Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G520700.1
Synonym Sb01g048560
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1Z5SBL5
Pfam PF12854 PF13812 PF14432 PF13041 PF01535
Panther DB PTHR24015 PTHR24015:SF615
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G66520 : Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g34700.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a053473
Brachypodium KQK18840
Barley HORVU7Hr1G038530.1
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G481201 - -
2 Sobic.007G161450 - -
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14 Sobic.006G162300 expressed protein -
15 Sobic.001G537900 AGAP010609-PA, putative, expressed K17867: DPH4, diphthamide biosynthesis protein 4
16 Sobic.009G082400 - -
17 Sobic.007G116600 5-AMP-activated protein kinase beta-1 subunit-related, putative, expressed -
18 Sobic.006G019901 - -
19 Sobic.001G120100 DUF1295 domain containing protein, putative, expressed -
20 Sobic.007G013100 OsFBX142 - F-box domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G520700 Sobic001G520700 Sobic001G481201 Sobic001G481201 Sobic001G520700--Sobic001G481201 Sobic007G161450 Sobic007G161450 Sobic001G520700--Sobic007G161450 Sobic007G204500 Sobic007G204500 Sobic001G520700--Sobic007G204500 Sobic001G493800 Sobic001G493800 Sobic001G520700--Sobic001G493800 Sobic010G179150 Sobic010G179150 Sobic001G520700--Sobic010G179150 Sobic006G180500 Sobic006G180500 Sobic001G520700--Sobic006G180500 Sobic004G001900 Sobic004G001900 Sobic001G520700--Sobic004G001900 Sobic002G165401 Sobic002G165401 Sobic001G520700--Sobic002G165401 Sobic007G111600 Sobic007G111600 Sobic001G520700--Sobic007G111600 Sobic001G481201--Sobic002G165401 Sobic001G481201--Sobic007G204500 Sobic009G082400 Sobic009G082400 Sobic001G481201--Sobic009G082400 Sobic001G537900 Sobic001G537900 Sobic001G481201--Sobic001G537900 Sobic004G251350 Sobic004G251350 Sobic001G481201--Sobic004G251350 Sobic001G481201--Sobic010G179150 Sobic001G481201--Sobic001G520700 Sobic001G481201--Sobic006G180500 Sobic006G019901 Sobic006G019901 Sobic001G481201--Sobic006G019901 Sobic007G161450--Sobic007G204500 Sobic006G222800 Sobic006G222800 Sobic007G161450--Sobic006G222800 Sobic007G161450--Sobic006G180500 Sobic008G119000 Sobic008G119000 Sobic007G161450--Sobic008G119000 Sobic007G161450--Sobic007G111600 Sobic007G116600 Sobic007G116600 Sobic007G161450--Sobic007G116600 Sobic006G162300 Sobic006G162300 Sobic007G161450--Sobic006G162300 Sobic009G085600 Sobic009G085600 Sobic007G161450--Sobic009G085600 Sobic007G161450--Sobic004G001900 Sobic007G204500--Sobic007G111600 Sobic007G204500--Sobic004G251350 Sobic007G204500--Sobic010G179150 Sobic007G204500--Sobic007G161450 Sobic007G204500--Sobic007G116600 Sobic007G204500--Sobic008G119000 Sobic007G204500--Sobic001G537900 Sobic007G204500--Sobic006G180500 Sobic001G120100 Sobic001G120100 Sobic007G204500--Sobic001G120100 Sobic001G493800--Sobic010G179150 Sobic002G156300 Sobic002G156300 Sobic001G493800--Sobic002G156300 Sobic007G001300 Sobic007G001300 Sobic001G493800--Sobic007G001300 Sobic001G493800--Sobic001G537900 Sobic004G197300 Sobic004G197300 Sobic001G493800--Sobic004G197300 Sobic008G020300 Sobic008G020300 Sobic001G493800--Sobic008G020300 Sobic003G109400 Sobic003G109400 Sobic001G493800--Sobic003G109400 Sobic010G114400 Sobic010G114400 Sobic001G493800--Sobic010G114400 Sobic004G330400 Sobic004G330400 Sobic001G493800--Sobic004G330400 Sobic010G179150--Sobic007G111600 Sobic008G131800 Sobic008G131800 Sobic010G179150--Sobic008G131800 Sobic010G179150--Sobic004G197300 Sobic010G179150--Sobic004G251350 Sobic010G179150--Sobic007G204500 Sobic010G179150--Sobic001G537900 Sobic001G255700 Sobic001G255700 Sobic010G179150--Sobic001G255700 Sobic007G013100 Sobic007G013100 Sobic010G179150--Sobic007G013100 Sobic002G284800 Sobic002G284800 Sobic010G179150--Sobic002G284800 Sobic006G180500--Sobic008G119000 Sobic006G180500--Sobic007G204500 Sobic006G180500--Sobic009G085600 Sobic006G180500--Sobic004G251350 Sobic006G180500--Sobic006G222800 Sobic006G256801 Sobic006G256801 Sobic006G180500--Sobic006G256801 Sobic006G180500--Sobic002G165401 Sobic006G180500--Sobic007G116600 Sobic006G180500--Sobic007G111600 Sobic004G001900--Sobic002G165401 Sobic004G001900--Sobic006G222800 Sobic004G001900--Sobic006G180500 Sobic006G094400 Sobic006G094400 Sobic004G001900--Sobic006G094400 Sobic004G001900--Sobic007G161450 Sobic010G035300 Sobic010G035300 Sobic004G001900--Sobic010G035300 Sobic004G001900--Sobic007G204500 Sobic004G314750 Sobic004G314750 Sobic004G001900--Sobic004G314750 Sobic004G001900--Sobic001G481201 Sobic002G165401--Sobic001G481201 Sobic002G165401--Sobic006G222800 Sobic002G165401--Sobic004G001900 Sobic002G165401--Sobic006G180500 Sobic002G165401--Sobic009G082400 Sobic002G165401--Sobic006G256801 Sobic002G165401--Sobic007G204500 Sobic003G008850 Sobic003G008850 Sobic002G165401--Sobic003G008850 Sobic002G165401--Sobic006G094400 Sobic007G111600--Sobic008G131800 Sobic007G111600--Sobic010G179150 Sobic007G111600--Sobic004G251350 Sobic007G111600--Sobic007G204500 Sobic007G111600--Sobic007G116600 Sobic004G239000 Sobic004G239000 Sobic007G111600--Sobic004G239000 Sobic003G099500 Sobic003G099500 Sobic007G111600--Sobic003G099500 Sobic001G016900 Sobic001G016900 Sobic007G111600--Sobic001G016900 Sobic007G111600--Sobic007G013100
Octagon: transcription factors


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