Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G200000.2
Synonym Sb04g024640
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1Z5RNH9
Pfam PF15243
Panther DB PTHR37771 PTHR37771:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G63135 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g38029.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a021333 , Zm00025a031819
Brachypodium -
Barley HORVU6Hr1G053110.1
Wheat TraesCS6D02G191700 , TraesCS6B02G236700
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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19 Sobic.002G282000 "SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental, salt-induced, and dark-induced senescence."(PubMedID : 27586543)@zinc finger, C3HC4 type, domain containing protein, expressed -
20 Sobic.001G311700 - -


Gene co-expression network
sample Sobic004G200000 Sobic004G200000 Sobic003G043650 Sobic003G043650 Sobic004G200000--Sobic003G043650 Sobic007G016300 Sobic007G016300 Sobic004G200000--Sobic007G016300 Sobic005G083866 Sobic005G083866 Sobic004G200000--Sobic005G083866 Sobic002G331200 Sobic002G331200 Sobic004G200000--Sobic002G331200 Sobic009G082500 Sobic009G082500 Sobic004G200000--Sobic009G082500 Sobic004G047001 Sobic004G047001 Sobic004G200000--Sobic004G047001 Sobic001G018550 Sobic001G018550 Sobic004G200000--Sobic001G018550 Sobic001G214400 Sobic001G214400 Sobic004G200000--Sobic001G214400 Sobic002G231400 Sobic002G231400 Sobic004G200000--Sobic002G231400 Sobic003G043650--Sobic004G200000 Sobic003G043650--Sobic005G083866 Sobic002G138200 Sobic002G138200 Sobic003G043650--Sobic002G138200 Sobic004G288900 Sobic004G288900 Sobic003G043650--Sobic004G288900 Sobic003G043650--Sobic004G047001 Sobic003G043650--Sobic009G082500 Sobic010G041500 Sobic010G041500 Sobic003G043650--Sobic010G041500 Sobic003G043650--Sobic007G016300 Sobic002G346250 Sobic002G346250 Sobic003G043650--Sobic002G346250 Sobic007G016300--Sobic004G200000 Sobic007G016300--Sobic002G331200 Sobic007G016300--Sobic005G083866 Sobic007G016300--Sobic009G082500 Sobic007G016300--Sobic003G043650 Sobic008G112400 Sobic008G112400 Sobic007G016300--Sobic008G112400 Sobic002G008701 Sobic002G008701 Sobic007G016300--Sobic002G008701 Sobic004G260700 Sobic004G260700 Sobic007G016300--Sobic004G260700 Sobic001G345366 Sobic001G345366 Sobic007G016300--Sobic001G345366 Sobic005G083866--Sobic003G043650 Sobic005G083866--Sobic004G200000 Sobic005G083866--Sobic007G016300 Sobic005G083866--Sobic002G331200 Sobic001G311700 Sobic001G311700 Sobic005G083866--Sobic001G311700 Sobic002G030001 Sobic002G030001 Sobic005G083866--Sobic002G030001 Sobic002G018133 Sobic002G018133 Sobic005G083866--Sobic002G018133 Sobic007G081400 Sobic007G081400 Sobic005G083866--Sobic007G081400 Sobic005G083866--Sobic010G041500 Sobic002G331200--Sobic007G016300 Sobic002G331200--Sobic005G083866 Sobic002G284300 Sobic002G284300 Sobic002G331200--Sobic002G284300 Sobic002G331200--Sobic001G214400 Sobic002G331200--Sobic004G200000 Sobic002G331200--Sobic008G112400 Sobic009G094000 Sobic009G094000 Sobic002G331200--Sobic009G094000 Sobic009G151500 Sobic009G151500 Sobic002G331200--Sobic009G151500 Sobic002G331200--Sobic003G043650 Sobic002G282000 Sobic002G282000 Sobic009G082500--Sobic002G282000 Sobic009G082500--Sobic008G112400 Sobic009G082500--Sobic007G016300 Sobic009G082500--Sobic003G043650 Sobic009G236000 Sobic009G236000 Sobic009G082500--Sobic009G236000 Sobic005G001600 Sobic005G001600 Sobic009G082500--Sobic005G001600 Sobic009G082500--Sobic002G346250 Sobic009G082500--Sobic004G200000 Sobic002G038200 Sobic002G038200 Sobic009G082500--Sobic002G038200 Sobic004G047001--Sobic003G043650 Sobic009G045100 Sobic009G045100 Sobic004G047001--Sobic009G045100 Sobic004G047001--Sobic002G138200 Sobic003G093500 Sobic003G093500 Sobic004G047001--Sobic003G093500 Sobic004G224100 Sobic004G224100 Sobic004G047001--Sobic004G224100 Sobic004G047001--Sobic004G200000 Sobic001G341900 Sobic001G341900 Sobic004G047001--Sobic001G341900 Sobic010G009532 Sobic010G009532 Sobic004G047001--Sobic010G009532 Sobic005G096201 Sobic005G096201 Sobic004G047001--Sobic005G096201 Sobic001G018550--Sobic002G231400 Sobic003G241600 Sobic003G241600 Sobic001G018550--Sobic003G241600 Sobic001G018550--Sobic004G200000 Sobic001G018550--Sobic005G096201 Sobic001G018550--Sobic003G043650 Sobic002G209450 Sobic002G209450 Sobic001G018550--Sobic002G209450 Sobic001G018550--Sobic005G083866 Sobic001G018550--Sobic007G016300 Sobic001G018550--Sobic002G346250 Sobic001G214400--Sobic009G151500 Sobic001G214400--Sobic002G331200 Sobic010G001700 Sobic010G001700 Sobic001G214400--Sobic010G001700 Sobic001G214400--Sobic002G138200 Sobic001G214400--Sobic004G200000 Sobic001G214400--Sobic002G284300 Sobic001G214400--Sobic010G009532 Sobic001G214400--Sobic003G043650 Sobic001G214400--Sobic002G018133 Sobic002G231400--Sobic001G018550 Sobic002G231400--Sobic003G241600 Sobic003G429600 Sobic003G429600 Sobic002G231400--Sobic003G429600 Sobic002G231400--Sobic005G096201 Sobic002G231400--Sobic004G200000 Sobic002G231400--Sobic003G043650 Sobic002G231400--Sobic002G209450 Sobic010G217001 Sobic010G217001 Sobic002G231400--Sobic010G217001 Sobic003G305250 Sobic003G305250 Sobic002G231400--Sobic003G305250
Octagon: transcription factors


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