Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G008850.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0VVC0
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G14260 : proline iminopeptidase
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g43830.2 : hydrolase, alpha/beta fold family domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a044216
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G537900 AGAP010609-PA, putative, expressed K17867: DPH4, diphthamide biosynthesis protein 4
2 Sobic.001G120100 DUF1295 domain containing protein, putative, expressed -
3 Sobic.006G256801 - -
4 Sobic.004G016600 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
5 Sobic.008G020300 myb-like DNA-binding domain containing protein, putative, expressed K09422: transcription factor MYB, plant
6 Sobic.008G164525 - -
7 Sobic.007G204500 expressed protein -
8 Sobic.008G119000 cysteine protease, putative, expressed -
9 Sobic.004G251350 - -
10 Sobic.007G013100 OsFBX142 - F-box domain containing protein, expressed -
11 Sobic.010G179150 - -
12 Sobic.005G076100 rp3 protein, putative, expressed -
13 Sobic.009G152901 - -
14 Sobic.001G434450 - K13101: G patch domain and KOW motifs-containing protein
15 Sobic.004G197300 - -
16 Sobic.002G165401 - -
17 Sobic.009G082400 - -
18 Sobic.006G222800 NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed -
19 Sobic.007G111600 WRKY89, expressed -
20 Sobic.003G149900 PPR repeat domain containing protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic003G008850 Sobic003G008850 Sobic001G537900 Sobic001G537900 Sobic003G008850--Sobic001G537900 Sobic001G120100 Sobic001G120100 Sobic003G008850--Sobic001G120100 Sobic006G256801 Sobic006G256801 Sobic003G008850--Sobic006G256801 Sobic004G016600 Sobic004G016600 Sobic003G008850--Sobic004G016600 Sobic008G020300 Sobic008G020300 Sobic003G008850--Sobic008G020300 Sobic008G164525 Sobic008G164525 Sobic003G008850--Sobic008G164525 Sobic007G204500 Sobic007G204500 Sobic003G008850--Sobic007G204500 Sobic008G119000 Sobic008G119000 Sobic003G008850--Sobic008G119000 Sobic004G251350 Sobic004G251350 Sobic003G008850--Sobic004G251350 Sobic001G537900--Sobic008G020300 Sobic001G537900--Sobic001G120100 Sobic010G179150 Sobic010G179150 Sobic001G537900--Sobic010G179150 Sobic004G354800 Sobic004G354800 Sobic001G537900--Sobic004G354800 Sobic001G537900--Sobic004G251350 Sobic004G197300 Sobic004G197300 Sobic001G537900--Sobic004G197300 Sobic009G163500 Sobic009G163500 Sobic001G537900--Sobic009G163500 Sobic001G537900--Sobic003G008850 Sobic007G111600 Sobic007G111600 Sobic001G537900--Sobic007G111600 Sobic001G120100--Sobic001G537900 Sobic001G120100--Sobic004G016600 Sobic001G120100--Sobic007G111600 Sobic001G120100--Sobic004G251350 Sobic001G016900 Sobic001G016900 Sobic001G120100--Sobic001G016900 Sobic001G120100--Sobic003G008850 Sobic001G120100--Sobic010G179150 Sobic009G152901 Sobic009G152901 Sobic001G120100--Sobic009G152901 Sobic001G120100--Sobic007G204500 Sobic006G256801--Sobic003G008850 Sobic006G256801--Sobic008G164525 Sobic006G094400 Sobic006G094400 Sobic006G256801--Sobic006G094400 Sobic001G434450 Sobic001G434450 Sobic006G256801--Sobic001G434450 Sobic006G180500 Sobic006G180500 Sobic006G256801--Sobic006G180500 Sobic006G256801--Sobic001G120100 Sobic006G222800 Sobic006G222800 Sobic006G256801--Sobic006G222800 Sobic010G244701 Sobic010G244701 Sobic006G256801--Sobic010G244701 Sobic002G165401 Sobic002G165401 Sobic006G256801--Sobic002G165401 Sobic004G016600--Sobic001G120100 Sobic004G016600--Sobic001G016900 Sobic009G085600 Sobic009G085600 Sobic004G016600--Sobic009G085600 Sobic004G016600--Sobic004G251350 Sobic004G016600--Sobic001G537900 Sobic007G013100 Sobic007G013100 Sobic004G016600--Sobic007G013100 Sobic003G167825 Sobic003G167825 Sobic004G016600--Sobic003G167825 Sobic004G016600--Sobic007G111600 Sobic004G016600--Sobic009G152901 Sobic008G020300--Sobic001G537900 Sobic003G105300 Sobic003G105300 Sobic008G020300--Sobic003G105300 Sobic001G407000 Sobic001G407000 Sobic008G020300--Sobic001G407000 Sobic003G109400 Sobic003G109400 Sobic008G020300--Sobic003G109400 Sobic001G255700 Sobic001G255700 Sobic008G020300--Sobic001G255700 Sobic008G020300--Sobic009G163500 Sobic008G020300--Sobic004G197300 Sobic008G020300--Sobic004G354800 Sobic007G001300 Sobic007G001300 Sobic008G020300--Sobic007G001300 Sobic008G164525--Sobic001G434450 Sobic008G164525--Sobic006G256801 Sobic004G314750 Sobic004G314750 Sobic008G164525--Sobic004G314750 Sobic008G164525--Sobic003G008850 Sobic008G164525--Sobic006G094400 Sobic008G164525--Sobic006G222800 Sobic008G164525--Sobic008G119000 Sobic008G164525--Sobic004G016600 Sobic003G038300 Sobic003G038300 Sobic008G164525--Sobic003G038300 Sobic007G204500--Sobic007G111600 Sobic007G204500--Sobic004G251350 Sobic007G204500--Sobic010G179150 Sobic007G161450 Sobic007G161450 Sobic007G204500--Sobic007G161450 Sobic007G116600 Sobic007G116600 Sobic007G204500--Sobic007G116600 Sobic007G204500--Sobic008G119000 Sobic007G204500--Sobic001G537900 Sobic007G204500--Sobic006G180500 Sobic007G204500--Sobic001G120100 Sobic008G119000--Sobic009G085600 Sobic008G119000--Sobic006G180500 Sobic008G119000--Sobic007G204500 Sobic008G119000--Sobic004G016600 Sobic008G119000--Sobic003G167825 Sobic008G119000--Sobic007G116600 Sobic008G119000--Sobic006G222800 Sobic009G082400 Sobic009G082400 Sobic008G119000--Sobic009G082400 Sobic008G119000--Sobic004G251350 Sobic004G251350--Sobic007G111600 Sobic004G251350--Sobic010G179150 Sobic004G251350--Sobic007G204500 Sobic008G131800 Sobic008G131800 Sobic004G251350--Sobic008G131800 Sobic004G251350--Sobic001G537900 Sobic004G251350--Sobic001G120100 Sobic004G251350--Sobic009G082400 Sobic004G251350--Sobic004G016600 Sobic004G251350--Sobic007G013100
Octagon: transcription factors


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