--Sobic001G311700 Sobic006G045301--Sobic002G380150 Sobic008G086300 Sobic008G086300 Sobic006G045301--Sobic008G086300 Sobic006G045301--Sobic007G081400 Sobic008G078500 Sobic008G078500 Sobic006G045301--Sobic008G078500 Sobic005G083866 Sobic005G083866 Sobic006G045301--Sobic005G083866
Octagon: transcription factors


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