Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G541166.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5SCC7
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g01330.1 : sodium/potassium/calcium exchanger 1, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G091400 - -
2 Sobic.006G162300 expressed protein -
3 Sobic.004G302550 - -
4 Sobic.004G211501 - -
5 Sobic.004G302400 NAC domain containing protein, putative, expressed -
6 Sobic.006G222650 - -
7 Sobic.003G385800 - -
8 Sobic.008G152100 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
9 Sobic.010G035300 WRKY73, expressed -
10 Sobic.002G116300 poly synthetase 1, putative, expressed K10798: poly [ADP-ribose] polymerase 2/3/4
11 Sobic.008G173700 cyclic nucleotide-gated ion channel, putative, expressed K05391: cyclic nucleotide gated channel, plant
12 Sobic.004G177400 T-complex protein 11, putative, expressed -
13 Sobic.006G180500 - -
14 Sobic.009G039300 short-chain dehydrogenase/reductase, putative, expressed -
15 Sobic.004G001900 expressed protein -
16 Sobic.002G065300 OsSub58 - Putative Subtilisin homologue, expressed -
17 Sobic.008G119000 cysteine protease, putative, expressed -
18 Sobic.002G247100 expressed protein -
19 Sobic.006G222800 NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed -
20 Sobic.002G165401 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G541166 Sobic001G541166 Sobic005G091400 Sobic005G091400 Sobic001G541166--Sobic005G091400 Sobic006G162300 Sobic006G162300 Sobic001G541166--Sobic006G162300 Sobic004G302550 Sobic004G302550 Sobic001G541166--Sobic004G302550 Sobic004G211501 Sobic004G211501 Sobic001G541166--Sobic004G211501 Sobic004G302400 Sobic004G302400 Sobic001G541166--Sobic004G302400 Sobic006G222650 Sobic006G222650 Sobic001G541166--Sobic006G222650 Sobic003G385800 Sobic003G385800 Sobic001G541166--Sobic003G385800 Sobic008G152100 Sobic008G152100 Sobic001G541166--Sobic008G152100 Sobic010G035300 Sobic010G035300 Sobic001G541166--Sobic010G035300 Sobic005G091400--Sobic001G541166 Sobic005G091400--Sobic006G162300 Sobic005G091400--Sobic004G211501 Sobic005G091400--Sobic004G302550 Sobic005G091400--Sobic010G035300 Sobic005G091400--Sobic004G302400 Sobic005G091400--Sobic006G222650 Sobic002G116300 Sobic002G116300 Sobic005G091400--Sobic002G116300 Sobic004G001900 Sobic004G001900 Sobic005G091400--Sobic004G001900 Sobic006G162300--Sobic005G091400 Sobic006G162300--Sobic004G211501 Sobic007G161450 Sobic007G161450 Sobic006G162300--Sobic007G161450 Sobic006G162300--Sobic010G035300 Sobic006G162300--Sobic004G302400 Sobic006G162300--Sobic006G222650 Sobic006G180500 Sobic006G180500 Sobic006G162300--Sobic006G180500 Sobic008G119000 Sobic008G119000 Sobic006G162300--Sobic008G119000 Sobic009G085600 Sobic009G085600 Sobic006G162300--Sobic009G085600 Sobic004G177400 Sobic004G177400 Sobic004G302550--Sobic004G177400 Sobic004G302550--Sobic006G222650 Sobic004G302550--Sobic005G091400 Sobic004G302550--Sobic004G302400 Sobic008G173700 Sobic008G173700 Sobic004G302550--Sobic008G173700 Sobic002G065300 Sobic002G065300 Sobic004G302550--Sobic002G065300 Sobic004G302550--Sobic004G211501 Sobic004G269500 Sobic004G269500 Sobic004G302550--Sobic004G269500 Sobic004G302550--Sobic010G035300 Sobic004G211501--Sobic006G162300 Sobic004G211501--Sobic007G161450 Sobic004G211501--Sobic005G091400 Sobic004G211501--Sobic004G001900 Sobic004G211501--Sobic010G035300 Sobic004G211501--Sobic004G302550 Sobic001G520700 Sobic001G520700 Sobic004G211501--Sobic001G520700 Sobic004G211501--Sobic006G180500 Sobic004G211501--Sobic004G302400 Sobic004G302400--Sobic006G222650 Sobic009G174600 Sobic009G174600 Sobic004G302400--Sobic009G174600 Sobic004G302400--Sobic010G035300 Sobic004G302400--Sobic002G116300 Sobic004G302400--Sobic006G162300 Sobic004G302400--Sobic002G065300 Sobic009G238200 Sobic009G238200 Sobic004G302400--Sobic009G238200 Sobic006G146400 Sobic006G146400 Sobic004G302400--Sobic006G146400 Sobic006G280900 Sobic006G280900 Sobic004G302400--Sobic006G280900 Sobic006G222650--Sobic004G302400 Sobic006G222650--Sobic010G035300 Sobic006G222650--Sobic002G116300 Sobic006G222650--Sobic006G146400 Sobic006G222650--Sobic004G269500 Sobic006G222650--Sobic006G280900 Sobic006G222650--Sobic004G302550 Sobic006G222650--Sobic006G162300 Sobic006G222650--Sobic002G065300 Sobic003G385800--Sobic008G152100 Sobic003G385800--Sobic001G541166 Sobic003G385800--Sobic006G180500 Sobic003G385800--Sobic005G091400 Sobic002G165401 Sobic002G165401 Sobic003G385800--Sobic002G165401 Sobic003G385800--Sobic008G119000 Sobic003G385800--Sobic001G520700 Sobic001G481201 Sobic001G481201 Sobic003G385800--Sobic001G481201 Sobic009G082400 Sobic009G082400 Sobic003G385800--Sobic009G082400 Sobic005G077532 Sobic005G077532 Sobic008G152100--Sobic005G077532 Sobic008G152100--Sobic003G385800 Sobic008G152100--Sobic001G541166 Sobic010G009532 Sobic010G009532 Sobic008G152100--Sobic010G009532 Sobic006G181150 Sobic006G181150 Sobic008G152100--Sobic006G181150 Sobic008G152100--Sobic005G091400 Sobic004G230500 Sobic004G230500 Sobic008G152100--Sobic004G230500 Sobic007G045800 Sobic007G045800 Sobic008G152100--Sobic007G045800 Sobic008G152100--Sobic002G165401 Sobic010G035300--Sobic006G222650 Sobic010G035300--Sobic002G116300 Sobic010G035300--Sobic004G302400 Sobic010G035300--Sobic006G162300 Sobic006G222800 Sobic006G222800 Sobic010G035300--Sobic006G222800 Sobic010G035300--Sobic007G161450 Sobic010G035300--Sobic004G001900 Sobic010G035300--Sobic005G091400 Sobic010G035300--Sobic004G269500
Octagon: transcription factors


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