Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G269500.1
Synonym
Functional annotation transcription factor TF2, putative, expressed
UniProt A0A1Z5RP80
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G38250 : Homeodomain-like superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g51320.1 : transcription factor TF2, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a021691
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G222650 - -
2 Sobic.010G035300 WRKY73, expressed -
3 Sobic.004G302400 NAC domain containing protein, putative, expressed -
4 Sobic.004G302550 - -
5 Sobic.002G065300 OsSub58 - Putative Subtilisin homologue, expressed -
6 Sobic.009G174600 OsFBX407 - F-box domain containing protein, expressed -
7 Sobic.002G116300 poly synthetase 1, putative, expressed K10798: poly [ADP-ribose] polymerase 2/3/4
8 Sobic.004G314750 - -
9 Sobic.006G146400 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@pentatricopeptide, putative, expressed -
10 Sobic.009G250800 Up-reguralion under heat(PubMedID : 24916767)@polygalacturonase, putative, expressed -
11 Sobic.002G114600 - -
12 Sobic.004G001900 expressed protein -
13 Sobic.002G426650 - -
14 Sobic.002G285800 "domain confirmed by Pfam database, expression not supported"(PubMedID : 20499123)@OsSAUR52 - Auxin-responsive SAUR gene family member, expressed -
15 Sobic.006G222800 NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed -
16 Sobic.006G162300 expressed protein -
17 Sobic.006G280900 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
18 Sobic.008G112400 - -
19 Sobic.004G211501 - -
20 Sobic.004G177400 T-complex protein 11, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic004G269500 Sobic004G269500 Sobic006G222650 Sobic006G222650 Sobic004G269500--Sobic006G222650 Sobic010G035300 Sobic010G035300 Sobic004G269500--Sobic010G035300 Sobic004G302400 Sobic004G302400 Sobic004G269500--Sobic004G302400 Sobic004G302550 Sobic004G302550 Sobic004G269500--Sobic004G302550 Sobic002G065300 Sobic002G065300 Sobic004G269500--Sobic002G065300 Sobic009G174600 Sobic009G174600 Sobic004G269500--Sobic009G174600 Sobic002G116300 Sobic002G116300 Sobic004G269500--Sobic002G116300 Sobic004G314750 Sobic004G314750 Sobic004G269500--Sobic004G314750 Sobic006G146400 Sobic006G146400 Sobic004G269500--Sobic006G146400 Sobic006G222650--Sobic004G302400 Sobic006G222650--Sobic010G035300 Sobic006G222650--Sobic002G116300 Sobic006G222650--Sobic006G146400 Sobic006G222650--Sobic004G269500 Sobic006G280900 Sobic006G280900 Sobic006G222650--Sobic006G280900 Sobic006G222650--Sobic004G302550 Sobic006G162300 Sobic006G162300 Sobic006G222650--Sobic006G162300 Sobic006G222650--Sobic002G065300 Sobic010G035300--Sobic006G222650 Sobic010G035300--Sobic002G116300 Sobic010G035300--Sobic004G302400 Sobic010G035300--Sobic006G162300 Sobic006G222800 Sobic006G222800 Sobic010G035300--Sobic006G222800 Sobic007G161450 Sobic007G161450 Sobic010G035300--Sobic007G161450 Sobic004G001900 Sobic004G001900 Sobic010G035300--Sobic004G001900 Sobic005G091400 Sobic005G091400 Sobic010G035300--Sobic005G091400 Sobic010G035300--Sobic004G269500 Sobic004G302400--Sobic006G222650 Sobic004G302400--Sobic009G174600 Sobic004G302400--Sobic010G035300 Sobic004G302400--Sobic002G116300 Sobic004G302400--Sobic006G162300 Sobic004G302400--Sobic002G065300 Sobic009G238200 Sobic009G238200 Sobic004G302400--Sobic009G238200 Sobic004G302400--Sobic006G146400 Sobic004G302400--Sobic006G280900 Sobic004G177400 Sobic004G177400 Sobic004G302550--Sobic004G177400 Sobic004G302550--Sobic006G222650 Sobic004G302550--Sobic005G091400 Sobic004G302550--Sobic004G302400 Sobic008G173700 Sobic008G173700 Sobic004G302550--Sobic008G173700 Sobic004G302550--Sobic002G065300 Sobic004G211501 Sobic004G211501 Sobic004G302550--Sobic004G211501 Sobic004G302550--Sobic004G269500 Sobic004G302550--Sobic010G035300 Sobic002G065300--Sobic009G174600 Sobic002G065300--Sobic004G302400 Sobic002G065300--Sobic006G222650 Sobic002G065300--Sobic002G116300 Sobic002G065300--Sobic004G302550 Sobic008G112400 Sobic008G112400 Sobic002G065300--Sobic008G112400 Sobic002G065300--Sobic004G269500 Sobic002G065300--Sobic004G177400 Sobic001G543600 Sobic001G543600 Sobic002G065300--Sobic001G543600 Sobic009G174600--Sobic004G302400 Sobic009G174600--Sobic002G065300 Sobic009G174600--Sobic002G116300 Sobic009G174600--Sobic006G222650 Sobic009G174600--Sobic001G543600 Sobic002G285800 Sobic002G285800 Sobic009G174600--Sobic002G285800 Sobic006G103601 Sobic006G103601 Sobic009G174600--Sobic006G103601 Sobic009G174600--Sobic010G035300 Sobic009G174600--Sobic009G238200 Sobic002G116300--Sobic010G035300 Sobic002G116300--Sobic004G302400 Sobic002G116300--Sobic006G222650 Sobic002G116300--Sobic009G238200 Sobic002G116300--Sobic006G146400 Sobic008G119000 Sobic008G119000 Sobic002G116300--Sobic008G119000 Sobic002G116300--Sobic006G222800 Sobic002G247100 Sobic002G247100 Sobic002G116300--Sobic002G247100 Sobic002G116300--Sobic009G174600 Sobic008G164525 Sobic008G164525 Sobic004G314750--Sobic008G164525 Sobic001G434450 Sobic001G434450 Sobic004G314750--Sobic001G434450 Sobic006G094400 Sobic006G094400 Sobic004G314750--Sobic006G094400 Sobic006G256801 Sobic006G256801 Sobic004G314750--Sobic006G256801 Sobic002G114600 Sobic002G114600 Sobic004G314750--Sobic002G114600 Sobic010G244701 Sobic010G244701 Sobic004G314750--Sobic010G244701 Sobic003G008850 Sobic003G008850 Sobic004G314750--Sobic003G008850 Sobic009G094000 Sobic009G094000 Sobic004G314750--Sobic009G094000 Sobic004G314750--Sobic006G222800 Sobic006G146400--Sobic006G280900 Sobic006G146400--Sobic006G222650 Sobic006G146400--Sobic002G116300 Sobic006G146400--Sobic009G238200 Sobic001G537600 Sobic001G537600 Sobic006G146400--Sobic001G537600 Sobic006G146400--Sobic004G302400 Sobic006G146400--Sobic010G035300 Sobic006G146400--Sobic006G103601 Sobic003G379500 Sobic003G379500 Sobic006G146400--Sobic003G379500
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.