Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G096300.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PCQ4 , H0I4F0
Pfam -
Panther DB PTHR30070
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR ATMG00110 : cytochrome C biogenesis 206
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley HORVU2Hr1G122840.2 , HORVU2Hr1G061240.1 , HORVU3Hr1G050690.1 , HORVU4Hr1G038820.1 , HORVU3Hr1G050690.2 , HORVU2Hr1G122840.1 , BAV58146
Wheat TraesCS2A02G509500 , TraesCS3D02G376900
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G288900 protein kinase, putative, expressed -
2 Sobic.001G312801 - -
3 Sobic.004G190800 galactosyltransferase family protein, putative, expressed K14413: beta-1,3-galactosyltransferase
4 Sobic.001G400101 - -
5 Sobic.004G223350 - -
6 Sobic.002G142350 - -
7 Sobic.003G241600 - -
8 Sobic.008G086100 - -
9 Sobic.002G413800 Spc97 / Spc98 family protein, putative, expressed -
10 Sobic.009G144050 - -
11 Sobic.009G184500 cysteine proteinase inhibitor precursor protein, putative, expressed -
12 Sobic.001G490600 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@ribosomal L18p/L5e family protein, putative, expressed -
13 Sobic.010G041500 dual specificity protein phosphatase, putative, expressed -
14 Sobic.007G081400 - -
15 Sobic.002G013600 expressed protein -
16 Sobic.009G049100 - -
17 Sobic.009G020800 - -
18 Sobic.009G252500 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@mitochondrial chaperone BCS1, putative, expressed K08900: mitochondrial chaperone BCS1
19 Sobic.002G360701 - -
20 Sobic.005G204900 Lipase class 3 family protein (At)(PubMedID : 27208977)@lipase class 3 family protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic008G096300 Sobic008G096300 Sobic004G288900 Sobic004G288900 Sobic008G096300--Sobic004G288900 Sobic001G312801 Sobic001G312801 Sobic008G096300--Sobic001G312801 Sobic004G190800 Sobic004G190800 Sobic008G096300--Sobic004G190800 Sobic001G400101 Sobic001G400101 Sobic008G096300--Sobic001G400101 Sobic004G223350 Sobic004G223350 Sobic008G096300--Sobic004G223350 Sobic002G142350 Sobic002G142350 Sobic008G096300--Sobic002G142350 Sobic003G241600 Sobic003G241600 Sobic008G096300--Sobic003G241600 Sobic008G086100 Sobic008G086100 Sobic008G096300--Sobic008G086100 Sobic002G413800 Sobic002G413800 Sobic008G096300--Sobic002G413800 Sobic004G288900--Sobic001G312801 Sobic002G138200 Sobic002G138200 Sobic004G288900--Sobic002G138200 Sobic003G043650 Sobic003G043650 Sobic004G288900--Sobic003G043650 Sobic009G184500 Sobic009G184500 Sobic004G288900--Sobic009G184500 Sobic010G041500 Sobic010G041500 Sobic004G288900--Sobic010G041500 Sobic004G288900--Sobic008G096300 Sobic001G490600 Sobic001G490600 Sobic004G288900--Sobic001G490600 Sobic009G170301 Sobic009G170301 Sobic004G288900--Sobic009G170301 Sobic004G288900--Sobic003G241600 Sobic001G312801--Sobic004G288900 Sobic001G312801--Sobic001G490600 Sobic001G368000 Sobic001G368000 Sobic001G312801--Sobic001G368000 Sobic001G312801--Sobic009G184500 Sobic001G312801--Sobic004G190800 Sobic007G017300 Sobic007G017300 Sobic001G312801--Sobic007G017300 Sobic001G312801--Sobic009G170301 Sobic001G312801--Sobic008G096300 Sobic001G312801--Sobic002G138200 Sobic002G013600 Sobic002G013600 Sobic004G190800--Sobic002G013600 Sobic004G190800--Sobic001G312801 Sobic009G049100 Sobic009G049100 Sobic004G190800--Sobic009G049100 Sobic002G360701 Sobic002G360701 Sobic004G190800--Sobic002G360701 Sobic007G061500 Sobic007G061500 Sobic004G190800--Sobic007G061500 Sobic001G350800 Sobic001G350800 Sobic004G190800--Sobic001G350800 Sobic004G314100 Sobic004G314100 Sobic004G190800--Sobic004G314100 Sobic004G190800--Sobic004G288900 Sobic002G346250 Sobic002G346250 Sobic004G190800--Sobic002G346250 Sobic001G400101--Sobic009G184500 Sobic001G400101--Sobic001G490600 Sobic009G020800 Sobic009G020800 Sobic001G400101--Sobic009G020800 Sobic001G400101--Sobic008G096300 Sobic010G150600 Sobic010G150600 Sobic001G400101--Sobic010G150600 Sobic010G060701 Sobic010G060701 Sobic001G400101--Sobic010G060701 Sobic009G144050 Sobic009G144050 Sobic001G400101--Sobic009G144050 Sobic001G400101--Sobic009G170301 Sobic001G400101--Sobic004G288900 Sobic007G173901 Sobic007G173901 Sobic004G223350--Sobic007G173901 Sobic004G223350--Sobic008G086100 Sobic002G008701 Sobic002G008701 Sobic004G223350--Sobic002G008701 Sobic007G203850 Sobic007G203850 Sobic004G223350--Sobic007G203850 Sobic004G223350--Sobic002G346250 Sobic004G223350--Sobic003G241600 Sobic004G223350--Sobic002G142350 Sobic001G296600 Sobic001G296600 Sobic004G223350--Sobic001G296600 Sobic004G223350--Sobic008G096300 Sobic007G081400 Sobic007G081400 Sobic002G142350--Sobic007G081400 Sobic002G380150 Sobic002G380150 Sobic002G142350--Sobic002G380150 Sobic002G142350--Sobic004G223350 Sobic002G142350--Sobic004G288900 Sobic002G142350--Sobic003G241600 Sobic002G142350--Sobic008G096300 Sobic002G142350--Sobic007G203850 Sobic002G142350--Sobic009G049100 Sobic008G024700 Sobic008G024700 Sobic002G142350--Sobic008G024700 Sobic002G231400 Sobic002G231400 Sobic003G241600--Sobic002G231400 Sobic001G018550 Sobic001G018550 Sobic003G241600--Sobic001G018550 Sobic009G252500 Sobic009G252500 Sobic003G241600--Sobic009G252500 Sobic007G046600 Sobic007G046600 Sobic003G241600--Sobic007G046600 Sobic003G429600 Sobic003G429600 Sobic003G241600--Sobic003G429600 Sobic003G241600--Sobic002G013600 Sobic003G241600--Sobic004G288900 Sobic003G305250 Sobic003G305250 Sobic003G241600--Sobic003G305250 Sobic005G096201 Sobic005G096201 Sobic003G241600--Sobic005G096201 Sobic008G086100--Sobic004G223350 Sobic008G086100--Sobic007G173901 Sobic007G174701 Sobic007G174701 Sobic008G086100--Sobic007G174701 Sobic002G262500 Sobic002G262500 Sobic008G086100--Sobic002G262500 Sobic008G086100--Sobic008G096300 Sobic008G086100--Sobic001G400101 Sobic008G086100--Sobic002G142350 Sobic008G175600 Sobic008G175600 Sobic008G086100--Sobic008G175600 Sobic007G206600 Sobic007G206600 Sobic008G086100--Sobic007G206600 Sobic002G413800--Sobic003G429600 Sobic004G327200 Sobic004G327200 Sobic002G413800--Sobic004G327200 Sobic002G413800--Sobic005G096201 Sobic002G209450 Sobic002G209450 Sobic002G413800--Sobic002G209450 Sobic002G413800--Sobic002G013600 Sobic002G413800--Sobic001G312801 Sobic004G224100 Sobic004G224100 Sobic002G413800--Sobic004G224100 Sobic002G413800--Sobic008G096300 Sobic009G147600 Sobic009G147600 Sobic002G413800--Sobic009G147600
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.