Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G537900.1
Synonym Sb01g050060
Functional annotation AGAP010609-PA, putative, expressed
UniProt A0A1B6QR43
Pfam PF05207 PF00226
Panther DB PTHR21454 PTHR21454:SF4
NCBI CDD KOG2923; Uncharacterized conserved protein
KEGG Orthology K17867; DPH4, diphthamide biosynthesis protein 4
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G10130 : DNAJ heat shock N-terminal domain-containing protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g28590.2 : AGAP010609-PA, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a014080
Brachypodium PNT64731
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G020300 myb-like DNA-binding domain containing protein, putative, expressed K09422: transcription factor MYB, plant
2 Sobic.001G120100 DUF1295 domain containing protein, putative, expressed -
3 Sobic.010G179150 - -
4 Sobic.004G354800 - -
5 Sobic.004G251350 - -
6 Sobic.004G197300 - -
7 Sobic.009G163500 - -
8 Sobic.003G008850 - -
9 Sobic.007G111600 WRKY89, expressed -
10 Sobic.008G131800 zinc knuckle family protein, expressed -
11 Sobic.004G016600 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
12 Sobic.003G105300 - -
13 Sobic.007G204500 expressed protein -
14 Sobic.009G082400 - -
15 Sobic.001G255700 - -
16 Sobic.009G152901 - -
17 Sobic.004G239000 - -
18 Sobic.003G109400 - -
19 Sobic.001G541900 "similar to Nitrate/chlorate transporter, putative, expressed"(PubMedID : 29862293)@peptide transporter PTR2, putative, expressed K14638: SLC15A3_4, solute carrier family 15 (peptide/histidine transporter), member 3/4
20 Sobic.007G001300 "cell wall modification, deposition of casparian strips, endodermis, transmembrane"(PubMedID : 24920445)@membrane associated DUF588 domain containing protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G537900 Sobic001G537900 Sobic008G020300 Sobic008G020300 Sobic001G537900--Sobic008G020300 Sobic001G120100 Sobic001G120100 Sobic001G537900--Sobic001G120100 Sobic010G179150 Sobic010G179150 Sobic001G537900--Sobic010G179150 Sobic004G354800 Sobic004G354800 Sobic001G537900--Sobic004G354800 Sobic004G251350 Sobic004G251350 Sobic001G537900--Sobic004G251350 Sobic004G197300 Sobic004G197300 Sobic001G537900--Sobic004G197300 Sobic009G163500 Sobic009G163500 Sobic001G537900--Sobic009G163500 Sobic003G008850 Sobic003G008850 Sobic001G537900--Sobic003G008850 Sobic007G111600 Sobic007G111600 Sobic001G537900--Sobic007G111600 Sobic008G020300--Sobic001G537900 Sobic003G105300 Sobic003G105300 Sobic008G020300--Sobic003G105300 Sobic001G407000 Sobic001G407000 Sobic008G020300--Sobic001G407000 Sobic003G109400 Sobic003G109400 Sobic008G020300--Sobic003G109400 Sobic001G255700 Sobic001G255700 Sobic008G020300--Sobic001G255700 Sobic008G020300--Sobic009G163500 Sobic008G020300--Sobic004G197300 Sobic008G020300--Sobic004G354800 Sobic007G001300 Sobic007G001300 Sobic008G020300--Sobic007G001300 Sobic001G120100--Sobic001G537900 Sobic004G016600 Sobic004G016600 Sobic001G120100--Sobic004G016600 Sobic001G120100--Sobic007G111600 Sobic001G120100--Sobic004G251350 Sobic001G016900 Sobic001G016900 Sobic001G120100--Sobic001G016900 Sobic001G120100--Sobic003G008850 Sobic001G120100--Sobic010G179150 Sobic009G152901 Sobic009G152901 Sobic001G120100--Sobic009G152901 Sobic007G204500 Sobic007G204500 Sobic001G120100--Sobic007G204500 Sobic010G179150--Sobic007G111600 Sobic008G131800 Sobic008G131800 Sobic010G179150--Sobic008G131800 Sobic010G179150--Sobic004G197300 Sobic010G179150--Sobic004G251350 Sobic010G179150--Sobic007G204500 Sobic010G179150--Sobic001G537900 Sobic010G179150--Sobic001G255700 Sobic007G013100 Sobic007G013100 Sobic010G179150--Sobic007G013100 Sobic002G284800 Sobic002G284800 Sobic010G179150--Sobic002G284800 Sobic004G354800--Sobic009G163500 Sobic004G354800--Sobic001G537900 Sobic004G354800--Sobic003G109400 Sobic004G354800--Sobic008G020300 Sobic003G136700 Sobic003G136700 Sobic004G354800--Sobic003G136700 Sobic004G354800--Sobic004G197300 Sobic004G354800--Sobic008G131800 Sobic004G354800--Sobic009G152901 Sobic004G354800--Sobic001G255700 Sobic004G251350--Sobic007G111600 Sobic004G251350--Sobic010G179150 Sobic004G251350--Sobic007G204500 Sobic004G251350--Sobic008G131800 Sobic004G251350--Sobic001G537900 Sobic004G251350--Sobic001G120100 Sobic009G082400 Sobic009G082400 Sobic004G251350--Sobic009G082400 Sobic004G251350--Sobic004G016600 Sobic004G251350--Sobic007G013100 Sobic004G197300--Sobic010G179150 Sobic003G368150 Sobic003G368150 Sobic004G197300--Sobic003G368150 Sobic004G197300--Sobic001G255700 Sobic004G197300--Sobic007G001300 Sobic004G197300--Sobic002G284800 Sobic004G197300--Sobic008G131800 Sobic004G197300--Sobic009G163500 Sobic004G197300--Sobic001G537900 Sobic004G197300--Sobic003G109400 Sobic009G163500--Sobic004G354800 Sobic009G163500--Sobic003G109400 Sobic009G163500--Sobic001G255700 Sobic009G163500--Sobic008G131800 Sobic009G163500--Sobic004G197300 Sobic009G163500--Sobic003G368150 Sobic009G163500--Sobic010G179150 Sobic009G163500--Sobic001G537900 Sobic009G163500--Sobic002G284800 Sobic003G008850--Sobic001G537900 Sobic003G008850--Sobic001G120100 Sobic006G256801 Sobic006G256801 Sobic003G008850--Sobic006G256801 Sobic003G008850--Sobic004G016600 Sobic003G008850--Sobic008G020300 Sobic008G164525 Sobic008G164525 Sobic003G008850--Sobic008G164525 Sobic003G008850--Sobic007G204500 Sobic008G119000 Sobic008G119000 Sobic003G008850--Sobic008G119000 Sobic003G008850--Sobic004G251350 Sobic007G111600--Sobic008G131800 Sobic007G111600--Sobic010G179150 Sobic007G111600--Sobic004G251350 Sobic007G111600--Sobic007G204500 Sobic007G116600 Sobic007G116600 Sobic007G111600--Sobic007G116600 Sobic004G239000 Sobic004G239000 Sobic007G111600--Sobic004G239000 Sobic003G099500 Sobic003G099500 Sobic007G111600--Sobic003G099500 Sobic007G111600--Sobic001G016900 Sobic007G111600--Sobic007G013100
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.