Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G112400.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PD29
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G001600 IBR domain containing protein, expressed -
2 Sobic.002G065300 OsSub58 - Putative Subtilisin homologue, expressed -
3 Sobic.002G426650 - -
4 Sobic.009G082500 - -
5 Sobic.002G346250 - -
6 Sobic.007G119300 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@endoglucanase, putative, expressed -
7 Sobic.004G302550 - -
8 Sobic.004G269500 transcription factor TF2, putative, expressed -
9 Sobic.009G174600 OsFBX407 - F-box domain containing protein, expressed -
10 Sobic.007G016300 - -
11 Sobic.004G177400 T-complex protein 11, putative, expressed -
12 Sobic.006G222650 - -
13 Sobic.008G175600 RING-H2 finger protein ATL5D, putative, expressed -
14 Sobic.008G173700 cyclic nucleotide-gated ion channel, putative, expressed K05391: cyclic nucleotide gated channel, plant
15 Sobic.009G236000 GATA zinc finger domain containing protein, expressed -
16 Sobic.008G166250 - -
17 Sobic.004G302400 NAC domain containing protein, putative, expressed -
18 Sobic.002G331200 - -
19 Sobic.002G282000 "SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental, salt-induced, and dark-induced senescence."(PubMedID : 27586543)@zinc finger, C3HC4 type, domain containing protein, expressed -
20 Sobic.002G331700 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic008G112400 Sobic008G112400 Sobic005G001600 Sobic005G001600 Sobic008G112400--Sobic005G001600 Sobic002G065300 Sobic002G065300 Sobic008G112400--Sobic002G065300 Sobic002G426650 Sobic002G426650 Sobic008G112400--Sobic002G426650 Sobic009G082500 Sobic009G082500 Sobic008G112400--Sobic009G082500 Sobic002G346250 Sobic002G346250 Sobic008G112400--Sobic002G346250 Sobic007G119300 Sobic007G119300 Sobic008G112400--Sobic007G119300 Sobic004G302550 Sobic004G302550 Sobic008G112400--Sobic004G302550 Sobic004G269500 Sobic004G269500 Sobic008G112400--Sobic004G269500 Sobic009G174600 Sobic009G174600 Sobic008G112400--Sobic009G174600 Sobic005G001600--Sobic008G112400 Sobic005G001600--Sobic002G346250 Sobic001G176800 Sobic001G176800 Sobic005G001600--Sobic001G176800 Sobic004G184500 Sobic004G184500 Sobic005G001600--Sobic004G184500 Sobic005G001600--Sobic007G119300 Sobic005G001600--Sobic009G082500 Sobic001G096800 Sobic001G096800 Sobic005G001600--Sobic001G096800 Sobic008G192800 Sobic008G192800 Sobic005G001600--Sobic008G192800 Sobic006G280900 Sobic006G280900 Sobic005G001600--Sobic006G280900 Sobic002G065300--Sobic009G174600 Sobic004G302400 Sobic004G302400 Sobic002G065300--Sobic004G302400 Sobic006G222650 Sobic006G222650 Sobic002G065300--Sobic006G222650 Sobic002G116300 Sobic002G116300 Sobic002G065300--Sobic002G116300 Sobic002G065300--Sobic004G302550 Sobic002G065300--Sobic008G112400 Sobic002G065300--Sobic004G269500 Sobic004G177400 Sobic004G177400 Sobic002G065300--Sobic004G177400 Sobic001G543600 Sobic001G543600 Sobic002G065300--Sobic001G543600 Sobic002G426650--Sobic008G112400 Sobic002G426650--Sobic007G119300 Sobic002G426650--Sobic004G302550 Sobic002G426650--Sobic004G269500 Sobic002G426650--Sobic002G065300 Sobic002G426650--Sobic009G174600 Sobic008G064900 Sobic008G064900 Sobic002G426650--Sobic008G064900 Sobic002G426650--Sobic005G001600 Sobic002G426650--Sobic004G302400 Sobic002G282000 Sobic002G282000 Sobic009G082500--Sobic002G282000 Sobic009G082500--Sobic008G112400 Sobic007G016300 Sobic007G016300 Sobic009G082500--Sobic007G016300 Sobic003G043650 Sobic003G043650 Sobic009G082500--Sobic003G043650 Sobic009G236000 Sobic009G236000 Sobic009G082500--Sobic009G236000 Sobic009G082500--Sobic005G001600 Sobic009G082500--Sobic002G346250 Sobic004G200000 Sobic004G200000 Sobic009G082500--Sobic004G200000 Sobic002G038200 Sobic002G038200 Sobic009G082500--Sobic002G038200 Sobic002G346250--Sobic005G001600 Sobic002G346250--Sobic008G112400 Sobic003G155350 Sobic003G155350 Sobic002G346250--Sobic003G155350 Sobic002G346250--Sobic009G082500 Sobic002G013600 Sobic002G013600 Sobic002G346250--Sobic002G013600 Sobic002G346250--Sobic004G184500 Sobic002G346250--Sobic003G043650 Sobic004G288900 Sobic004G288900 Sobic002G346250--Sobic004G288900 Sobic004G223350 Sobic004G223350 Sobic002G346250--Sobic004G223350 Sobic007G119300--Sobic002G426650 Sobic007G119300--Sobic008G112400 Sobic007G119300--Sobic005G001600 Sobic007G119300--Sobic002G065300 Sobic007G119300--Sobic006G280900 Sobic007G119300--Sobic004G302400 Sobic007G119300--Sobic006G222650 Sobic007G119300--Sobic009G174600 Sobic007G119300--Sobic004G302550 Sobic004G302550--Sobic004G177400 Sobic004G302550--Sobic006G222650 Sobic005G091400 Sobic005G091400 Sobic004G302550--Sobic005G091400 Sobic004G302550--Sobic004G302400 Sobic008G173700 Sobic008G173700 Sobic004G302550--Sobic008G173700 Sobic004G302550--Sobic002G065300 Sobic004G211501 Sobic004G211501 Sobic004G302550--Sobic004G211501 Sobic004G302550--Sobic004G269500 Sobic010G035300 Sobic010G035300 Sobic004G302550--Sobic010G035300 Sobic004G269500--Sobic006G222650 Sobic004G269500--Sobic010G035300 Sobic004G269500--Sobic004G302400 Sobic004G269500--Sobic004G302550 Sobic004G269500--Sobic002G065300 Sobic004G269500--Sobic009G174600 Sobic004G269500--Sobic002G116300 Sobic004G314750 Sobic004G314750 Sobic004G269500--Sobic004G314750 Sobic006G146400 Sobic006G146400 Sobic004G269500--Sobic006G146400 Sobic009G174600--Sobic004G302400 Sobic009G174600--Sobic002G065300 Sobic009G174600--Sobic002G116300 Sobic009G174600--Sobic006G222650 Sobic009G174600--Sobic001G543600 Sobic002G285800 Sobic002G285800 Sobic009G174600--Sobic002G285800 Sobic006G103601 Sobic006G103601 Sobic009G174600--Sobic006G103601 Sobic009G174600--Sobic010G035300 Sobic009G238200 Sobic009G238200 Sobic009G174600--Sobic009G238200
Octagon: transcription factors


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