Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G176800.1
Synonym Sb01g015380
Functional annotation -
UniProt C5WTB9
Pfam -
Panther DB PTHR34570 PTHR34570:SF2
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G16447 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os10g21860.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G184500 nucleoside diphosphate kinase, putative, expressed K00940: ndk, nucleoside-diphosphate kinase
2 Sobic.003G202900 expressed protein -
3 Sobic.008G192800 CK1_CaseinKinase_1a.5 - CK1 includes the casein kinase 1 kinases, expressed -
4 Sobic.005G094500 senescence-induced receptor-like serine/threonine-protein kinase precursor, putative, expressed -
5 Sobic.007G017300 endoglucanase, putative, expressed -
6 Sobic.009G045100 proline synthetase co-transcribed bacterial homolog protein, putative, expressed K06997: yggS, PLP dependent protein
7 Sobic.007G090406 - -
8 Sobic.001G468200 MT-A70 domain containing protein, expressed -
9 Sobic.005G001600 IBR domain containing protein, expressed -
10 Sobic.001G212701 - -
11 Sobic.002G114600 - -
12 Sobic.001G368000 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@annexin, putative, expressed -
13 Sobic.001G483200 ataxin-2 C-terminal region family protein, expressed -
14 Sobic.003G155350 - -
15 Sobic.002G395900 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@nodulation protein-related, putative, expressed -
16 Sobic.009G004500 expressed protein -
17 Sobic.005G155001 - -
18 Sobic.009G114900 - -
19 Sobic.008G166250 - -
20 Sobic.002G346250 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G176800 Sobic001G176800 Sobic004G184500 Sobic004G184500 Sobic001G176800--Sobic004G184500 Sobic003G202900 Sobic003G202900 Sobic001G176800--Sobic003G202900 Sobic008G192800 Sobic008G192800 Sobic001G176800--Sobic008G192800 Sobic005G094500 Sobic005G094500 Sobic001G176800--Sobic005G094500 Sobic007G017300 Sobic007G017300 Sobic001G176800--Sobic007G017300 Sobic009G045100 Sobic009G045100 Sobic001G176800--Sobic009G045100 Sobic007G090406 Sobic007G090406 Sobic001G176800--Sobic007G090406 Sobic001G468200 Sobic001G468200 Sobic001G176800--Sobic001G468200 Sobic005G001600 Sobic005G001600 Sobic001G176800--Sobic005G001600 Sobic008G166250 Sobic008G166250 Sobic004G184500--Sobic008G166250 Sobic003G155350 Sobic003G155350 Sobic004G184500--Sobic003G155350 Sobic004G184500--Sobic005G094500 Sobic004G184500--Sobic001G176800 Sobic001G212701 Sobic001G212701 Sobic004G184500--Sobic001G212701 Sobic002G114600 Sobic002G114600 Sobic004G184500--Sobic002G114600 Sobic004G184500--Sobic001G468200 Sobic004G184500--Sobic003G202900 Sobic004G314750 Sobic004G314750 Sobic004G184500--Sobic004G314750 Sobic002G395900 Sobic002G395900 Sobic003G202900--Sobic002G395900 Sobic003G202900--Sobic005G094500 Sobic003G202900--Sobic001G176800 Sobic003G202900--Sobic009G045100 Sobic003G202900--Sobic004G184500 Sobic003G202900--Sobic001G468200 Sobic009G170301 Sobic009G170301 Sobic003G202900--Sobic009G170301 Sobic003G202900--Sobic007G017300 Sobic001G368000 Sobic001G368000 Sobic003G202900--Sobic001G368000 Sobic008G192800--Sobic007G090406 Sobic009G004500 Sobic009G004500 Sobic008G192800--Sobic009G004500 Sobic003G093500 Sobic003G093500 Sobic008G192800--Sobic003G093500 Sobic008G192800--Sobic001G176800 Sobic009G114900 Sobic009G114900 Sobic008G192800--Sobic009G114900 Sobic005G155001 Sobic005G155001 Sobic008G192800--Sobic005G155001 Sobic008G192800--Sobic007G017300 Sobic007G061500 Sobic007G061500 Sobic008G192800--Sobic007G061500 Sobic008G192800--Sobic001G368000 Sobic005G094500--Sobic002G395900 Sobic005G094500--Sobic004G184500 Sobic005G094500--Sobic003G202900 Sobic005G094500--Sobic003G155350 Sobic002G076932 Sobic002G076932 Sobic005G094500--Sobic002G076932 Sobic005G094500--Sobic009G170301 Sobic005G094500--Sobic001G176800 Sobic005G094500--Sobic008G166250 Sobic005G094500--Sobic007G017300 Sobic007G017300--Sobic001G368000 Sobic001G483200 Sobic001G483200 Sobic007G017300--Sobic001G483200 Sobic007G017300--Sobic009G004500 Sobic007G017300--Sobic005G155001 Sobic007G017300--Sobic007G061500 Sobic007G017300--Sobic003G093500 Sobic007G213500 Sobic007G213500 Sobic007G017300--Sobic007G213500 Sobic001G028500 Sobic001G028500 Sobic007G017300--Sobic001G028500 Sobic007G017300--Sobic001G468200 Sobic009G045100--Sobic002G395900 Sobic009G045100--Sobic003G093500 Sobic009G045100--Sobic007G017300 Sobic009G045100--Sobic003G202900 Sobic009G045100--Sobic001G176800 Sobic009G045100--Sobic007G061500 Sobic009G045100--Sobic005G094500 Sobic004G047001 Sobic004G047001 Sobic009G045100--Sobic004G047001 Sobic009G045100--Sobic001G368000 Sobic007G090406--Sobic008G192800 Sobic007G090406--Sobic009G114900 Sobic007G090406--Sobic005G155001 Sobic007G090406--Sobic001G176800 Sobic007G090406--Sobic009G004500 Sobic010G021401 Sobic010G021401 Sobic007G090406--Sobic010G021401 Sobic006G280900 Sobic006G280900 Sobic007G090406--Sobic006G280900 Sobic009G083100 Sobic009G083100 Sobic007G090406--Sobic009G083100 Sobic007G090406--Sobic004G184500 Sobic001G468200--Sobic003G155350 Sobic001G468200--Sobic007G017300 Sobic001G468200--Sobic001G483200 Sobic001G468200--Sobic001G368000 Sobic001G468200--Sobic001G176800 Sobic001G468200--Sobic004G184500 Sobic001G468200--Sobic005G094500 Sobic001G468200--Sobic003G202900 Sobic001G468200--Sobic009G170301 Sobic008G112400 Sobic008G112400 Sobic005G001600--Sobic008G112400 Sobic002G346250 Sobic002G346250 Sobic005G001600--Sobic002G346250 Sobic005G001600--Sobic001G176800 Sobic005G001600--Sobic004G184500 Sobic007G119300 Sobic007G119300 Sobic005G001600--Sobic007G119300 Sobic009G082500 Sobic009G082500 Sobic005G001600--Sobic009G082500 Sobic001G096800 Sobic001G096800 Sobic005G001600--Sobic001G096800 Sobic005G001600--Sobic008G192800 Sobic005G001600--Sobic006G280900
Octagon: transcription factors


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