Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G152901.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5R2U7
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium KQK19504 , PNT76630
Barley -
Wheat TraesCS6B02G084800
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G239000 - -
2 Sobic.001G016900 RNA-binding protein Luc7-like, putative, expressed -
3 Sobic.003G367401 - -
4 Sobic.001G120100 DUF1295 domain containing protein, putative, expressed -
5 Sobic.004G016600 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
6 Sobic.003G368150 - -
7 Sobic.004G197300 - -
8 Sobic.001G537900 AGAP010609-PA, putative, expressed K17867: DPH4, diphthamide biosynthesis protein 4
9 Sobic.010G201000 - -
10 Sobic.001G255700 - -
11 Sobic.008G131800 zinc knuckle family protein, expressed -
12 Sobic.007G122300 - -
13 Sobic.003G099500 invertase/pectin methylesterase inhibitor family protein, putative, expressed -
14 Sobic.004G354800 - -
15 Sobic.002G284800 expressed protein -
16 Sobic.002G430200 PSF2 - Putative GINS complex subunit, expressed K10733: GINS2, GINS complex subunit 2
17 Sobic.003G149900 PPR repeat domain containing protein, putative, expressed -
18 Sobic.008G020300 myb-like DNA-binding domain containing protein, putative, expressed K09422: transcription factor MYB, plant
19 Sobic.007G111600 WRKY89, expressed -
20 Sobic.007G013100 OsFBX142 - F-box domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic009G152901 Sobic009G152901 Sobic004G239000 Sobic004G239000 Sobic009G152901--Sobic004G239000 Sobic001G016900 Sobic001G016900 Sobic009G152901--Sobic001G016900 Sobic003G367401 Sobic003G367401 Sobic009G152901--Sobic003G367401 Sobic001G120100 Sobic001G120100 Sobic009G152901--Sobic001G120100 Sobic004G016600 Sobic004G016600 Sobic009G152901--Sobic004G016600 Sobic003G368150 Sobic003G368150 Sobic009G152901--Sobic003G368150 Sobic004G197300 Sobic004G197300 Sobic009G152901--Sobic004G197300 Sobic001G537900 Sobic001G537900 Sobic009G152901--Sobic001G537900 Sobic010G201000 Sobic010G201000 Sobic009G152901--Sobic010G201000 Sobic003G099500 Sobic003G099500 Sobic004G239000--Sobic003G099500 Sobic008G131800 Sobic008G131800 Sobic004G239000--Sobic008G131800 Sobic002G284800 Sobic002G284800 Sobic004G239000--Sobic002G284800 Sobic002G430200 Sobic002G430200 Sobic004G239000--Sobic002G430200 Sobic004G239000--Sobic001G016900 Sobic004G239000--Sobic003G368150 Sobic001G255700 Sobic001G255700 Sobic004G239000--Sobic001G255700 Sobic002G387100 Sobic002G387100 Sobic004G239000--Sobic002G387100 Sobic007G122300 Sobic007G122300 Sobic004G239000--Sobic007G122300 Sobic001G016900--Sobic004G239000 Sobic001G016900--Sobic003G099500 Sobic001G016900--Sobic003G367401 Sobic007G111600 Sobic007G111600 Sobic001G016900--Sobic007G111600 Sobic001G016900--Sobic008G131800 Sobic001G016900--Sobic002G430200 Sobic001G016900--Sobic010G201000 Sobic002G004100 Sobic002G004100 Sobic001G016900--Sobic002G004100 Sobic001G016900--Sobic004G016600 Sobic003G367401--Sobic002G430200 Sobic003G367401--Sobic010G201000 Sobic001G525000 Sobic001G525000 Sobic003G367401--Sobic001G525000 Sobic003G367401--Sobic002G387100 Sobic003G367401--Sobic007G122300 Sobic007G093400 Sobic007G093400 Sobic003G367401--Sobic007G093400 Sobic003G367401--Sobic004G239000 Sobic003G367401--Sobic001G016900 Sobic003G120400 Sobic003G120400 Sobic003G367401--Sobic003G120400 Sobic001G120100--Sobic001G537900 Sobic001G120100--Sobic004G016600 Sobic001G120100--Sobic007G111600 Sobic004G251350 Sobic004G251350 Sobic001G120100--Sobic004G251350 Sobic001G120100--Sobic001G016900 Sobic003G008850 Sobic003G008850 Sobic001G120100--Sobic003G008850 Sobic010G179150 Sobic010G179150 Sobic001G120100--Sobic010G179150 Sobic001G120100--Sobic009G152901 Sobic007G204500 Sobic007G204500 Sobic001G120100--Sobic007G204500 Sobic004G016600--Sobic001G120100 Sobic004G016600--Sobic001G016900 Sobic009G085600 Sobic009G085600 Sobic004G016600--Sobic009G085600 Sobic004G016600--Sobic004G251350 Sobic004G016600--Sobic001G537900 Sobic007G013100 Sobic007G013100 Sobic004G016600--Sobic007G013100 Sobic003G167825 Sobic003G167825 Sobic004G016600--Sobic003G167825 Sobic004G016600--Sobic007G111600 Sobic004G016600--Sobic009G152901 Sobic003G368150--Sobic002G284800 Sobic003G368150--Sobic001G255700 Sobic003G368150--Sobic008G131800 Sobic003G368150--Sobic007G122300 Sobic003G368150--Sobic004G239000 Sobic008G133100 Sobic008G133100 Sobic003G368150--Sobic008G133100 Sobic003G368150--Sobic002G387100 Sobic003G368150--Sobic004G197300 Sobic003G368150--Sobic003G099500 Sobic004G197300--Sobic010G179150 Sobic004G197300--Sobic003G368150 Sobic004G197300--Sobic001G255700 Sobic007G001300 Sobic007G001300 Sobic004G197300--Sobic007G001300 Sobic004G197300--Sobic002G284800 Sobic004G197300--Sobic008G131800 Sobic009G163500 Sobic009G163500 Sobic004G197300--Sobic009G163500 Sobic004G197300--Sobic001G537900 Sobic003G109400 Sobic003G109400 Sobic004G197300--Sobic003G109400 Sobic008G020300 Sobic008G020300 Sobic001G537900--Sobic008G020300 Sobic001G537900--Sobic001G120100 Sobic001G537900--Sobic010G179150 Sobic004G354800 Sobic004G354800 Sobic001G537900--Sobic004G354800 Sobic001G537900--Sobic004G251350 Sobic001G537900--Sobic004G197300 Sobic001G537900--Sobic009G163500 Sobic001G537900--Sobic003G008850 Sobic001G537900--Sobic007G111600 Sobic010G201000--Sobic003G367401 Sobic010G201000--Sobic007G093400 Sobic010G201000--Sobic002G430200 Sobic010G074980 Sobic010G074980 Sobic010G201000--Sobic010G074980 Sobic010G201000--Sobic001G525000 Sobic010G201000--Sobic002G387100 Sobic010G201000--Sobic003G120400 Sobic010G201000--Sobic001G016900 Sobic010G201000--Sobic003G099500
Octagon: transcription factors


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