Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G001600.1
Synonym Sb05g000320
Functional annotation IBR domain containing protein, expressed
UniProt C6JRK4 , C5Y2X0
Pfam PF13456 PF01485
Panther DB PTHR11685 PTHR11685:SF107
NCBI CDD KOG1812; Predicted E3 ubiquitin ligase
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0016567; protein ubiquitination GO:0004842ubiquitin-protein transferase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G60250 : zinc finger (C3HC4-type RING finger) family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g01240.1 : IBR domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a033251
Brachypodium KQK05116 , PNT65620
Barley -
Wheat TraesCS5D02G160600 , TraesCS5D02G160500 , TraesCS7D02G174000 , TraesCS5A02G155500 , TraesCS5A02G155500 , TraesCS5A02G155400 , TraesCS5B02G153800 , TraesCS5B02G153700
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Gene co-expression network
sample Sobic005G001600 Sobic005G001600 Sobic008G112400 Sobic008G112400 Sobic005G001600--Sobic008G112400 Sobic002G346250 Sobic002G346250 Sobic005G001600--Sobic002G346250 Sobic001G176800 Sobic001G176800 Sobic005G001600--Sobic001G176800 Sobic004G184500 Sobic004G184500 Sobic005G001600--Sobic004G184500 Sobic007G119300 Sobic007G119300 Sobic005G001600--Sobic007G119300 Sobic009G082500 Sobic009G082500 Sobic005G001600--Sobic009G082500 Sobic001G096800 Sobic001G096800 Sobic005G001600--Sobic001G096800 Sobic008G192800 Sobic008G192800 Sobic005G001600--Sobic008G192800 Sobic006G280900 Sobic006G280900 Sobic005G001600--Sobic006G280900 Sobic008G112400--Sobic005G001600 Sobic002G065300 Sobic002G065300 Sobic008G112400--Sobic002G065300 Sobic002G426650 Sobic002G426650 Sobic008G112400--Sobic002G426650 Sobic008G112400--Sobic009G082500 Sobic008G112400--Sobic002G346250 Sobic008G112400--Sobic007G119300 Sobic004G302550 Sobic004G302550 Sobic008G112400--Sobic004G302550 Sobic004G269500 Sobic004G269500 Sobic008G112400--Sobic004G269500 Sobic009G174600 Sobic009G174600 Sobic008G112400--Sobic009G174600 Sobic002G346250--Sobic005G001600 Sobic002G346250--Sobic008G112400 Sobic003G155350 Sobic003G155350 Sobic002G346250--Sobic003G155350 Sobic002G346250--Sobic009G082500 Sobic002G013600 Sobic002G013600 Sobic002G346250--Sobic002G013600 Sobic002G346250--Sobic004G184500 Sobic003G043650 Sobic003G043650 Sobic002G346250--Sobic003G043650 Sobic004G288900 Sobic004G288900 Sobic002G346250--Sobic004G288900 Sobic004G223350 Sobic004G223350 Sobic002G346250--Sobic004G223350 Sobic001G176800--Sobic004G184500 Sobic003G202900 Sobic003G202900 Sobic001G176800--Sobic003G202900 Sobic001G176800--Sobic008G192800 Sobic005G094500 Sobic005G094500 Sobic001G176800--Sobic005G094500 Sobic007G017300 Sobic007G017300 Sobic001G176800--Sobic007G017300 Sobic009G045100 Sobic009G045100 Sobic001G176800--Sobic009G045100 Sobic007G090406 Sobic007G090406 Sobic001G176800--Sobic007G090406 Sobic001G468200 Sobic001G468200 Sobic001G176800--Sobic001G468200 Sobic001G176800--Sobic005G001600 Sobic008G166250 Sobic008G166250 Sobic004G184500--Sobic008G166250 Sobic004G184500--Sobic003G155350 Sobic004G184500--Sobic005G094500 Sobic004G184500--Sobic001G176800 Sobic001G212701 Sobic001G212701 Sobic004G184500--Sobic001G212701 Sobic002G114600 Sobic002G114600 Sobic004G184500--Sobic002G114600 Sobic004G184500--Sobic001G468200 Sobic004G184500--Sobic003G202900 Sobic004G314750 Sobic004G314750 Sobic004G184500--Sobic004G314750 Sobic007G119300--Sobic002G426650 Sobic007G119300--Sobic008G112400 Sobic007G119300--Sobic005G001600 Sobic007G119300--Sobic002G065300 Sobic007G119300--Sobic006G280900 Sobic004G302400 Sobic004G302400 Sobic007G119300--Sobic004G302400 Sobic006G222650 Sobic006G222650 Sobic007G119300--Sobic006G222650 Sobic007G119300--Sobic009G174600 Sobic007G119300--Sobic004G302550 Sobic002G282000 Sobic002G282000 Sobic009G082500--Sobic002G282000 Sobic009G082500--Sobic008G112400 Sobic007G016300 Sobic007G016300 Sobic009G082500--Sobic007G016300 Sobic009G082500--Sobic003G043650 Sobic009G236000 Sobic009G236000 Sobic009G082500--Sobic009G236000 Sobic009G082500--Sobic005G001600 Sobic009G082500--Sobic002G346250 Sobic004G200000 Sobic004G200000 Sobic009G082500--Sobic004G200000 Sobic002G038200 Sobic002G038200 Sobic009G082500--Sobic002G038200 Sobic001G096800--Sobic009G236000 Sobic001G096800--Sobic005G001600 Sobic009G083100 Sobic009G083100 Sobic001G096800--Sobic009G083100 Sobic001G096800--Sobic006G280900 Sobic001G096800--Sobic002G282000 Sobic001G096800--Sobic006G222650 Sobic006G146400 Sobic006G146400 Sobic001G096800--Sobic006G146400 Sobic001G096800--Sobic008G192800 Sobic009G114900 Sobic009G114900 Sobic001G096800--Sobic009G114900 Sobic008G192800--Sobic007G090406 Sobic009G004500 Sobic009G004500 Sobic008G192800--Sobic009G004500 Sobic003G093500 Sobic003G093500 Sobic008G192800--Sobic003G093500 Sobic008G192800--Sobic001G176800 Sobic008G192800--Sobic009G114900 Sobic005G155001 Sobic005G155001 Sobic008G192800--Sobic005G155001 Sobic008G192800--Sobic007G017300 Sobic007G061500 Sobic007G061500 Sobic008G192800--Sobic007G061500 Sobic001G368000 Sobic001G368000 Sobic008G192800--Sobic001G368000 Sobic006G280900--Sobic006G146400 Sobic006G280900--Sobic006G222650 Sobic006G280900--Sobic004G302400 Sobic001G537600 Sobic001G537600 Sobic006G280900--Sobic001G537600 Sobic006G280900--Sobic009G083100 Sobic009G238200 Sobic009G238200 Sobic006G280900--Sobic009G238200 Sobic002G116300 Sobic002G116300 Sobic006G280900--Sobic002G116300 Sobic010G106400 Sobic010G106400 Sobic006G280900--Sobic010G106400 Sobic010G035300 Sobic010G035300 Sobic006G280900--Sobic010G035300
Octagon: transcription factors


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