Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G152100.2
Synonym Sb08g020130
Functional annotation zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed
UniProt A0A1Z5R6U9
Pfam PF13639
Panther DB PTHR14155 PTHR14155:SF185
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0008270; zinc ion binding GO:0005515protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G18930 : RING/U-box superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g40460.1 : zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a004546 , Zm00025a025233
Brachypodium KQJ86006
Barley HORVU5Hr1G016710.1 , HORVU5Hr1G016710.2 , HORVU5Hr1G016710.3
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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19 Sobic.006G222800 NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed -
20 Sobic.002G114600 - -


Gene co-expression network
sample Sobic008G152100 Sobic008G152100 Sobic005G077532 Sobic005G077532 Sobic008G152100--Sobic005G077532 Sobic003G385800 Sobic003G385800 Sobic008G152100--Sobic003G385800 Sobic001G541166 Sobic001G541166 Sobic008G152100--Sobic001G541166 Sobic010G009532 Sobic010G009532 Sobic008G152100--Sobic010G009532 Sobic006G181150 Sobic006G181150 Sobic008G152100--Sobic006G181150 Sobic005G091400 Sobic005G091400 Sobic008G152100--Sobic005G091400 Sobic004G230500 Sobic004G230500 Sobic008G152100--Sobic004G230500 Sobic007G045800 Sobic007G045800 Sobic008G152100--Sobic007G045800 Sobic002G165401 Sobic002G165401 Sobic008G152100--Sobic002G165401 Sobic005G077532--Sobic008G152100 Sobic001G501500 Sobic001G501500 Sobic005G077532--Sobic001G501500 Sobic005G077532--Sobic004G230500 Sobic005G077532--Sobic006G181150 Sobic005G077532--Sobic010G009532 Sobic001G180500 Sobic001G180500 Sobic005G077532--Sobic001G180500 Sobic005G077532--Sobic001G541166 Sobic005G077532--Sobic007G045800 Sobic005G077532--Sobic003G385800 Sobic003G385800--Sobic008G152100 Sobic003G385800--Sobic001G541166 Sobic006G180500 Sobic006G180500 Sobic003G385800--Sobic006G180500 Sobic003G385800--Sobic005G091400 Sobic003G385800--Sobic002G165401 Sobic008G119000 Sobic008G119000 Sobic003G385800--Sobic008G119000 Sobic001G520700 Sobic001G520700 Sobic003G385800--Sobic001G520700 Sobic001G481201 Sobic001G481201 Sobic003G385800--Sobic001G481201 Sobic009G082400 Sobic009G082400 Sobic003G385800--Sobic009G082400 Sobic001G541166--Sobic005G091400 Sobic006G162300 Sobic006G162300 Sobic001G541166--Sobic006G162300 Sobic004G302550 Sobic004G302550 Sobic001G541166--Sobic004G302550 Sobic004G211501 Sobic004G211501 Sobic001G541166--Sobic004G211501 Sobic004G302400 Sobic004G302400 Sobic001G541166--Sobic004G302400 Sobic006G222650 Sobic006G222650 Sobic001G541166--Sobic006G222650 Sobic001G541166--Sobic003G385800 Sobic001G541166--Sobic008G152100 Sobic010G035300 Sobic010G035300 Sobic001G541166--Sobic010G035300 Sobic010G009532--Sobic008G152100 Sobic004G047001 Sobic004G047001 Sobic010G009532--Sobic004G047001 Sobic001G214400 Sobic001G214400 Sobic010G009532--Sobic001G214400 Sobic010G009532--Sobic001G501500 Sobic007G090406 Sobic007G090406 Sobic010G009532--Sobic007G090406 Sobic010G097800 Sobic010G097800 Sobic010G009532--Sobic010G097800 Sobic010G009532--Sobic005G077532 Sobic008G192800 Sobic008G192800 Sobic010G009532--Sobic008G192800 Sobic001G176800 Sobic001G176800 Sobic010G009532--Sobic001G176800 Sobic006G181150--Sobic008G152100 Sobic006G181150--Sobic005G077532 Sobic009G250000 Sobic009G250000 Sobic006G181150--Sobic009G250000 Sobic006G181150--Sobic001G541166 Sobic008G173700 Sobic008G173700 Sobic006G181150--Sobic008G173700 Sobic007G016300 Sobic007G016300 Sobic006G181150--Sobic007G016300 Sobic006G181150--Sobic003G385800 Sobic006G181150--Sobic004G302550 Sobic002G331200 Sobic002G331200 Sobic006G181150--Sobic002G331200 Sobic005G091400--Sobic001G541166 Sobic005G091400--Sobic006G162300 Sobic005G091400--Sobic004G211501 Sobic005G091400--Sobic004G302550 Sobic005G091400--Sobic010G035300 Sobic005G091400--Sobic004G302400 Sobic005G091400--Sobic006G222650 Sobic002G116300 Sobic002G116300 Sobic005G091400--Sobic002G116300 Sobic004G001900 Sobic004G001900 Sobic005G091400--Sobic004G001900 Sobic004G230500--Sobic001G501500 Sobic004G230500--Sobic005G077532 Sobic004G230500--Sobic008G152100 Sobic004G230500--Sobic001G180500 Sobic004G230500--Sobic010G009532 Sobic006G165900 Sobic006G165900 Sobic004G230500--Sobic006G165900 Sobic004G230500--Sobic003G385800 Sobic001G353700 Sobic001G353700 Sobic004G230500--Sobic001G353700 Sobic004G179000 Sobic004G179000 Sobic004G230500--Sobic004G179000 Sobic007G045800--Sobic008G152100 Sobic009G151500 Sobic009G151500 Sobic007G045800--Sobic009G151500 Sobic007G045800--Sobic005G077532 Sobic007G045800--Sobic001G180500 Sobic007G045800--Sobic010G009532 Sobic007G045800--Sobic001G214400 Sobic009G031000 Sobic009G031000 Sobic007G045800--Sobic009G031000 Sobic003G294000 Sobic003G294000 Sobic007G045800--Sobic003G294000 Sobic003G235300 Sobic003G235300 Sobic007G045800--Sobic003G235300 Sobic002G165401--Sobic001G481201 Sobic006G222800 Sobic006G222800 Sobic002G165401--Sobic006G222800 Sobic002G165401--Sobic004G001900 Sobic002G165401--Sobic006G180500 Sobic002G165401--Sobic009G082400 Sobic006G256801 Sobic006G256801 Sobic002G165401--Sobic006G256801 Sobic007G204500 Sobic007G204500 Sobic002G165401--Sobic007G204500 Sobic003G008850 Sobic003G008850 Sobic002G165401--Sobic003G008850 Sobic006G094400 Sobic006G094400 Sobic002G165401--Sobic006G094400
Octagon: transcription factors


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