Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G076932.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0W2X6
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) Zm00025a045402
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G170301 - -
2 Sobic.005G094500 senescence-induced receptor-like serine/threonine-protein kinase precursor, putative, expressed -
3 Sobic.001G204200 acetyltransferase, GNAT family, putative, expressed -
4 Sobic.008G054400 expressed protein -
5 Sobic.010G041500 dual specificity protein phosphatase, putative, expressed -
6 Sobic.008G166250 - -
7 Sobic.004G184500 nucleoside diphosphate kinase, putative, expressed K00940: ndk, nucleoside-diphosphate kinase
8 Sobic.003G202900 expressed protein -
9 Sobic.001G212701 - -
10 Sobic.001G490600 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@ribosomal L18p/L5e family protein, putative, expressed -
11 Sobic.002G395900 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@nodulation protein-related, putative, expressed -
12 Sobic.009G184500 cysteine proteinase inhibitor precursor protein, putative, expressed -
13 Sobic.001G368000 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@annexin, putative, expressed -
14 Sobic.002G018133 - -
15 Sobic.003G155350 - -
16 Sobic.004G102301 - -
17 Sobic.007G157200 - -
18 Sobic.002G138200 domain of unknown function DUF966 domain containing protein, expressed -
19 Sobic.010G244701 - -
20 Sobic.001G468200 MT-A70 domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic002G076932 Sobic002G076932 Sobic009G170301 Sobic009G170301 Sobic002G076932--Sobic009G170301 Sobic005G094500 Sobic005G094500 Sobic002G076932--Sobic005G094500 Sobic001G204200 Sobic001G204200 Sobic002G076932--Sobic001G204200 Sobic008G054400 Sobic008G054400 Sobic002G076932--Sobic008G054400 Sobic010G041500 Sobic010G041500 Sobic002G076932--Sobic010G041500 Sobic008G166250 Sobic008G166250 Sobic002G076932--Sobic008G166250 Sobic004G184500 Sobic004G184500 Sobic002G076932--Sobic004G184500 Sobic003G202900 Sobic003G202900 Sobic002G076932--Sobic003G202900 Sobic001G212701 Sobic001G212701 Sobic002G076932--Sobic001G212701 Sobic009G170301--Sobic002G076932 Sobic009G170301--Sobic005G094500 Sobic009G170301--Sobic010G041500 Sobic001G368000 Sobic001G368000 Sobic009G170301--Sobic001G368000 Sobic009G170301--Sobic003G202900 Sobic002G395900 Sobic002G395900 Sobic009G170301--Sobic002G395900 Sobic001G468200 Sobic001G468200 Sobic009G170301--Sobic001G468200 Sobic001G490600 Sobic001G490600 Sobic009G170301--Sobic001G490600 Sobic007G017300 Sobic007G017300 Sobic009G170301--Sobic007G017300 Sobic005G094500--Sobic002G395900 Sobic005G094500--Sobic004G184500 Sobic005G094500--Sobic003G202900 Sobic003G155350 Sobic003G155350 Sobic005G094500--Sobic003G155350 Sobic005G094500--Sobic002G076932 Sobic005G094500--Sobic009G170301 Sobic001G176800 Sobic001G176800 Sobic005G094500--Sobic001G176800 Sobic005G094500--Sobic008G166250 Sobic005G094500--Sobic007G017300 Sobic009G258150 Sobic009G258150 Sobic001G204200--Sobic009G258150 Sobic009G250800 Sobic009G250800 Sobic001G204200--Sobic009G250800 Sobic006G103601 Sobic006G103601 Sobic001G204200--Sobic006G103601 Sobic010G244701 Sobic010G244701 Sobic001G204200--Sobic010G244701 Sobic010G257300 Sobic010G257300 Sobic001G204200--Sobic010G257300 Sobic001G204200--Sobic002G076932 Sobic001G204200--Sobic008G166250 Sobic001G204200--Sobic005G094500 Sobic003G379500 Sobic003G379500 Sobic001G204200--Sobic003G379500 Sobic008G054400--Sobic008G166250 Sobic008G054400--Sobic002G076932 Sobic008G054400--Sobic005G094500 Sobic008G054400--Sobic001G204200 Sobic008G054400--Sobic004G184500 Sobic002G065300 Sobic002G065300 Sobic008G054400--Sobic002G065300 Sobic008G054400--Sobic009G170301 Sobic009G094000 Sobic009G094000 Sobic008G054400--Sobic009G094000 Sobic008G054400--Sobic010G244701 Sobic010G041500--Sobic009G170301 Sobic004G288900 Sobic004G288900 Sobic010G041500--Sobic004G288900 Sobic003G043650 Sobic003G043650 Sobic010G041500--Sobic003G043650 Sobic010G041500--Sobic002G076932 Sobic002G138200 Sobic002G138200 Sobic010G041500--Sobic002G138200 Sobic009G184500 Sobic009G184500 Sobic010G041500--Sobic009G184500 Sobic009G122201 Sobic009G122201 Sobic010G041500--Sobic009G122201 Sobic005G083866 Sobic005G083866 Sobic010G041500--Sobic005G083866 Sobic010G041500--Sobic001G490600 Sobic008G166250--Sobic004G184500 Sobic008G166250--Sobic005G094500 Sobic008G166250--Sobic003G155350 Sobic004G314750 Sobic004G314750 Sobic008G166250--Sobic004G314750 Sobic008G166250--Sobic001G204200 Sobic008G166250--Sobic008G054400 Sobic002G114600 Sobic002G114600 Sobic008G166250--Sobic002G114600 Sobic008G166250--Sobic001G212701 Sobic008G166250--Sobic009G094000 Sobic004G184500--Sobic008G166250 Sobic004G184500--Sobic003G155350 Sobic004G184500--Sobic005G094500 Sobic004G184500--Sobic001G176800 Sobic004G184500--Sobic001G212701 Sobic004G184500--Sobic002G114600 Sobic004G184500--Sobic001G468200 Sobic004G184500--Sobic003G202900 Sobic004G184500--Sobic004G314750 Sobic003G202900--Sobic002G395900 Sobic003G202900--Sobic005G094500 Sobic003G202900--Sobic001G176800 Sobic009G045100 Sobic009G045100 Sobic003G202900--Sobic009G045100 Sobic003G202900--Sobic004G184500 Sobic003G202900--Sobic001G468200 Sobic003G202900--Sobic009G170301 Sobic003G202900--Sobic007G017300 Sobic003G202900--Sobic001G368000 Sobic007G157200 Sobic007G157200 Sobic001G212701--Sobic007G157200 Sobic001G212701--Sobic002G114600 Sobic010G132300 Sobic010G132300 Sobic001G212701--Sobic010G132300 Sobic001G212701--Sobic004G184500 Sobic001G212701--Sobic004G314750 Sobic007G174100 Sobic007G174100 Sobic001G212701--Sobic007G174100 Sobic002G326200 Sobic002G326200 Sobic001G212701--Sobic002G326200 Sobic001G212701--Sobic001G176800 Sobic001G212701--Sobic005G094500
Octagon: transcription factors


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