Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G054400.1
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6PBQ0
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g58180.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G166250 - -
2 Sobic.002G076932 - -
3 Sobic.005G094500 senescence-induced receptor-like serine/threonine-protein kinase precursor, putative, expressed -
4 Sobic.001G204200 acetyltransferase, GNAT family, putative, expressed -
5 Sobic.004G184500 nucleoside diphosphate kinase, putative, expressed K00940: ndk, nucleoside-diphosphate kinase
6 Sobic.002G065300 OsSub58 - Putative Subtilisin homologue, expressed -
7 Sobic.009G170301 - -
8 Sobic.009G094000 - -
9 Sobic.010G244701 - -
10 Sobic.005G083866 - -
11 Sobic.009G250800 Up-reguralion under heat(PubMedID : 24916767)@polygalacturonase, putative, expressed -
12 Sobic.003G043650 - -
13 Sobic.004G314750 - -
14 Sobic.001G434450 - K13101: G patch domain and KOW motifs-containing protein
15 Sobic.009G082500 - -
16 Sobic.003G202900 expressed protein -
17 Sobic.004G269500 transcription factor TF2, putative, expressed -
18 Sobic.010G041500 dual specificity protein phosphatase, putative, expressed -
19 Sobic.002G030001 - -
20 Sobic.003G155350 - -


Gene co-expression network
sample Sobic008G054400 Sobic008G054400 Sobic008G166250 Sobic008G166250 Sobic008G054400--Sobic008G166250 Sobic002G076932 Sobic002G076932 Sobic008G054400--Sobic002G076932 Sobic005G094500 Sobic005G094500 Sobic008G054400--Sobic005G094500 Sobic001G204200 Sobic001G204200 Sobic008G054400--Sobic001G204200 Sobic004G184500 Sobic004G184500 Sobic008G054400--Sobic004G184500 Sobic002G065300 Sobic002G065300 Sobic008G054400--Sobic002G065300 Sobic009G170301 Sobic009G170301 Sobic008G054400--Sobic009G170301 Sobic009G094000 Sobic009G094000 Sobic008G054400--Sobic009G094000 Sobic010G244701 Sobic010G244701 Sobic008G054400--Sobic010G244701 Sobic008G166250--Sobic004G184500 Sobic008G166250--Sobic005G094500 Sobic003G155350 Sobic003G155350 Sobic008G166250--Sobic003G155350 Sobic004G314750 Sobic004G314750 Sobic008G166250--Sobic004G314750 Sobic008G166250--Sobic001G204200 Sobic008G166250--Sobic008G054400 Sobic002G114600 Sobic002G114600 Sobic008G166250--Sobic002G114600 Sobic001G212701 Sobic001G212701 Sobic008G166250--Sobic001G212701 Sobic008G166250--Sobic009G094000 Sobic002G076932--Sobic009G170301 Sobic002G076932--Sobic005G094500 Sobic002G076932--Sobic001G204200 Sobic002G076932--Sobic008G054400 Sobic010G041500 Sobic010G041500 Sobic002G076932--Sobic010G041500 Sobic002G076932--Sobic008G166250 Sobic002G076932--Sobic004G184500 Sobic003G202900 Sobic003G202900 Sobic002G076932--Sobic003G202900 Sobic002G076932--Sobic001G212701 Sobic002G395900 Sobic002G395900 Sobic005G094500--Sobic002G395900 Sobic005G094500--Sobic004G184500 Sobic005G094500--Sobic003G202900 Sobic005G094500--Sobic003G155350 Sobic005G094500--Sobic002G076932 Sobic005G094500--Sobic009G170301 Sobic001G176800 Sobic001G176800 Sobic005G094500--Sobic001G176800 Sobic005G094500--Sobic008G166250 Sobic007G017300 Sobic007G017300 Sobic005G094500--Sobic007G017300 Sobic009G258150 Sobic009G258150 Sobic001G204200--Sobic009G258150 Sobic009G250800 Sobic009G250800 Sobic001G204200--Sobic009G250800 Sobic006G103601 Sobic006G103601 Sobic001G204200--Sobic006G103601 Sobic001G204200--Sobic010G244701 Sobic010G257300 Sobic010G257300 Sobic001G204200--Sobic010G257300 Sobic001G204200--Sobic002G076932 Sobic001G204200--Sobic008G166250 Sobic001G204200--Sobic005G094500 Sobic003G379500 Sobic003G379500 Sobic001G204200--Sobic003G379500 Sobic004G184500--Sobic008G166250 Sobic004G184500--Sobic003G155350 Sobic004G184500--Sobic005G094500 Sobic004G184500--Sobic001G176800 Sobic004G184500--Sobic001G212701 Sobic004G184500--Sobic002G114600 Sobic001G468200 Sobic001G468200 Sobic004G184500--Sobic001G468200 Sobic004G184500--Sobic003G202900 Sobic004G184500--Sobic004G314750 Sobic009G174600 Sobic009G174600 Sobic002G065300--Sobic009G174600 Sobic004G302400 Sobic004G302400 Sobic002G065300--Sobic004G302400 Sobic006G222650 Sobic006G222650 Sobic002G065300--Sobic006G222650 Sobic002G116300 Sobic002G116300 Sobic002G065300--Sobic002G116300 Sobic004G302550 Sobic004G302550 Sobic002G065300--Sobic004G302550 Sobic008G112400 Sobic008G112400 Sobic002G065300--Sobic008G112400 Sobic004G269500 Sobic004G269500 Sobic002G065300--Sobic004G269500 Sobic004G177400 Sobic004G177400 Sobic002G065300--Sobic004G177400 Sobic001G543600 Sobic001G543600 Sobic002G065300--Sobic001G543600 Sobic009G170301--Sobic002G076932 Sobic009G170301--Sobic005G094500 Sobic009G170301--Sobic010G041500 Sobic001G368000 Sobic001G368000 Sobic009G170301--Sobic001G368000 Sobic009G170301--Sobic003G202900 Sobic009G170301--Sobic002G395900 Sobic009G170301--Sobic001G468200 Sobic001G490600 Sobic001G490600 Sobic009G170301--Sobic001G490600 Sobic009G170301--Sobic007G017300 Sobic001G434450 Sobic001G434450 Sobic009G094000--Sobic001G434450 Sobic006G094400 Sobic006G094400 Sobic009G094000--Sobic006G094400 Sobic009G094000--Sobic004G314750 Sobic006G256801 Sobic006G256801 Sobic009G094000--Sobic006G256801 Sobic008G164525 Sobic008G164525 Sobic009G094000--Sobic008G164525 Sobic004G001900 Sobic004G001900 Sobic009G094000--Sobic004G001900 Sobic002G165401 Sobic002G165401 Sobic009G094000--Sobic002G165401 Sobic004G279150 Sobic004G279150 Sobic009G094000--Sobic004G279150 Sobic003G101600 Sobic003G101600 Sobic009G094000--Sobic003G101600 Sobic010G244701--Sobic006G256801 Sobic010G244701--Sobic003G379500 Sobic010G244701--Sobic004G314750 Sobic010G244701--Sobic001G434450 Sobic010G244701--Sobic008G164525 Sobic001G089200 Sobic001G089200 Sobic010G244701--Sobic001G089200 Sobic001G115900 Sobic001G115900 Sobic010G244701--Sobic001G115900 Sobic010G244701--Sobic009G258150 Sobic009G085600 Sobic009G085600 Sobic010G244701--Sobic009G085600
Octagon: transcription factors


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