Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G426650.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0W870
Pfam -
Panther DB PTHR21493 PTHR21493:SF129
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g50410.1 : lipase family protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G112400 - -
2 Sobic.007G119300 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@endoglucanase, putative, expressed -
3 Sobic.004G302550 - -
4 Sobic.004G269500 transcription factor TF2, putative, expressed -
5 Sobic.002G065300 OsSub58 - Putative Subtilisin homologue, expressed -
6 Sobic.009G174600 OsFBX407 - F-box domain containing protein, expressed -
7 Sobic.008G064900 growth regulator related protein, putative, expressed -
8 Sobic.005G001600 IBR domain containing protein, expressed -
9 Sobic.004G302400 NAC domain containing protein, putative, expressed -
10 Sobic.006G222650 - -
11 Sobic.001G543600 tetraspanin family protein, putative, expressed -
12 Sobic.002G331700 expressed protein -
13 Sobic.008G175600 RING-H2 finger protein ATL5D, putative, expressed -
14 Sobic.006G280900 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
15 Sobic.004G177400 T-complex protein 11, putative, expressed -
16 Sobic.010G181000 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@pentatricopeptide, putative, expressed -
17 Sobic.010G035300 WRKY73, expressed -
18 Sobic.008G173700 cyclic nucleotide-gated ion channel, putative, expressed K05391: cyclic nucleotide gated channel, plant
19 Sobic.002G116300 poly synthetase 1, putative, expressed K10798: poly [ADP-ribose] polymerase 2/3/4
20 Sobic.009G082500 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G426650 Sobic002G426650 Sobic008G112400 Sobic008G112400 Sobic002G426650--Sobic008G112400 Sobic007G119300 Sobic007G119300 Sobic002G426650--Sobic007G119300 Sobic004G302550 Sobic004G302550 Sobic002G426650--Sobic004G302550 Sobic004G269500 Sobic004G269500 Sobic002G426650--Sobic004G269500 Sobic002G065300 Sobic002G065300 Sobic002G426650--Sobic002G065300 Sobic009G174600 Sobic009G174600 Sobic002G426650--Sobic009G174600 Sobic008G064900 Sobic008G064900 Sobic002G426650--Sobic008G064900 Sobic005G001600 Sobic005G001600 Sobic002G426650--Sobic005G001600 Sobic004G302400 Sobic004G302400 Sobic002G426650--Sobic004G302400 Sobic008G112400--Sobic005G001600 Sobic008G112400--Sobic002G065300 Sobic008G112400--Sobic002G426650 Sobic009G082500 Sobic009G082500 Sobic008G112400--Sobic009G082500 Sobic002G346250 Sobic002G346250 Sobic008G112400--Sobic002G346250 Sobic008G112400--Sobic007G119300 Sobic008G112400--Sobic004G302550 Sobic008G112400--Sobic004G269500 Sobic008G112400--Sobic009G174600 Sobic007G119300--Sobic002G426650 Sobic007G119300--Sobic008G112400 Sobic007G119300--Sobic005G001600 Sobic007G119300--Sobic002G065300 Sobic006G280900 Sobic006G280900 Sobic007G119300--Sobic006G280900 Sobic007G119300--Sobic004G302400 Sobic006G222650 Sobic006G222650 Sobic007G119300--Sobic006G222650 Sobic007G119300--Sobic009G174600 Sobic007G119300--Sobic004G302550 Sobic004G177400 Sobic004G177400 Sobic004G302550--Sobic004G177400 Sobic004G302550--Sobic006G222650 Sobic005G091400 Sobic005G091400 Sobic004G302550--Sobic005G091400 Sobic004G302550--Sobic004G302400 Sobic008G173700 Sobic008G173700 Sobic004G302550--Sobic008G173700 Sobic004G302550--Sobic002G065300 Sobic004G211501 Sobic004G211501 Sobic004G302550--Sobic004G211501 Sobic004G302550--Sobic004G269500 Sobic010G035300 Sobic010G035300 Sobic004G302550--Sobic010G035300 Sobic004G269500--Sobic006G222650 Sobic004G269500--Sobic010G035300 Sobic004G269500--Sobic004G302400 Sobic004G269500--Sobic004G302550 Sobic004G269500--Sobic002G065300 Sobic004G269500--Sobic009G174600 Sobic002G116300 Sobic002G116300 Sobic004G269500--Sobic002G116300 Sobic004G314750 Sobic004G314750 Sobic004G269500--Sobic004G314750 Sobic006G146400 Sobic006G146400 Sobic004G269500--Sobic006G146400 Sobic002G065300--Sobic009G174600 Sobic002G065300--Sobic004G302400 Sobic002G065300--Sobic006G222650 Sobic002G065300--Sobic002G116300 Sobic002G065300--Sobic004G302550 Sobic002G065300--Sobic008G112400 Sobic002G065300--Sobic004G269500 Sobic002G065300--Sobic004G177400 Sobic001G543600 Sobic001G543600 Sobic002G065300--Sobic001G543600 Sobic009G174600--Sobic004G302400 Sobic009G174600--Sobic002G065300 Sobic009G174600--Sobic002G116300 Sobic009G174600--Sobic006G222650 Sobic009G174600--Sobic001G543600 Sobic002G285800 Sobic002G285800 Sobic009G174600--Sobic002G285800 Sobic006G103601 Sobic006G103601 Sobic009G174600--Sobic006G103601 Sobic009G174600--Sobic010G035300 Sobic009G238200 Sobic009G238200 Sobic009G174600--Sobic009G238200 Sobic008G064900--Sobic004G302550 Sobic008G064900--Sobic008G173700 Sobic008G064900--Sobic004G177400 Sobic008G064900--Sobic002G426650 Sobic003G378500 Sobic003G378500 Sobic008G064900--Sobic003G378500 Sobic002G188000 Sobic002G188000 Sobic008G064900--Sobic002G188000 Sobic008G064900--Sobic005G091400 Sobic008G064900--Sobic008G112400 Sobic001G541166 Sobic001G541166 Sobic008G064900--Sobic001G541166 Sobic005G001600--Sobic008G112400 Sobic005G001600--Sobic002G346250 Sobic001G176800 Sobic001G176800 Sobic005G001600--Sobic001G176800 Sobic004G184500 Sobic004G184500 Sobic005G001600--Sobic004G184500 Sobic005G001600--Sobic007G119300 Sobic005G001600--Sobic009G082500 Sobic001G096800 Sobic001G096800 Sobic005G001600--Sobic001G096800 Sobic008G192800 Sobic008G192800 Sobic005G001600--Sobic008G192800 Sobic005G001600--Sobic006G280900 Sobic004G302400--Sobic006G222650 Sobic004G302400--Sobic009G174600 Sobic004G302400--Sobic010G035300 Sobic004G302400--Sobic002G116300 Sobic006G162300 Sobic006G162300 Sobic004G302400--Sobic006G162300 Sobic004G302400--Sobic002G065300 Sobic004G302400--Sobic009G238200 Sobic004G302400--Sobic006G146400 Sobic004G302400--Sobic006G280900
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.