Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G047001.1,Sobic.004G047001.2
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RKY0
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G043650 - -
2 Sobic.009G045100 proline synthetase co-transcribed bacterial homolog protein, putative, expressed K06997: yggS, PLP dependent protein
3 Sobic.002G138200 domain of unknown function DUF966 domain containing protein, expressed -
4 Sobic.003G093500 protein binding protein, putative, expressed -
5 Sobic.004G224100 RPA2B - Putative single-stranded DNA binding complex subunit 2, expressed K10739: RFA2, replication factor A2
6 Sobic.004G200000 expressed protein -
7 Sobic.001G341900 domain of unknown function domain containing protein, expressed -
8 Sobic.010G009532 - -
9 Sobic.005G096201 - -
10 Sobic.002G395900 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@nodulation protein-related, putative, expressed -
11 Sobic.010G041500 dual specificity protein phosphatase, putative, expressed -
12 Sobic.002G231400 - -
13 Sobic.008G192800 CK1_CaseinKinase_1a.5 - CK1 includes the casein kinase 1 kinases, expressed -
14 Sobic.007G017300 endoglucanase, putative, expressed -
15 Sobic.001G176800 - -
16 Sobic.001G018550 - -
17 Sobic.009G082500 - -
18 Sobic.001G214400 - -
19 Sobic.004G288900 protein kinase, putative, expressed -
20 Sobic.003G202900 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic004G047001 Sobic004G047001 Sobic003G043650 Sobic003G043650 Sobic004G047001--Sobic003G043650 Sobic009G045100 Sobic009G045100 Sobic004G047001--Sobic009G045100 Sobic002G138200 Sobic002G138200 Sobic004G047001--Sobic002G138200 Sobic003G093500 Sobic003G093500 Sobic004G047001--Sobic003G093500 Sobic004G224100 Sobic004G224100 Sobic004G047001--Sobic004G224100 Sobic004G200000 Sobic004G200000 Sobic004G047001--Sobic004G200000 Sobic001G341900 Sobic001G341900 Sobic004G047001--Sobic001G341900 Sobic010G009532 Sobic010G009532 Sobic004G047001--Sobic010G009532 Sobic005G096201 Sobic005G096201 Sobic004G047001--Sobic005G096201 Sobic003G043650--Sobic004G200000 Sobic005G083866 Sobic005G083866 Sobic003G043650--Sobic005G083866 Sobic003G043650--Sobic002G138200 Sobic004G288900 Sobic004G288900 Sobic003G043650--Sobic004G288900 Sobic003G043650--Sobic004G047001 Sobic009G082500 Sobic009G082500 Sobic003G043650--Sobic009G082500 Sobic010G041500 Sobic010G041500 Sobic003G043650--Sobic010G041500 Sobic007G016300 Sobic007G016300 Sobic003G043650--Sobic007G016300 Sobic002G346250 Sobic002G346250 Sobic003G043650--Sobic002G346250 Sobic002G395900 Sobic002G395900 Sobic009G045100--Sobic002G395900 Sobic009G045100--Sobic003G093500 Sobic007G017300 Sobic007G017300 Sobic009G045100--Sobic007G017300 Sobic003G202900 Sobic003G202900 Sobic009G045100--Sobic003G202900 Sobic001G176800 Sobic001G176800 Sobic009G045100--Sobic001G176800 Sobic007G061500 Sobic007G061500 Sobic009G045100--Sobic007G061500 Sobic005G094500 Sobic005G094500 Sobic009G045100--Sobic005G094500 Sobic009G045100--Sobic004G047001 Sobic001G368000 Sobic001G368000 Sobic009G045100--Sobic001G368000 Sobic002G138200--Sobic004G288900 Sobic002G138200--Sobic003G043650 Sobic002G138200--Sobic004G047001 Sobic002G138200--Sobic003G093500 Sobic009G184500 Sobic009G184500 Sobic002G138200--Sobic009G184500 Sobic001G214400 Sobic001G214400 Sobic002G138200--Sobic001G214400 Sobic002G138200--Sobic010G041500 Sobic002G138200--Sobic005G094500 Sobic002G138200--Sobic007G017300 Sobic009G004500 Sobic009G004500 Sobic003G093500--Sobic009G004500 Sobic003G093500--Sobic007G061500 Sobic003G093500--Sobic007G017300 Sobic003G093500--Sobic001G341900 Sobic008G192800 Sobic008G192800 Sobic003G093500--Sobic008G192800 Sobic003G093500--Sobic009G045100 Sobic005G155001 Sobic005G155001 Sobic003G093500--Sobic005G155001 Sobic003G093500--Sobic004G224100 Sobic001G060200 Sobic001G060200 Sobic003G093500--Sobic001G060200 Sobic004G224100--Sobic005G096201 Sobic002G013600 Sobic002G013600 Sobic004G224100--Sobic002G013600 Sobic004G224100--Sobic003G093500 Sobic003G139100 Sobic003G139100 Sobic004G224100--Sobic003G139100 Sobic004G224100--Sobic001G341900 Sobic004G224100--Sobic001G060200 Sobic004G224100--Sobic004G047001 Sobic004G224100--Sobic008G192800 Sobic004G224100--Sobic007G061500 Sobic004G200000--Sobic003G043650 Sobic004G200000--Sobic007G016300 Sobic004G200000--Sobic005G083866 Sobic002G331200 Sobic002G331200 Sobic004G200000--Sobic002G331200 Sobic004G200000--Sobic009G082500 Sobic004G200000--Sobic004G047001 Sobic001G018550 Sobic001G018550 Sobic004G200000--Sobic001G018550 Sobic004G200000--Sobic001G214400 Sobic002G231400 Sobic002G231400 Sobic004G200000--Sobic002G231400 Sobic001G341900--Sobic003G093500 Sobic001G341900--Sobic007G061500 Sobic001G341900--Sobic009G004500 Sobic001G341900--Sobic004G224100 Sobic004G337700 Sobic004G337700 Sobic001G341900--Sobic004G337700 Sobic001G341900--Sobic008G192800 Sobic001G341900--Sobic009G045100 Sobic001G341900--Sobic001G368000 Sobic009G114900 Sobic009G114900 Sobic001G341900--Sobic009G114900 Sobic008G152100 Sobic008G152100 Sobic010G009532--Sobic008G152100 Sobic010G009532--Sobic004G047001 Sobic010G009532--Sobic001G214400 Sobic001G501500 Sobic001G501500 Sobic010G009532--Sobic001G501500 Sobic007G090406 Sobic007G090406 Sobic010G009532--Sobic007G090406 Sobic010G097800 Sobic010G097800 Sobic010G009532--Sobic010G097800 Sobic005G077532 Sobic005G077532 Sobic010G009532--Sobic005G077532 Sobic010G009532--Sobic008G192800 Sobic010G009532--Sobic001G176800 Sobic002G209450 Sobic002G209450 Sobic005G096201--Sobic002G209450 Sobic005G096201--Sobic004G224100 Sobic005G096201--Sobic002G013600 Sobic005G096201--Sobic003G139100 Sobic010G150000 Sobic010G150000 Sobic005G096201--Sobic010G150000 Sobic005G096201--Sobic002G231400 Sobic004G165600 Sobic004G165600 Sobic005G096201--Sobic004G165600 Sobic001G494400 Sobic001G494400 Sobic005G096201--Sobic001G494400 Sobic003G429600 Sobic003G429600 Sobic005G096201--Sobic003G429600
Octagon: transcription factors


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