Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G120100.2,Sobic.001G120100.1
Synonym Sb01g010610
Functional annotation DUF1295 domain containing protein, putative, expressed
UniProt A0A1B6QIK0 , A0A1B6QIK7
Pfam PF06966
Panther DB PTHR32251 PTHR32251:SF15
NCBI CDD KOG4650; Predicted steroid reductase
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G18180 : Protein of unknown function (DUF1295)
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g50070.1 : DUF1295 domain containing protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a017018
Brachypodium KQK13586 , PNT74249
Barley HORVU4Hr1G007090.1
Wheat TraesCS4B02G043600 , TraesCS4D02G041100 , TraesCS4A02G270500 , TraesCS4A02G270500
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G537900 AGAP010609-PA, putative, expressed K17867: DPH4, diphthamide biosynthesis protein 4
2 Sobic.004G016600 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
3 Sobic.007G111600 WRKY89, expressed -
4 Sobic.004G251350 - -
5 Sobic.001G016900 RNA-binding protein Luc7-like, putative, expressed -
6 Sobic.003G008850 - -
7 Sobic.010G179150 - -
8 Sobic.009G152901 - -
9 Sobic.007G204500 expressed protein -
10 Sobic.007G013100 OsFBX142 - F-box domain containing protein, expressed -
11 Sobic.008G131800 zinc knuckle family protein, expressed -
12 Sobic.004G239000 - -
13 Sobic.009G085600 acetyltransferase, GNAT family, putative, expressed -
14 Sobic.004G197300 - -
15 Sobic.007G116600 5-AMP-activated protein kinase beta-1 subunit-related, putative, expressed -
16 Sobic.002G004100 kinesin motor domain containing protein, putative, expressed K10405: kinesin family member C1
17 Sobic.008G020300 myb-like DNA-binding domain containing protein, putative, expressed K09422: transcription factor MYB, plant
18 Sobic.006G256801 - -
19 Sobic.001G255700 - -
20 Sobic.003G099500 invertase/pectin methylesterase inhibitor family protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G120100 Sobic001G120100 Sobic001G537900 Sobic001G537900 Sobic001G120100--Sobic001G537900 Sobic004G016600 Sobic004G016600 Sobic001G120100--Sobic004G016600 Sobic007G111600 Sobic007G111600 Sobic001G120100--Sobic007G111600 Sobic004G251350 Sobic004G251350 Sobic001G120100--Sobic004G251350 Sobic001G016900 Sobic001G016900 Sobic001G120100--Sobic001G016900 Sobic003G008850 Sobic003G008850 Sobic001G120100--Sobic003G008850 Sobic010G179150 Sobic010G179150 Sobic001G120100--Sobic010G179150 Sobic009G152901 Sobic009G152901 Sobic001G120100--Sobic009G152901 Sobic007G204500 Sobic007G204500 Sobic001G120100--Sobic007G204500 Sobic008G020300 Sobic008G020300 Sobic001G537900--Sobic008G020300 Sobic001G537900--Sobic001G120100 Sobic001G537900--Sobic010G179150 Sobic004G354800 Sobic004G354800 Sobic001G537900--Sobic004G354800 Sobic001G537900--Sobic004G251350 Sobic004G197300 Sobic004G197300 Sobic001G537900--Sobic004G197300 Sobic009G163500 Sobic009G163500 Sobic001G537900--Sobic009G163500 Sobic001G537900--Sobic003G008850 Sobic001G537900--Sobic007G111600 Sobic004G016600--Sobic001G120100 Sobic004G016600--Sobic001G016900 Sobic009G085600 Sobic009G085600 Sobic004G016600--Sobic009G085600 Sobic004G016600--Sobic004G251350 Sobic004G016600--Sobic001G537900 Sobic007G013100 Sobic007G013100 Sobic004G016600--Sobic007G013100 Sobic003G167825 Sobic003G167825 Sobic004G016600--Sobic003G167825 Sobic004G016600--Sobic007G111600 Sobic004G016600--Sobic009G152901 Sobic008G131800 Sobic008G131800 Sobic007G111600--Sobic008G131800 Sobic007G111600--Sobic010G179150 Sobic007G111600--Sobic004G251350 Sobic007G111600--Sobic007G204500 Sobic007G116600 Sobic007G116600 Sobic007G111600--Sobic007G116600 Sobic004G239000 Sobic004G239000 Sobic007G111600--Sobic004G239000 Sobic003G099500 Sobic003G099500 Sobic007G111600--Sobic003G099500 Sobic007G111600--Sobic001G016900 Sobic007G111600--Sobic007G013100 Sobic004G251350--Sobic007G111600 Sobic004G251350--Sobic010G179150 Sobic004G251350--Sobic007G204500 Sobic004G251350--Sobic008G131800 Sobic004G251350--Sobic001G537900 Sobic004G251350--Sobic001G120100 Sobic009G082400 Sobic009G082400 Sobic004G251350--Sobic009G082400 Sobic004G251350--Sobic004G016600 Sobic004G251350--Sobic007G013100 Sobic001G016900--Sobic004G239000 Sobic001G016900--Sobic003G099500 Sobic003G367401 Sobic003G367401 Sobic001G016900--Sobic003G367401 Sobic001G016900--Sobic007G111600 Sobic001G016900--Sobic008G131800 Sobic002G430200 Sobic002G430200 Sobic001G016900--Sobic002G430200 Sobic010G201000 Sobic010G201000 Sobic001G016900--Sobic010G201000 Sobic002G004100 Sobic002G004100 Sobic001G016900--Sobic002G004100 Sobic001G016900--Sobic004G016600 Sobic003G008850--Sobic001G537900 Sobic003G008850--Sobic001G120100 Sobic006G256801 Sobic006G256801 Sobic003G008850--Sobic006G256801 Sobic003G008850--Sobic004G016600 Sobic003G008850--Sobic008G020300 Sobic008G164525 Sobic008G164525 Sobic003G008850--Sobic008G164525 Sobic003G008850--Sobic007G204500 Sobic008G119000 Sobic008G119000 Sobic003G008850--Sobic008G119000 Sobic003G008850--Sobic004G251350 Sobic010G179150--Sobic007G111600 Sobic010G179150--Sobic008G131800 Sobic010G179150--Sobic004G197300 Sobic010G179150--Sobic004G251350 Sobic010G179150--Sobic007G204500 Sobic010G179150--Sobic001G537900 Sobic001G255700 Sobic001G255700 Sobic010G179150--Sobic001G255700 Sobic010G179150--Sobic007G013100 Sobic002G284800 Sobic002G284800 Sobic010G179150--Sobic002G284800 Sobic009G152901--Sobic004G239000 Sobic009G152901--Sobic001G016900 Sobic009G152901--Sobic003G367401 Sobic009G152901--Sobic001G120100 Sobic009G152901--Sobic004G016600 Sobic003G368150 Sobic003G368150 Sobic009G152901--Sobic003G368150 Sobic009G152901--Sobic004G197300 Sobic009G152901--Sobic001G537900 Sobic009G152901--Sobic010G201000 Sobic007G204500--Sobic007G111600 Sobic007G204500--Sobic004G251350 Sobic007G204500--Sobic010G179150 Sobic007G161450 Sobic007G161450 Sobic007G204500--Sobic007G161450 Sobic007G204500--Sobic007G116600 Sobic007G204500--Sobic008G119000 Sobic007G204500--Sobic001G537900 Sobic006G180500 Sobic006G180500 Sobic007G204500--Sobic006G180500 Sobic007G204500--Sobic001G120100
Octagon: transcription factors


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