Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G119300.1
Synonym GH9B15, AtGH9B15, Sb07g019470
Functional annotation SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence. (PubMedID : 27586543)
endoglucanase, putative, expressed
UniProt C5YKM9
Pfam PF00759
Panther DB PTHR22298 PTHR22298:SF22
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005975; carbohydrate metabolic process GO:0004553hydrolase activity, hydrolyzing O-glycosyl compounds


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G23560 : glycosyl hydrolase 9B15
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g29770.1 : endoglucanase, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a006024
Brachypodium KQK04131
Barley -
Wheat TraesCS1A02G088700 , TraesCS1D02G090100
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G426650 - -
2 Sobic.008G112400 - -
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18 Sobic.004G177400 T-complex protein 11, putative, expressed -
19 Sobic.006G065200 SAM domain family protein, expressed -
20 Sobic.009G236000 GATA zinc finger domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic007G119300 Sobic007G119300 Sobic002G426650 Sobic002G426650 Sobic007G119300--Sobic002G426650 Sobic008G112400 Sobic008G112400 Sobic007G119300--Sobic008G112400 Sobic005G001600 Sobic005G001600 Sobic007G119300--Sobic005G001600 Sobic002G065300 Sobic002G065300 Sobic007G119300--Sobic002G065300 Sobic006G280900 Sobic006G280900 Sobic007G119300--Sobic006G280900 Sobic004G302400 Sobic004G302400 Sobic007G119300--Sobic004G302400 Sobic006G222650 Sobic006G222650 Sobic007G119300--Sobic006G222650 Sobic009G174600 Sobic009G174600 Sobic007G119300--Sobic009G174600 Sobic004G302550 Sobic004G302550 Sobic007G119300--Sobic004G302550 Sobic002G426650--Sobic008G112400 Sobic002G426650--Sobic007G119300 Sobic002G426650--Sobic004G302550 Sobic004G269500 Sobic004G269500 Sobic002G426650--Sobic004G269500 Sobic002G426650--Sobic002G065300 Sobic002G426650--Sobic009G174600 Sobic008G064900 Sobic008G064900 Sobic002G426650--Sobic008G064900 Sobic002G426650--Sobic005G001600 Sobic002G426650--Sobic004G302400 Sobic008G112400--Sobic005G001600 Sobic008G112400--Sobic002G065300 Sobic008G112400--Sobic002G426650 Sobic009G082500 Sobic009G082500 Sobic008G112400--Sobic009G082500 Sobic002G346250 Sobic002G346250 Sobic008G112400--Sobic002G346250 Sobic008G112400--Sobic007G119300 Sobic008G112400--Sobic004G302550 Sobic008G112400--Sobic004G269500 Sobic008G112400--Sobic009G174600 Sobic005G001600--Sobic008G112400 Sobic005G001600--Sobic002G346250 Sobic001G176800 Sobic001G176800 Sobic005G001600--Sobic001G176800 Sobic004G184500 Sobic004G184500 Sobic005G001600--Sobic004G184500 Sobic005G001600--Sobic007G119300 Sobic005G001600--Sobic009G082500 Sobic001G096800 Sobic001G096800 Sobic005G001600--Sobic001G096800 Sobic008G192800 Sobic008G192800 Sobic005G001600--Sobic008G192800 Sobic005G001600--Sobic006G280900 Sobic002G065300--Sobic009G174600 Sobic002G065300--Sobic004G302400 Sobic002G065300--Sobic006G222650 Sobic002G116300 Sobic002G116300 Sobic002G065300--Sobic002G116300 Sobic002G065300--Sobic004G302550 Sobic002G065300--Sobic008G112400 Sobic002G065300--Sobic004G269500 Sobic004G177400 Sobic004G177400 Sobic002G065300--Sobic004G177400 Sobic001G543600 Sobic001G543600 Sobic002G065300--Sobic001G543600 Sobic006G146400 Sobic006G146400 Sobic006G280900--Sobic006G146400 Sobic006G280900--Sobic006G222650 Sobic006G280900--Sobic004G302400 Sobic001G537600 Sobic001G537600 Sobic006G280900--Sobic001G537600 Sobic009G083100 Sobic009G083100 Sobic006G280900--Sobic009G083100 Sobic009G238200 Sobic009G238200 Sobic006G280900--Sobic009G238200 Sobic006G280900--Sobic002G116300 Sobic010G106400 Sobic010G106400 Sobic006G280900--Sobic010G106400 Sobic010G035300 Sobic010G035300 Sobic006G280900--Sobic010G035300 Sobic004G302400--Sobic006G222650 Sobic004G302400--Sobic009G174600 Sobic004G302400--Sobic010G035300 Sobic004G302400--Sobic002G116300 Sobic006G162300 Sobic006G162300 Sobic004G302400--Sobic006G162300 Sobic004G302400--Sobic002G065300 Sobic004G302400--Sobic009G238200 Sobic004G302400--Sobic006G146400 Sobic004G302400--Sobic006G280900 Sobic006G222650--Sobic004G302400 Sobic006G222650--Sobic010G035300 Sobic006G222650--Sobic002G116300 Sobic006G222650--Sobic006G146400 Sobic006G222650--Sobic004G269500 Sobic006G222650--Sobic006G280900 Sobic006G222650--Sobic004G302550 Sobic006G222650--Sobic006G162300 Sobic006G222650--Sobic002G065300 Sobic009G174600--Sobic004G302400 Sobic009G174600--Sobic002G065300 Sobic009G174600--Sobic002G116300 Sobic009G174600--Sobic006G222650 Sobic009G174600--Sobic001G543600 Sobic002G285800 Sobic002G285800 Sobic009G174600--Sobic002G285800 Sobic006G103601 Sobic006G103601 Sobic009G174600--Sobic006G103601 Sobic009G174600--Sobic010G035300 Sobic009G174600--Sobic009G238200 Sobic004G302550--Sobic004G177400 Sobic004G302550--Sobic006G222650 Sobic005G091400 Sobic005G091400 Sobic004G302550--Sobic005G091400 Sobic004G302550--Sobic004G302400 Sobic008G173700 Sobic008G173700 Sobic004G302550--Sobic008G173700 Sobic004G302550--Sobic002G065300 Sobic004G211501 Sobic004G211501 Sobic004G302550--Sobic004G211501 Sobic004G302550--Sobic004G269500 Sobic004G302550--Sobic010G035300
Octagon: transcription factors


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