Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G142350.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0W3V1
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G081400 - -
2 Sobic.002G380150 - -
3 Sobic.004G223350 - -
4 Sobic.004G288900 protein kinase, putative, expressed -
5 Sobic.003G241600 - -
6 Sobic.008G096300 - -
7 Sobic.007G203850 - -
8 Sobic.009G049100 - -
9 Sobic.008G024700 DUF567 domain containing protein, putative, expressed -
10 Sobic.003G276700 "domain confirmed by Pfam database, expressed in flower, expression induced by IAA and ABA treatments"(PubMedID : 20528920)@auxin efflux carrier component, putative, expressed K13947: auxin efflux carrier family protein
11 Sobic.007G016200 expressed protein -
12 Sobic.008G086100 - -
13 Sobic.008G078500 - -
14 Sobic.003G096400 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@protein kinase domain containing protein, expressed -
15 Sobic.001G312801 - -
16 Sobic.007G038200 lectin-like receptor kinase, putative, expressed -
17 Sobic.009G252500 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@mitochondrial chaperone BCS1, putative, expressed K08900: mitochondrial chaperone BCS1
18 Sobic.004G190800 galactosyltransferase family protein, putative, expressed K14413: beta-1,3-galactosyltransferase
19 Sobic.001G093732 - -
20 Sobic.001G487250 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G142350 Sobic002G142350 Sobic007G081400 Sobic007G081400 Sobic002G142350--Sobic007G081400 Sobic002G380150 Sobic002G380150 Sobic002G142350--Sobic002G380150 Sobic004G223350 Sobic004G223350 Sobic002G142350--Sobic004G223350 Sobic004G288900 Sobic004G288900 Sobic002G142350--Sobic004G288900 Sobic003G241600 Sobic003G241600 Sobic002G142350--Sobic003G241600 Sobic008G096300 Sobic008G096300 Sobic002G142350--Sobic008G096300 Sobic007G203850 Sobic007G203850 Sobic002G142350--Sobic007G203850 Sobic009G049100 Sobic009G049100 Sobic002G142350--Sobic009G049100 Sobic008G024700 Sobic008G024700 Sobic002G142350--Sobic008G024700 Sobic005G083866 Sobic005G083866 Sobic007G081400--Sobic005G083866 Sobic007G081400--Sobic002G380150 Sobic007G081400--Sobic002G142350 Sobic010G217001 Sobic010G217001 Sobic007G081400--Sobic010G217001 Sobic007G081400--Sobic007G203850 Sobic007G081400--Sobic004G288900 Sobic006G045301 Sobic006G045301 Sobic007G081400--Sobic006G045301 Sobic002G018133 Sobic002G018133 Sobic007G081400--Sobic002G018133 Sobic001G311700 Sobic001G311700 Sobic007G081400--Sobic001G311700 Sobic002G380150--Sobic007G081400 Sobic002G380150--Sobic006G045301 Sobic001G150100 Sobic001G150100 Sobic002G380150--Sobic001G150100 Sobic002G030001 Sobic002G030001 Sobic002G380150--Sobic002G030001 Sobic002G380150--Sobic002G142350 Sobic002G380150--Sobic007G203850 Sobic007G038200 Sobic007G038200 Sobic002G380150--Sobic007G038200 Sobic007G225050 Sobic007G225050 Sobic002G380150--Sobic007G225050 Sobic006G119100 Sobic006G119100 Sobic002G380150--Sobic006G119100 Sobic007G173901 Sobic007G173901 Sobic004G223350--Sobic007G173901 Sobic008G086100 Sobic008G086100 Sobic004G223350--Sobic008G086100 Sobic002G008701 Sobic002G008701 Sobic004G223350--Sobic002G008701 Sobic004G223350--Sobic007G203850 Sobic002G346250 Sobic002G346250 Sobic004G223350--Sobic002G346250 Sobic004G223350--Sobic003G241600 Sobic004G223350--Sobic002G142350 Sobic001G296600 Sobic001G296600 Sobic004G223350--Sobic001G296600 Sobic004G223350--Sobic008G096300 Sobic001G312801 Sobic001G312801 Sobic004G288900--Sobic001G312801 Sobic002G138200 Sobic002G138200 Sobic004G288900--Sobic002G138200 Sobic003G043650 Sobic003G043650 Sobic004G288900--Sobic003G043650 Sobic009G184500 Sobic009G184500 Sobic004G288900--Sobic009G184500 Sobic010G041500 Sobic010G041500 Sobic004G288900--Sobic010G041500 Sobic004G288900--Sobic008G096300 Sobic001G490600 Sobic001G490600 Sobic004G288900--Sobic001G490600 Sobic009G170301 Sobic009G170301 Sobic004G288900--Sobic009G170301 Sobic004G288900--Sobic003G241600 Sobic002G231400 Sobic002G231400 Sobic003G241600--Sobic002G231400 Sobic001G018550 Sobic001G018550 Sobic003G241600--Sobic001G018550 Sobic009G252500 Sobic009G252500 Sobic003G241600--Sobic009G252500 Sobic007G046600 Sobic007G046600 Sobic003G241600--Sobic007G046600 Sobic003G429600 Sobic003G429600 Sobic003G241600--Sobic003G429600 Sobic002G013600 Sobic002G013600 Sobic003G241600--Sobic002G013600 Sobic003G241600--Sobic004G288900 Sobic003G305250 Sobic003G305250 Sobic003G241600--Sobic003G305250 Sobic005G096201 Sobic005G096201 Sobic003G241600--Sobic005G096201 Sobic008G096300--Sobic004G288900 Sobic008G096300--Sobic001G312801 Sobic004G190800 Sobic004G190800 Sobic008G096300--Sobic004G190800 Sobic001G400101 Sobic001G400101 Sobic008G096300--Sobic001G400101 Sobic008G096300--Sobic004G223350 Sobic008G096300--Sobic002G142350 Sobic008G096300--Sobic003G241600 Sobic008G096300--Sobic008G086100 Sobic002G413800 Sobic002G413800 Sobic008G096300--Sobic002G413800 Sobic007G203850--Sobic006G045301 Sobic008G078500 Sobic008G078500 Sobic007G203850--Sobic008G078500 Sobic007G203850--Sobic007G225050 Sobic007G203850--Sobic004G223350 Sobic007G203850--Sobic007G081400 Sobic003G015800 Sobic003G015800 Sobic007G203850--Sobic003G015800 Sobic007G203850--Sobic001G311700 Sobic007G203850--Sobic005G083866 Sobic007G203850--Sobic002G008701 Sobic009G049100--Sobic008G024700 Sobic001G460150 Sobic001G460150 Sobic009G049100--Sobic001G460150 Sobic003G336300 Sobic003G336300 Sobic009G049100--Sobic003G336300 Sobic009G049100--Sobic004G190800 Sobic004G144300 Sobic004G144300 Sobic009G049100--Sobic004G144300 Sobic009G049100--Sobic009G252500 Sobic003G298000 Sobic003G298000 Sobic009G049100--Sobic003G298000 Sobic004G310400 Sobic004G310400 Sobic009G049100--Sobic004G310400 Sobic009G049100--Sobic007G046600 Sobic008G024700--Sobic009G049100 Sobic008G024700--Sobic001G460150 Sobic008G024700--Sobic004G190800 Sobic006G121200 Sobic006G121200 Sobic008G024700--Sobic006G121200 Sobic002G360701 Sobic002G360701 Sobic008G024700--Sobic002G360701 Sobic008G024700--Sobic003G336300 Sobic001G513900 Sobic001G513900 Sobic008G024700--Sobic001G513900 Sobic001G487250 Sobic001G487250 Sobic008G024700--Sobic001G487250 Sobic008G024700--Sobic004G223350
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.