Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G346250.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0W6U7
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G001600 IBR domain containing protein, expressed -
2 Sobic.008G112400 - -
3 Sobic.003G155350 - -
4 Sobic.009G082500 - -
5 Sobic.002G013600 expressed protein -
6 Sobic.004G184500 nucleoside diphosphate kinase, putative, expressed K00940: ndk, nucleoside-diphosphate kinase
7 Sobic.003G043650 - -
8 Sobic.004G288900 protein kinase, putative, expressed -
9 Sobic.004G223350 - -
10 Sobic.003G241600 - -
11 Sobic.004G190800 galactosyltransferase family protein, putative, expressed K14413: beta-1,3-galactosyltransferase
12 Sobic.001G176800 - -
13 Sobic.001G468200 MT-A70 domain containing protein, expressed -
14 Sobic.004G200000 expressed protein -
15 Sobic.008G192800 CK1_CaseinKinase_1a.5 - CK1 includes the casein kinase 1 kinases, expressed -
16 Sobic.010G041500 dual specificity protein phosphatase, putative, expressed -
17 Sobic.005G094500 senescence-induced receptor-like serine/threonine-protein kinase precursor, putative, expressed -
18 Sobic.002G282000 "SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental, salt-induced, and dark-induced senescence."(PubMedID : 27586543)@zinc finger, C3HC4 type, domain containing protein, expressed -
19 Sobic.005G083866 - -
20 Sobic.008G166250 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G346250 Sobic002G346250 Sobic005G001600 Sobic005G001600 Sobic002G346250--Sobic005G001600 Sobic008G112400 Sobic008G112400 Sobic002G346250--Sobic008G112400 Sobic003G155350 Sobic003G155350 Sobic002G346250--Sobic003G155350 Sobic009G082500 Sobic009G082500 Sobic002G346250--Sobic009G082500 Sobic002G013600 Sobic002G013600 Sobic002G346250--Sobic002G013600 Sobic004G184500 Sobic004G184500 Sobic002G346250--Sobic004G184500 Sobic003G043650 Sobic003G043650 Sobic002G346250--Sobic003G043650 Sobic004G288900 Sobic004G288900 Sobic002G346250--Sobic004G288900 Sobic004G223350 Sobic004G223350 Sobic002G346250--Sobic004G223350 Sobic005G001600--Sobic008G112400 Sobic005G001600--Sobic002G346250 Sobic001G176800 Sobic001G176800 Sobic005G001600--Sobic001G176800 Sobic005G001600--Sobic004G184500 Sobic007G119300 Sobic007G119300 Sobic005G001600--Sobic007G119300 Sobic005G001600--Sobic009G082500 Sobic001G096800 Sobic001G096800 Sobic005G001600--Sobic001G096800 Sobic008G192800 Sobic008G192800 Sobic005G001600--Sobic008G192800 Sobic006G280900 Sobic006G280900 Sobic005G001600--Sobic006G280900 Sobic008G112400--Sobic005G001600 Sobic002G065300 Sobic002G065300 Sobic008G112400--Sobic002G065300 Sobic002G426650 Sobic002G426650 Sobic008G112400--Sobic002G426650 Sobic008G112400--Sobic009G082500 Sobic008G112400--Sobic002G346250 Sobic008G112400--Sobic007G119300 Sobic004G302550 Sobic004G302550 Sobic008G112400--Sobic004G302550 Sobic004G269500 Sobic004G269500 Sobic008G112400--Sobic004G269500 Sobic009G174600 Sobic009G174600 Sobic008G112400--Sobic009G174600 Sobic003G155350--Sobic004G184500 Sobic001G468200 Sobic001G468200 Sobic003G155350--Sobic001G468200 Sobic005G094500 Sobic005G094500 Sobic003G155350--Sobic005G094500 Sobic008G166250 Sobic008G166250 Sobic003G155350--Sobic008G166250 Sobic007G017300 Sobic007G017300 Sobic003G155350--Sobic007G017300 Sobic002G018133 Sobic002G018133 Sobic003G155350--Sobic002G018133 Sobic003G155350--Sobic002G346250 Sobic001G368000 Sobic001G368000 Sobic003G155350--Sobic001G368000 Sobic002G395900 Sobic002G395900 Sobic003G155350--Sobic002G395900 Sobic002G282000 Sobic002G282000 Sobic009G082500--Sobic002G282000 Sobic009G082500--Sobic008G112400 Sobic007G016300 Sobic007G016300 Sobic009G082500--Sobic007G016300 Sobic009G082500--Sobic003G043650 Sobic009G236000 Sobic009G236000 Sobic009G082500--Sobic009G236000 Sobic009G082500--Sobic005G001600 Sobic009G082500--Sobic002G346250 Sobic004G200000 Sobic004G200000 Sobic009G082500--Sobic004G200000 Sobic002G038200 Sobic002G038200 Sobic009G082500--Sobic002G038200 Sobic004G190800 Sobic004G190800 Sobic002G013600--Sobic004G190800 Sobic004G224100 Sobic004G224100 Sobic002G013600--Sobic004G224100 Sobic005G096201 Sobic005G096201 Sobic002G013600--Sobic005G096201 Sobic003G139100 Sobic003G139100 Sobic002G013600--Sobic003G139100 Sobic004G165600 Sobic004G165600 Sobic002G013600--Sobic004G165600 Sobic001G494400 Sobic001G494400 Sobic002G013600--Sobic001G494400 Sobic007G061500 Sobic007G061500 Sobic002G013600--Sobic007G061500 Sobic002G013600--Sobic002G346250 Sobic003G241600 Sobic003G241600 Sobic002G013600--Sobic003G241600 Sobic004G184500--Sobic008G166250 Sobic004G184500--Sobic003G155350 Sobic004G184500--Sobic005G094500 Sobic004G184500--Sobic001G176800 Sobic001G212701 Sobic001G212701 Sobic004G184500--Sobic001G212701 Sobic002G114600 Sobic002G114600 Sobic004G184500--Sobic002G114600 Sobic004G184500--Sobic001G468200 Sobic003G202900 Sobic003G202900 Sobic004G184500--Sobic003G202900 Sobic004G314750 Sobic004G314750 Sobic004G184500--Sobic004G314750 Sobic003G043650--Sobic004G200000 Sobic005G083866 Sobic005G083866 Sobic003G043650--Sobic005G083866 Sobic002G138200 Sobic002G138200 Sobic003G043650--Sobic002G138200 Sobic003G043650--Sobic004G288900 Sobic004G047001 Sobic004G047001 Sobic003G043650--Sobic004G047001 Sobic003G043650--Sobic009G082500 Sobic010G041500 Sobic010G041500 Sobic003G043650--Sobic010G041500 Sobic003G043650--Sobic007G016300 Sobic003G043650--Sobic002G346250 Sobic001G312801 Sobic001G312801 Sobic004G288900--Sobic001G312801 Sobic004G288900--Sobic002G138200 Sobic004G288900--Sobic003G043650 Sobic009G184500 Sobic009G184500 Sobic004G288900--Sobic009G184500 Sobic004G288900--Sobic010G041500 Sobic008G096300 Sobic008G096300 Sobic004G288900--Sobic008G096300 Sobic001G490600 Sobic001G490600 Sobic004G288900--Sobic001G490600 Sobic009G170301 Sobic009G170301 Sobic004G288900--Sobic009G170301 Sobic004G288900--Sobic003G241600 Sobic007G173901 Sobic007G173901 Sobic004G223350--Sobic007G173901 Sobic008G086100 Sobic008G086100 Sobic004G223350--Sobic008G086100 Sobic002G008701 Sobic002G008701 Sobic004G223350--Sobic002G008701 Sobic007G203850 Sobic007G203850 Sobic004G223350--Sobic007G203850 Sobic004G223350--Sobic002G346250 Sobic004G223350--Sobic003G241600 Sobic002G142350 Sobic002G142350 Sobic004G223350--Sobic002G142350 Sobic001G296600 Sobic001G296600 Sobic004G223350--Sobic001G296600 Sobic004G223350--Sobic008G096300
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.