Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G400101.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5SA75
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley HORVU4Hr1G054780.1
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G184500 cysteine proteinase inhibitor precursor protein, putative, expressed -
2 Sobic.001G490600 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@ribosomal L18p/L5e family protein, putative, expressed -
3 Sobic.009G020800 - -
4 Sobic.008G096300 - -
5 Sobic.010G150600 - -
6 Sobic.010G060701 - K07964: heparanase
7 Sobic.009G144050 - -
8 Sobic.009G170301 - -
9 Sobic.004G288900 protein kinase, putative, expressed -
10 Sobic.002G076932 - -
11 Sobic.008G086100 - -
12 Sobic.010G041500 dual specificity protein phosphatase, putative, expressed -
13 Sobic.002G360701 - -
14 Sobic.008G096150 - -
15 Sobic.001G312801 - -
16 Sobic.003G082401 - -
17 Sobic.005G204900 Lipase class 3 family protein (At)(PubMedID : 27208977)@lipase class 3 family protein, putative, expressed -
18 Sobic.006G109850 - -
19 Sobic.001G368000 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@annexin, putative, expressed -
20 Sobic.008G185000 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G400101 Sobic001G400101 Sobic009G184500 Sobic009G184500 Sobic001G400101--Sobic009G184500 Sobic001G490600 Sobic001G490600 Sobic001G400101--Sobic001G490600 Sobic009G020800 Sobic009G020800 Sobic001G400101--Sobic009G020800 Sobic008G096300 Sobic008G096300 Sobic001G400101--Sobic008G096300 Sobic010G150600 Sobic010G150600 Sobic001G400101--Sobic010G150600 Sobic010G060701 Sobic010G060701 Sobic001G400101--Sobic010G060701 Sobic009G144050 Sobic009G144050 Sobic001G400101--Sobic009G144050 Sobic009G170301 Sobic009G170301 Sobic001G400101--Sobic009G170301 Sobic004G288900 Sobic004G288900 Sobic001G400101--Sobic004G288900 Sobic009G184500--Sobic001G490600 Sobic007G017300 Sobic007G017300 Sobic009G184500--Sobic007G017300 Sobic001G368000 Sobic001G368000 Sobic009G184500--Sobic001G368000 Sobic009G004500 Sobic009G004500 Sobic009G184500--Sobic009G004500 Sobic009G184500--Sobic004G288900 Sobic002G360701 Sobic002G360701 Sobic009G184500--Sobic002G360701 Sobic009G184500--Sobic010G150600 Sobic001G483200 Sobic001G483200 Sobic009G184500--Sobic001G483200 Sobic005G155001 Sobic005G155001 Sobic009G184500--Sobic005G155001 Sobic001G490600--Sobic009G184500 Sobic001G490600--Sobic001G368000 Sobic001G490600--Sobic007G017300 Sobic001G490600--Sobic009G004500 Sobic001G312801 Sobic001G312801 Sobic001G490600--Sobic001G312801 Sobic008G185000 Sobic008G185000 Sobic001G490600--Sobic008G185000 Sobic001G490600--Sobic009G170301 Sobic001G490600--Sobic001G483200 Sobic001G490600--Sobic005G155001 Sobic009G020800--Sobic001G400101 Sobic006G109850 Sobic006G109850 Sobic009G020800--Sobic006G109850 Sobic005G204900 Sobic005G204900 Sobic009G020800--Sobic005G204900 Sobic009G020800--Sobic008G096300 Sobic009G020800--Sobic010G150600 Sobic009G188750 Sobic009G188750 Sobic009G020800--Sobic009G188750 Sobic009G020800--Sobic001G490600 Sobic009G020800--Sobic009G184500 Sobic001G487250 Sobic001G487250 Sobic009G020800--Sobic001G487250 Sobic008G096300--Sobic004G288900 Sobic008G096300--Sobic001G312801 Sobic004G190800 Sobic004G190800 Sobic008G096300--Sobic004G190800 Sobic008G096300--Sobic001G400101 Sobic004G223350 Sobic004G223350 Sobic008G096300--Sobic004G223350 Sobic002G142350 Sobic002G142350 Sobic008G096300--Sobic002G142350 Sobic003G241600 Sobic003G241600 Sobic008G096300--Sobic003G241600 Sobic008G086100 Sobic008G086100 Sobic008G096300--Sobic008G086100 Sobic002G413800 Sobic002G413800 Sobic008G096300--Sobic002G413800 Sobic008G096150 Sobic008G096150 Sobic010G150600--Sobic008G096150 Sobic010G150600--Sobic009G184500 Sobic010G021401 Sobic010G021401 Sobic010G150600--Sobic010G021401 Sobic010G150600--Sobic005G155001 Sobic009G004300 Sobic009G004300 Sobic010G150600--Sobic009G004300 Sobic010G150600--Sobic002G360701 Sobic010G150600--Sobic001G490600 Sobic003G082401 Sobic003G082401 Sobic010G150600--Sobic003G082401 Sobic001G309000 Sobic001G309000 Sobic010G150600--Sobic001G309000 Sobic010G060701--Sobic008G185000 Sobic010G060701--Sobic001G490600 Sobic010G060701--Sobic009G170301 Sobic006G093400 Sobic006G093400 Sobic010G060701--Sobic006G093400 Sobic002G252700 Sobic002G252700 Sobic010G060701--Sobic002G252700 Sobic010G257300 Sobic010G257300 Sobic010G060701--Sobic010G257300 Sobic010G060701--Sobic001G400101 Sobic004G205400 Sobic004G205400 Sobic010G060701--Sobic004G205400 Sobic004G015500 Sobic004G015500 Sobic010G060701--Sobic004G015500 Sobic009G144050--Sobic004G288900 Sobic002G018133 Sobic002G018133 Sobic009G144050--Sobic002G018133 Sobic009G144050--Sobic001G487250 Sobic009G144050--Sobic003G082401 Sobic009G144050--Sobic001G400101 Sobic009G144050--Sobic009G184500 Sobic003G155350 Sobic003G155350 Sobic009G144050--Sobic003G155350 Sobic009G144050--Sobic008G096300 Sobic004G184500 Sobic004G184500 Sobic009G144050--Sobic004G184500 Sobic002G076932 Sobic002G076932 Sobic009G170301--Sobic002G076932 Sobic005G094500 Sobic005G094500 Sobic009G170301--Sobic005G094500 Sobic010G041500 Sobic010G041500 Sobic009G170301--Sobic010G041500 Sobic009G170301--Sobic001G368000 Sobic003G202900 Sobic003G202900 Sobic009G170301--Sobic003G202900 Sobic002G395900 Sobic002G395900 Sobic009G170301--Sobic002G395900 Sobic001G468200 Sobic001G468200 Sobic009G170301--Sobic001G468200 Sobic009G170301--Sobic001G490600 Sobic009G170301--Sobic007G017300 Sobic004G288900--Sobic001G312801 Sobic002G138200 Sobic002G138200 Sobic004G288900--Sobic002G138200 Sobic003G043650 Sobic003G043650 Sobic004G288900--Sobic003G043650 Sobic004G288900--Sobic009G184500 Sobic004G288900--Sobic010G041500 Sobic004G288900--Sobic008G096300 Sobic004G288900--Sobic001G490600 Sobic004G288900--Sobic009G170301 Sobic004G288900--Sobic003G241600
Octagon: transcription factors


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