Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G018133.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0W1Y5
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) Zm00025a016211 , Zm00025a031023
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G217001 - -
2 Sobic.003G155350 - -
3 Sobic.005G083866 - -
4 Sobic.004G184500 nucleoside diphosphate kinase, putative, expressed K00940: ndk, nucleoside-diphosphate kinase
5 Sobic.005G094500 senescence-induced receptor-like serine/threonine-protein kinase precursor, putative, expressed -
6 Sobic.002G138200 domain of unknown function DUF966 domain containing protein, expressed -
7 Sobic.001G468200 MT-A70 domain containing protein, expressed -
8 Sobic.004G288900 protein kinase, putative, expressed -
9 Sobic.008G166250 - -
10 Sobic.003G043650 - -
11 Sobic.007G081400 - -
12 Sobic.004G200000 expressed protein -
13 Sobic.002G395900 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@nodulation protein-related, putative, expressed -
14 Sobic.007G157200 - -
15 Sobic.001G176800 - -
16 Sobic.002G076932 - -
17 Sobic.009G184500 cysteine proteinase inhibitor precursor protein, putative, expressed -
18 Sobic.010G041500 dual specificity protein phosphatase, putative, expressed -
19 Sobic.006G154900 mitochondrial carrier protein, putative, expressed -
20 Sobic.007G017300 endoglucanase, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic002G018133 Sobic002G018133 Sobic010G217001 Sobic010G217001 Sobic002G018133--Sobic010G217001 Sobic003G155350 Sobic003G155350 Sobic002G018133--Sobic003G155350 Sobic005G083866 Sobic005G083866 Sobic002G018133--Sobic005G083866 Sobic004G184500 Sobic004G184500 Sobic002G018133--Sobic004G184500 Sobic005G094500 Sobic005G094500 Sobic002G018133--Sobic005G094500 Sobic002G138200 Sobic002G138200 Sobic002G018133--Sobic002G138200 Sobic001G468200 Sobic001G468200 Sobic002G018133--Sobic001G468200 Sobic004G288900 Sobic004G288900 Sobic002G018133--Sobic004G288900 Sobic008G166250 Sobic008G166250 Sobic002G018133--Sobic008G166250 Sobic010G217001--Sobic002G018133 Sobic007G081400 Sobic007G081400 Sobic010G217001--Sobic007G081400 Sobic002G231400 Sobic002G231400 Sobic010G217001--Sobic002G231400 Sobic002G030001 Sobic002G030001 Sobic010G217001--Sobic002G030001 Sobic010G217001--Sobic005G083866 Sobic010G217001--Sobic004G288900 Sobic003G043650 Sobic003G043650 Sobic010G217001--Sobic003G043650 Sobic010G217001--Sobic002G138200 Sobic001G316500 Sobic001G316500 Sobic010G217001--Sobic001G316500 Sobic003G155350--Sobic004G184500 Sobic003G155350--Sobic001G468200 Sobic003G155350--Sobic005G094500 Sobic003G155350--Sobic008G166250 Sobic007G017300 Sobic007G017300 Sobic003G155350--Sobic007G017300 Sobic003G155350--Sobic002G018133 Sobic002G346250 Sobic002G346250 Sobic003G155350--Sobic002G346250 Sobic001G368000 Sobic001G368000 Sobic003G155350--Sobic001G368000 Sobic002G395900 Sobic002G395900 Sobic003G155350--Sobic002G395900 Sobic005G083866--Sobic003G043650 Sobic004G200000 Sobic004G200000 Sobic005G083866--Sobic004G200000 Sobic007G016300 Sobic007G016300 Sobic005G083866--Sobic007G016300 Sobic002G331200 Sobic002G331200 Sobic005G083866--Sobic002G331200 Sobic001G311700 Sobic001G311700 Sobic005G083866--Sobic001G311700 Sobic005G083866--Sobic002G030001 Sobic005G083866--Sobic002G018133 Sobic005G083866--Sobic007G081400 Sobic010G041500 Sobic010G041500 Sobic005G083866--Sobic010G041500 Sobic004G184500--Sobic008G166250 Sobic004G184500--Sobic003G155350 Sobic004G184500--Sobic005G094500 Sobic001G176800 Sobic001G176800 Sobic004G184500--Sobic001G176800 Sobic001G212701 Sobic001G212701 Sobic004G184500--Sobic001G212701 Sobic002G114600 Sobic002G114600 Sobic004G184500--Sobic002G114600 Sobic004G184500--Sobic001G468200 Sobic003G202900 Sobic003G202900 Sobic004G184500--Sobic003G202900 Sobic004G314750 Sobic004G314750 Sobic004G184500--Sobic004G314750 Sobic005G094500--Sobic002G395900 Sobic005G094500--Sobic004G184500 Sobic005G094500--Sobic003G202900 Sobic005G094500--Sobic003G155350 Sobic002G076932 Sobic002G076932 Sobic005G094500--Sobic002G076932 Sobic009G170301 Sobic009G170301 Sobic005G094500--Sobic009G170301 Sobic005G094500--Sobic001G176800 Sobic005G094500--Sobic008G166250 Sobic005G094500--Sobic007G017300 Sobic002G138200--Sobic004G288900 Sobic002G138200--Sobic003G043650 Sobic004G047001 Sobic004G047001 Sobic002G138200--Sobic004G047001 Sobic003G093500 Sobic003G093500 Sobic002G138200--Sobic003G093500 Sobic009G184500 Sobic009G184500 Sobic002G138200--Sobic009G184500 Sobic001G214400 Sobic001G214400 Sobic002G138200--Sobic001G214400 Sobic002G138200--Sobic010G041500 Sobic002G138200--Sobic005G094500 Sobic002G138200--Sobic007G017300 Sobic001G468200--Sobic003G155350 Sobic001G468200--Sobic007G017300 Sobic001G483200 Sobic001G483200 Sobic001G468200--Sobic001G483200 Sobic001G468200--Sobic001G368000 Sobic001G468200--Sobic001G176800 Sobic001G468200--Sobic004G184500 Sobic001G468200--Sobic005G094500 Sobic001G468200--Sobic003G202900 Sobic001G468200--Sobic009G170301 Sobic001G312801 Sobic001G312801 Sobic004G288900--Sobic001G312801 Sobic004G288900--Sobic002G138200 Sobic004G288900--Sobic003G043650 Sobic004G288900--Sobic009G184500 Sobic004G288900--Sobic010G041500 Sobic008G096300 Sobic008G096300 Sobic004G288900--Sobic008G096300 Sobic001G490600 Sobic001G490600 Sobic004G288900--Sobic001G490600 Sobic004G288900--Sobic009G170301 Sobic003G241600 Sobic003G241600 Sobic004G288900--Sobic003G241600 Sobic008G166250--Sobic004G184500 Sobic008G166250--Sobic005G094500 Sobic008G166250--Sobic003G155350 Sobic008G166250--Sobic004G314750 Sobic001G204200 Sobic001G204200 Sobic008G166250--Sobic001G204200 Sobic008G054400 Sobic008G054400 Sobic008G166250--Sobic008G054400 Sobic008G166250--Sobic002G114600 Sobic008G166250--Sobic001G212701 Sobic009G094000 Sobic009G094000 Sobic008G166250--Sobic009G094000
Octagon: transcription factors


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