Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G082500.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6P786
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G282000 "SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental, salt-induced, and dark-induced senescence."(PubMedID : 27586543)@zinc finger, C3HC4 type, domain containing protein, expressed -
2 Sobic.008G112400 - -
3 Sobic.007G016300 - -
4 Sobic.003G043650 - -
5 Sobic.009G236000 GATA zinc finger domain containing protein, expressed -
6 Sobic.005G001600 IBR domain containing protein, expressed -
7 Sobic.002G346250 - -
8 Sobic.004G200000 expressed protein -
9 Sobic.002G038200 deoxyribonuclease tatD, putative, expressed K03424: TatD DNase family protein
10 Sobic.003G202900 expressed protein -
11 Sobic.002G395900 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@nodulation protein-related, putative, expressed -
12 Sobic.005G094500 senescence-induced receptor-like serine/threonine-protein kinase precursor, putative, expressed -
13 Sobic.002G065300 OsSub58 - Putative Subtilisin homologue, expressed -
14 Sobic.009G045100 proline synthetase co-transcribed bacterial homolog protein, putative, expressed K06997: yggS, PLP dependent protein
15 Sobic.002G138200 domain of unknown function DUF966 domain containing protein, expressed -
16 Sobic.005G083866 - -
17 Sobic.008G166250 - -
18 Sobic.004G184500 nucleoside diphosphate kinase, putative, expressed K00940: ndk, nucleoside-diphosphate kinase
19 Sobic.001G345366 - -
20 Sobic.008G192800 CK1_CaseinKinase_1a.5 - CK1 includes the casein kinase 1 kinases, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic009G082500 Sobic009G082500 Sobic002G282000 Sobic002G282000 Sobic009G082500--Sobic002G282000 Sobic008G112400 Sobic008G112400 Sobic009G082500--Sobic008G112400 Sobic007G016300 Sobic007G016300 Sobic009G082500--Sobic007G016300 Sobic003G043650 Sobic003G043650 Sobic009G082500--Sobic003G043650 Sobic009G236000 Sobic009G236000 Sobic009G082500--Sobic009G236000 Sobic005G001600 Sobic005G001600 Sobic009G082500--Sobic005G001600 Sobic002G346250 Sobic002G346250 Sobic009G082500--Sobic002G346250 Sobic004G200000 Sobic004G200000 Sobic009G082500--Sobic004G200000 Sobic002G038200 Sobic002G038200 Sobic009G082500--Sobic002G038200 Sobic002G282000--Sobic009G082500 Sobic002G282000--Sobic009G236000 Sobic002G282000--Sobic005G001600 Sobic002G282000--Sobic002G038200 Sobic009G045100 Sobic009G045100 Sobic002G282000--Sobic009G045100 Sobic001G096800 Sobic001G096800 Sobic002G282000--Sobic001G096800 Sobic008G192800 Sobic008G192800 Sobic002G282000--Sobic008G192800 Sobic002G282000--Sobic002G346250 Sobic003G093500 Sobic003G093500 Sobic002G282000--Sobic003G093500 Sobic008G112400--Sobic005G001600 Sobic002G065300 Sobic002G065300 Sobic008G112400--Sobic002G065300 Sobic002G426650 Sobic002G426650 Sobic008G112400--Sobic002G426650 Sobic008G112400--Sobic009G082500 Sobic008G112400--Sobic002G346250 Sobic007G119300 Sobic007G119300 Sobic008G112400--Sobic007G119300 Sobic004G302550 Sobic004G302550 Sobic008G112400--Sobic004G302550 Sobic004G269500 Sobic004G269500 Sobic008G112400--Sobic004G269500 Sobic009G174600 Sobic009G174600 Sobic008G112400--Sobic009G174600 Sobic007G016300--Sobic004G200000 Sobic002G331200 Sobic002G331200 Sobic007G016300--Sobic002G331200 Sobic005G083866 Sobic005G083866 Sobic007G016300--Sobic005G083866 Sobic007G016300--Sobic009G082500 Sobic007G016300--Sobic003G043650 Sobic007G016300--Sobic008G112400 Sobic002G008701 Sobic002G008701 Sobic007G016300--Sobic002G008701 Sobic004G260700 Sobic004G260700 Sobic007G016300--Sobic004G260700 Sobic001G345366 Sobic001G345366 Sobic007G016300--Sobic001G345366 Sobic003G043650--Sobic004G200000 Sobic003G043650--Sobic005G083866 Sobic002G138200 Sobic002G138200 Sobic003G043650--Sobic002G138200 Sobic004G288900 Sobic004G288900 Sobic003G043650--Sobic004G288900 Sobic004G047001 Sobic004G047001 Sobic003G043650--Sobic004G047001 Sobic003G043650--Sobic009G082500 Sobic010G041500 Sobic010G041500 Sobic003G043650--Sobic010G041500 Sobic003G043650--Sobic007G016300 Sobic003G043650--Sobic002G346250 Sobic009G236000--Sobic002G282000 Sobic009G236000--Sobic009G082500 Sobic009G236000--Sobic001G096800 Sobic006G146400 Sobic006G146400 Sobic009G236000--Sobic006G146400 Sobic009G083100 Sobic009G083100 Sobic009G236000--Sobic009G083100 Sobic006G280900 Sobic006G280900 Sobic009G236000--Sobic006G280900 Sobic009G236000--Sobic005G001600 Sobic009G236000--Sobic008G192800 Sobic009G114900 Sobic009G114900 Sobic009G236000--Sobic009G114900 Sobic005G001600--Sobic008G112400 Sobic005G001600--Sobic002G346250 Sobic001G176800 Sobic001G176800 Sobic005G001600--Sobic001G176800 Sobic004G184500 Sobic004G184500 Sobic005G001600--Sobic004G184500 Sobic005G001600--Sobic007G119300 Sobic005G001600--Sobic009G082500 Sobic005G001600--Sobic001G096800 Sobic005G001600--Sobic008G192800 Sobic005G001600--Sobic006G280900 Sobic002G346250--Sobic005G001600 Sobic002G346250--Sobic008G112400 Sobic003G155350 Sobic003G155350 Sobic002G346250--Sobic003G155350 Sobic002G346250--Sobic009G082500 Sobic002G013600 Sobic002G013600 Sobic002G346250--Sobic002G013600 Sobic002G346250--Sobic004G184500 Sobic002G346250--Sobic003G043650 Sobic002G346250--Sobic004G288900 Sobic004G223350 Sobic004G223350 Sobic002G346250--Sobic004G223350 Sobic004G200000--Sobic003G043650 Sobic004G200000--Sobic007G016300 Sobic004G200000--Sobic005G083866 Sobic004G200000--Sobic002G331200 Sobic004G200000--Sobic009G082500 Sobic004G200000--Sobic004G047001 Sobic001G018550 Sobic001G018550 Sobic004G200000--Sobic001G018550 Sobic001G214400 Sobic001G214400 Sobic004G200000--Sobic001G214400 Sobic002G231400 Sobic002G231400 Sobic004G200000--Sobic002G231400 Sobic006G152900 Sobic006G152900 Sobic002G038200--Sobic006G152900 Sobic009G250000 Sobic009G250000 Sobic002G038200--Sobic009G250000 Sobic004G342600 Sobic004G342600 Sobic002G038200--Sobic004G342600 Sobic002G038200--Sobic009G082500 Sobic006G142700 Sobic006G142700 Sobic002G038200--Sobic006G142700 Sobic010G150000 Sobic010G150000 Sobic002G038200--Sobic010G150000 Sobic004G165600 Sobic004G165600 Sobic002G038200--Sobic004G165600 Sobic001G494400 Sobic001G494400 Sobic002G038200--Sobic001G494400 Sobic002G038200--Sobic002G282000
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.