Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G109850.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RDZ4 , C6JSK3
Pfam -
Panther DB PTHR35744 PTHR35744:SF2
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G12240 : zinc finger (C2H2 type) family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g39050.1 : ZOS4-07 - C2H2 zinc finger protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a011091
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G239750 - -
2 Sobic.001G062400 - -
3 Sobic.009G020800 - -
4 Sobic.005G027032 - -
5 Sobic.008G086100 - -
6 Sobic.006G103601 - -
7 Sobic.001G400101 - -
8 Sobic.004G344301 - -
9 Sobic.007G165200 - -
10 Sobic.010G011001 - -
11 Sobic.002G133600 - -
12 Sobic.004G357066 - -
13 Sobic.001G487250 - -
14 Sobic.004G225450 - -
15 Sobic.003G295200 serine/threonine protein kinase, putative, expressed -
16 Sobic.001G543600 tetraspanin family protein, putative, expressed -
17 Sobic.002G326200 TKL_IRAK_DUF26-la.4 - DUF26 kinases have homology to DUF26 containing loci, expressed -
18 Sobic.002G158600 - -
19 Sobic.005G139000 expressed protein -
20 Sobic.001G007500 exosome complex exonuclease, putative, expressed K12590: RRP46, exosome complex component RRP46


Gene co-expression network
sample Sobic006G109850 Sobic006G109850 Sobic003G239750 Sobic003G239750 Sobic006G109850--Sobic003G239750 Sobic001G062400 Sobic001G062400 Sobic006G109850--Sobic001G062400 Sobic009G020800 Sobic009G020800 Sobic006G109850--Sobic009G020800 Sobic005G027032 Sobic005G027032 Sobic006G109850--Sobic005G027032 Sobic008G086100 Sobic008G086100 Sobic006G109850--Sobic008G086100 Sobic006G103601 Sobic006G103601 Sobic006G109850--Sobic006G103601 Sobic001G400101 Sobic001G400101 Sobic006G109850--Sobic001G400101 Sobic004G344301 Sobic004G344301 Sobic006G109850--Sobic004G344301 Sobic007G165200 Sobic007G165200 Sobic006G109850--Sobic007G165200 Sobic003G239750--Sobic006G109850 Sobic003G239750--Sobic001G062400 Sobic010G011001 Sobic010G011001 Sobic003G239750--Sobic010G011001 Sobic004G225450 Sobic004G225450 Sobic003G239750--Sobic004G225450 Sobic003G239750--Sobic005G027032 Sobic004G357066 Sobic004G357066 Sobic003G239750--Sobic004G357066 Sobic003G239750--Sobic004G344301 Sobic001G543600 Sobic001G543600 Sobic003G239750--Sobic001G543600 Sobic001G229401 Sobic001G229401 Sobic003G239750--Sobic001G229401 Sobic001G062400--Sobic005G027032 Sobic001G062400--Sobic004G357066 Sobic001G062400--Sobic004G344301 Sobic004G357033 Sobic004G357033 Sobic001G062400--Sobic004G357033 Sobic001G062400--Sobic004G225450 Sobic001G062400--Sobic001G543600 Sobic001G062400--Sobic006G103601 Sobic001G261553 Sobic001G261553 Sobic001G062400--Sobic001G261553 Sobic001G062400--Sobic006G109850 Sobic009G020800--Sobic001G400101 Sobic009G020800--Sobic006G109850 Sobic005G204900 Sobic005G204900 Sobic009G020800--Sobic005G204900 Sobic008G096300 Sobic008G096300 Sobic009G020800--Sobic008G096300 Sobic010G150600 Sobic010G150600 Sobic009G020800--Sobic010G150600 Sobic009G188750 Sobic009G188750 Sobic009G020800--Sobic009G188750 Sobic001G490600 Sobic001G490600 Sobic009G020800--Sobic001G490600 Sobic009G184500 Sobic009G184500 Sobic009G020800--Sobic009G184500 Sobic001G487250 Sobic001G487250 Sobic009G020800--Sobic001G487250 Sobic005G027032--Sobic004G357066 Sobic005G027032--Sobic001G062400 Sobic005G027032--Sobic004G357033 Sobic005G027032--Sobic004G344301 Sobic010G096801 Sobic010G096801 Sobic005G027032--Sobic010G096801 Sobic001G206800 Sobic001G206800 Sobic005G027032--Sobic001G206800 Sobic005G027032--Sobic001G261553 Sobic005G027032--Sobic004G225450 Sobic001G220200 Sobic001G220200 Sobic005G027032--Sobic001G220200 Sobic004G223350 Sobic004G223350 Sobic008G086100--Sobic004G223350 Sobic007G173901 Sobic007G173901 Sobic008G086100--Sobic007G173901 Sobic007G174701 Sobic007G174701 Sobic008G086100--Sobic007G174701 Sobic002G262500 Sobic002G262500 Sobic008G086100--Sobic002G262500 Sobic008G086100--Sobic008G096300 Sobic008G086100--Sobic001G400101 Sobic002G142350 Sobic002G142350 Sobic008G086100--Sobic002G142350 Sobic008G175600 Sobic008G175600 Sobic008G086100--Sobic008G175600 Sobic007G206600 Sobic007G206600 Sobic008G086100--Sobic007G206600 Sobic009G238200 Sobic009G238200 Sobic006G103601--Sobic009G238200 Sobic002G285800 Sobic002G285800 Sobic006G103601--Sobic002G285800 Sobic010G106400 Sobic010G106400 Sobic006G103601--Sobic010G106400 Sobic002G116300 Sobic002G116300 Sobic006G103601--Sobic002G116300 Sobic006G146400 Sobic006G146400 Sobic006G103601--Sobic006G146400 Sobic009G174600 Sobic009G174600 Sobic006G103601--Sobic009G174600 Sobic001G537600 Sobic001G537600 Sobic006G103601--Sobic001G537600 Sobic003G379500 Sobic003G379500 Sobic006G103601--Sobic003G379500 Sobic009G258150 Sobic009G258150 Sobic006G103601--Sobic009G258150 Sobic001G400101--Sobic009G184500 Sobic001G400101--Sobic001G490600 Sobic001G400101--Sobic009G020800 Sobic001G400101--Sobic008G096300 Sobic001G400101--Sobic010G150600 Sobic010G060701 Sobic010G060701 Sobic001G400101--Sobic010G060701 Sobic009G144050 Sobic009G144050 Sobic001G400101--Sobic009G144050 Sobic009G170301 Sobic009G170301 Sobic001G400101--Sobic009G170301 Sobic004G288900 Sobic004G288900 Sobic001G400101--Sobic004G288900 Sobic004G344301--Sobic004G357033 Sobic004G344301--Sobic001G220200 Sobic004G344301--Sobic004G357066 Sobic004G344301--Sobic004G225450 Sobic010G158766 Sobic010G158766 Sobic004G344301--Sobic010G158766 Sobic001G223400 Sobic001G223400 Sobic004G344301--Sobic001G223400 Sobic003G427500 Sobic003G427500 Sobic004G344301--Sobic003G427500 Sobic001G519300 Sobic001G519300 Sobic004G344301--Sobic001G519300 Sobic010G074980 Sobic010G074980 Sobic004G344301--Sobic010G074980 Sobic001G456650 Sobic001G456650 Sobic007G165200--Sobic001G456650 Sobic006G065200 Sobic006G065200 Sobic007G165200--Sobic006G065200 Sobic007G165200--Sobic010G106400 Sobic001G068901 Sobic001G068901 Sobic007G165200--Sobic001G068901 Sobic007G165200--Sobic001G537600 Sobic001G308450 Sobic001G308450 Sobic007G165200--Sobic001G308450 Sobic002G003900 Sobic002G003900 Sobic007G165200--Sobic002G003900 Sobic006G280900 Sobic006G280900 Sobic007G165200--Sobic006G280900 Sobic007G165200--Sobic005G027032
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.