Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G543600.1
Synonym TRN2, Sb01g050590, TET1
Functional annotation tetraspanin family protein, putative, expressed
UniProt C5WNN8
Pfam PF00335
Panther DB PTHR32191 PTHR32191:SF14
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0016021; integral component of membrane


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G46700 : Tetraspanin family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g01012.1 : tetraspanin family protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a053615
Brachypodium KQK23471
Barley HORVU4Hr1G072670.1 , HORVU4Hr1G072670.2
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
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20 Sobic.001G537600 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic001G543600 Sobic001G543600 Sobic009G174600 Sobic009G174600 Sobic001G543600--Sobic009G174600 Sobic004G302400 Sobic004G302400 Sobic001G543600--Sobic004G302400 Sobic006G103601 Sobic006G103601 Sobic001G543600--Sobic006G103601 Sobic006G280900 Sobic006G280900 Sobic001G543600--Sobic006G280900 Sobic002G285800 Sobic002G285800 Sobic001G543600--Sobic002G285800 Sobic002G065300 Sobic002G065300 Sobic001G543600--Sobic002G065300 Sobic009G238200 Sobic009G238200 Sobic001G543600--Sobic009G238200 Sobic010G136601 Sobic010G136601 Sobic001G543600--Sobic010G136601 Sobic002G116300 Sobic002G116300 Sobic001G543600--Sobic002G116300 Sobic009G174600--Sobic004G302400 Sobic009G174600--Sobic002G065300 Sobic009G174600--Sobic002G116300 Sobic006G222650 Sobic006G222650 Sobic009G174600--Sobic006G222650 Sobic009G174600--Sobic001G543600 Sobic009G174600--Sobic002G285800 Sobic009G174600--Sobic006G103601 Sobic010G035300 Sobic010G035300 Sobic009G174600--Sobic010G035300 Sobic009G174600--Sobic009G238200 Sobic004G302400--Sobic006G222650 Sobic004G302400--Sobic009G174600 Sobic004G302400--Sobic010G035300 Sobic004G302400--Sobic002G116300 Sobic006G162300 Sobic006G162300 Sobic004G302400--Sobic006G162300 Sobic004G302400--Sobic002G065300 Sobic004G302400--Sobic009G238200 Sobic006G146400 Sobic006G146400 Sobic004G302400--Sobic006G146400 Sobic004G302400--Sobic006G280900 Sobic006G103601--Sobic009G238200 Sobic006G103601--Sobic002G285800 Sobic010G106400 Sobic010G106400 Sobic006G103601--Sobic010G106400 Sobic006G103601--Sobic002G116300 Sobic006G103601--Sobic006G146400 Sobic006G103601--Sobic009G174600 Sobic001G537600 Sobic001G537600 Sobic006G103601--Sobic001G537600 Sobic003G379500 Sobic003G379500 Sobic006G103601--Sobic003G379500 Sobic009G258150 Sobic009G258150 Sobic006G103601--Sobic009G258150 Sobic006G280900--Sobic006G146400 Sobic006G280900--Sobic006G222650 Sobic006G280900--Sobic004G302400 Sobic006G280900--Sobic001G537600 Sobic009G083100 Sobic009G083100 Sobic006G280900--Sobic009G083100 Sobic006G280900--Sobic009G238200 Sobic006G280900--Sobic002G116300 Sobic006G280900--Sobic010G106400 Sobic006G280900--Sobic010G035300 Sobic002G285800--Sobic010G136601 Sobic003G167825 Sobic003G167825 Sobic002G285800--Sobic003G167825 Sobic001G460800 Sobic001G460800 Sobic002G285800--Sobic001G460800 Sobic003G427500 Sobic003G427500 Sobic002G285800--Sobic003G427500 Sobic001G223400 Sobic001G223400 Sobic002G285800--Sobic001G223400 Sobic009G085600 Sobic009G085600 Sobic002G285800--Sobic009G085600 Sobic004G357033 Sobic004G357033 Sobic002G285800--Sobic004G357033 Sobic002G285800--Sobic006G103601 Sobic002G285800--Sobic009G238200 Sobic002G065300--Sobic009G174600 Sobic002G065300--Sobic004G302400 Sobic002G065300--Sobic006G222650 Sobic002G065300--Sobic002G116300 Sobic004G302550 Sobic004G302550 Sobic002G065300--Sobic004G302550 Sobic008G112400 Sobic008G112400 Sobic002G065300--Sobic008G112400 Sobic004G269500 Sobic004G269500 Sobic002G065300--Sobic004G269500 Sobic004G177400 Sobic004G177400 Sobic002G065300--Sobic004G177400 Sobic002G065300--Sobic001G543600 Sobic009G238200--Sobic002G116300 Sobic001G115900 Sobic001G115900 Sobic009G238200--Sobic001G115900 Sobic009G238200--Sobic003G167825 Sobic009G238200--Sobic006G103601 Sobic006G069050 Sobic006G069050 Sobic009G238200--Sobic006G069050 Sobic009G238200--Sobic009G258150 Sobic009G238200--Sobic006G146400 Sobic009G238200--Sobic009G085600 Sobic003G126400 Sobic003G126400 Sobic009G238200--Sobic003G126400 Sobic010G136601--Sobic001G223400 Sobic010G136601--Sobic002G285800 Sobic010G136601--Sobic001G460800 Sobic010G136601--Sobic003G427500 Sobic010G136601--Sobic004G357033 Sobic002G320900 Sobic002G320900 Sobic010G136601--Sobic002G320900 Sobic010G136601--Sobic003G167825 Sobic006G065700 Sobic006G065700 Sobic010G136601--Sobic006G065700 Sobic007G093400 Sobic007G093400 Sobic010G136601--Sobic007G093400 Sobic002G116300--Sobic010G035300 Sobic002G116300--Sobic004G302400 Sobic002G116300--Sobic006G222650 Sobic002G116300--Sobic009G238200 Sobic002G116300--Sobic006G146400 Sobic008G119000 Sobic008G119000 Sobic002G116300--Sobic008G119000 Sobic006G222800 Sobic006G222800 Sobic002G116300--Sobic006G222800 Sobic002G247100 Sobic002G247100 Sobic002G116300--Sobic002G247100 Sobic002G116300--Sobic009G174600
Octagon: transcription factors


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