Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G064900.1
Synonym Sb08g005420
Functional annotation growth regulator related protein, putative, expressed
UniProt C5YTA4
Pfam PF10250
Panther DB PTHR31741 PTHR31741:SF15
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G64600 : O-fucosyltransferase family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g08820.2 : growth regulator related protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a025681
Brachypodium PNT65336 , KQJ91941 , KQJ91942 , KQJ91944
Barley HORVU2Hr1G086020.8 , HORVU2Hr1G086020.9 , HORVU2Hr1G086020.4 , HORVU2Hr1G086020.5 , HORVU2Hr1G086020.6 , HORVU2Hr1G086020.7 , HORVU2Hr1G086020.1 , HORVU2Hr1G086020.2 , HORVU2Hr1G086020.3 , HORVU2Hr1G086020.14 , HORVU2Hr1G086020.12 , HORVU2Hr1G086020.13 , HORVU2Hr1G086020.10 , HORVU2Hr1G086020.11
Wheat TraesCS2A02G355500 , TraesCS2B02G372800 , TraesCS2D02G352800
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G302550 - -
2 Sobic.008G173700 cyclic nucleotide-gated ion channel, putative, expressed K05391: cyclic nucleotide gated channel, plant
3 Sobic.004G177400 T-complex protein 11, putative, expressed -
4 Sobic.002G426650 - -
5 Sobic.003G378500 expressed protein -
6 Sobic.002G188000 receptor kinase, putative, expressed -
7 Sobic.005G091400 - -
8 Sobic.008G112400 - -
9 Sobic.001G541166 - -
10 Sobic.006G222650 - -
11 Sobic.004G302400 NAC domain containing protein, putative, expressed -
12 Sobic.007G119300 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@endoglucanase, putative, expressed -
13 Sobic.006G162300 expressed protein -
14 Sobic.004G211501 - -
15 Sobic.002G065300 OsSub58 - Putative Subtilisin homologue, expressed -
16 Sobic.005G001600 IBR domain containing protein, expressed -
17 Sobic.004G019700 expressed protein -
18 Sobic.010G035300 WRKY73, expressed -
19 Sobic.009G174600 OsFBX407 - F-box domain containing protein, expressed -
20 Sobic.004G269500 transcription factor TF2, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic008G064900 Sobic008G064900 Sobic004G302550 Sobic004G302550 Sobic008G064900--Sobic004G302550 Sobic008G173700 Sobic008G173700 Sobic008G064900--Sobic008G173700 Sobic004G177400 Sobic004G177400 Sobic008G064900--Sobic004G177400 Sobic002G426650 Sobic002G426650 Sobic008G064900--Sobic002G426650 Sobic003G378500 Sobic003G378500 Sobic008G064900--Sobic003G378500 Sobic002G188000 Sobic002G188000 Sobic008G064900--Sobic002G188000 Sobic005G091400 Sobic005G091400 Sobic008G064900--Sobic005G091400 Sobic008G112400 Sobic008G112400 Sobic008G064900--Sobic008G112400 Sobic001G541166 Sobic001G541166 Sobic008G064900--Sobic001G541166 Sobic004G302550--Sobic004G177400 Sobic006G222650 Sobic006G222650 Sobic004G302550--Sobic006G222650 Sobic004G302550--Sobic005G091400 Sobic004G302400 Sobic004G302400 Sobic004G302550--Sobic004G302400 Sobic004G302550--Sobic008G173700 Sobic002G065300 Sobic002G065300 Sobic004G302550--Sobic002G065300 Sobic004G211501 Sobic004G211501 Sobic004G302550--Sobic004G211501 Sobic004G269500 Sobic004G269500 Sobic004G302550--Sobic004G269500 Sobic010G035300 Sobic010G035300 Sobic004G302550--Sobic010G035300 Sobic008G173700--Sobic004G177400 Sobic008G173700--Sobic004G302550 Sobic008G173700--Sobic008G064900 Sobic008G173700--Sobic005G091400 Sobic008G173700--Sobic001G541166 Sobic008G173700--Sobic006G222650 Sobic005G001600 Sobic005G001600 Sobic008G173700--Sobic005G001600 Sobic008G173700--Sobic008G112400 Sobic008G173700--Sobic004G211501 Sobic004G177400--Sobic004G302550 Sobic004G177400--Sobic008G173700 Sobic004G177400--Sobic006G222650 Sobic004G177400--Sobic004G302400 Sobic004G177400--Sobic010G035300 Sobic004G177400--Sobic002G065300 Sobic004G177400--Sobic004G211501 Sobic004G177400--Sobic005G091400 Sobic004G177400--Sobic008G064900 Sobic002G426650--Sobic008G112400 Sobic007G119300 Sobic007G119300 Sobic002G426650--Sobic007G119300 Sobic002G426650--Sobic004G302550 Sobic002G426650--Sobic004G269500 Sobic002G426650--Sobic002G065300 Sobic009G174600 Sobic009G174600 Sobic002G426650--Sobic009G174600 Sobic002G426650--Sobic008G064900 Sobic002G426650--Sobic005G001600 Sobic002G426650--Sobic004G302400 Sobic004G019700 Sobic004G019700 Sobic003G378500--Sobic004G019700 Sobic003G378500--Sobic008G064900 Sobic003G378500--Sobic008G173700 Sobic008G019466 Sobic008G019466 Sobic003G378500--Sobic008G019466 Sobic001G124500 Sobic001G124500 Sobic003G378500--Sobic001G124500 Sobic003G378500--Sobic004G177400 Sobic008G013700 Sobic008G013700 Sobic003G378500--Sobic008G013700 Sobic004G192001 Sobic004G192001 Sobic003G378500--Sobic004G192001 Sobic003G378500--Sobic002G188000 Sobic002G188000--Sobic008G064900 Sobic002G188000--Sobic003G378500 Sobic002G188000--Sobic004G019700 Sobic010G008500 Sobic010G008500 Sobic002G188000--Sobic010G008500 Sobic009G038800 Sobic009G038800 Sobic002G188000--Sobic009G038800 Sobic002G188000--Sobic008G173700 Sobic007G047450 Sobic007G047450 Sobic002G188000--Sobic007G047450 Sobic002G188000--Sobic008G013700 Sobic002G188000--Sobic004G302550 Sobic005G091400--Sobic001G541166 Sobic006G162300 Sobic006G162300 Sobic005G091400--Sobic006G162300 Sobic005G091400--Sobic004G211501 Sobic005G091400--Sobic004G302550 Sobic005G091400--Sobic010G035300 Sobic005G091400--Sobic004G302400 Sobic005G091400--Sobic006G222650 Sobic002G116300 Sobic002G116300 Sobic005G091400--Sobic002G116300 Sobic004G001900 Sobic004G001900 Sobic005G091400--Sobic004G001900 Sobic008G112400--Sobic005G001600 Sobic008G112400--Sobic002G065300 Sobic008G112400--Sobic002G426650 Sobic009G082500 Sobic009G082500 Sobic008G112400--Sobic009G082500 Sobic002G346250 Sobic002G346250 Sobic008G112400--Sobic002G346250 Sobic008G112400--Sobic007G119300 Sobic008G112400--Sobic004G302550 Sobic008G112400--Sobic004G269500 Sobic008G112400--Sobic009G174600 Sobic001G541166--Sobic005G091400 Sobic001G541166--Sobic006G162300 Sobic001G541166--Sobic004G302550 Sobic001G541166--Sobic004G211501 Sobic001G541166--Sobic004G302400 Sobic001G541166--Sobic006G222650 Sobic003G385800 Sobic003G385800 Sobic001G541166--Sobic003G385800 Sobic008G152100 Sobic008G152100 Sobic001G541166--Sobic008G152100 Sobic001G541166--Sobic010G035300
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.