Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G164525.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5R784
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os10g04660.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G434450 - K13101: G patch domain and KOW motifs-containing protein
2 Sobic.006G256801 - -
3 Sobic.004G314750 - -
4 Sobic.003G008850 - -
5 Sobic.006G094400 - -
6 Sobic.006G222800 NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed -
7 Sobic.008G119000 cysteine protease, putative, expressed -
8 Sobic.004G016600 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
9 Sobic.003G038300 - -
10 Sobic.006G180500 - -
11 Sobic.001G120100 DUF1295 domain containing protein, putative, expressed -
12 Sobic.010G244701 - -
13 Sobic.009G085600 acetyltransferase, GNAT family, putative, expressed -
14 Sobic.007G013100 OsFBX142 - F-box domain containing protein, expressed -
15 Sobic.007G161450 - -
16 Sobic.002G165401 - -
17 Sobic.007G204500 expressed protein -
18 Sobic.003G167825 - -
19 Sobic.009G094000 - -
20 Sobic.007G116600 5-AMP-activated protein kinase beta-1 subunit-related, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic008G164525 Sobic008G164525 Sobic001G434450 Sobic001G434450 Sobic008G164525--Sobic001G434450 Sobic006G256801 Sobic006G256801 Sobic008G164525--Sobic006G256801 Sobic004G314750 Sobic004G314750 Sobic008G164525--Sobic004G314750 Sobic003G008850 Sobic003G008850 Sobic008G164525--Sobic003G008850 Sobic006G094400 Sobic006G094400 Sobic008G164525--Sobic006G094400 Sobic006G222800 Sobic006G222800 Sobic008G164525--Sobic006G222800 Sobic008G119000 Sobic008G119000 Sobic008G164525--Sobic008G119000 Sobic004G016600 Sobic004G016600 Sobic008G164525--Sobic004G016600 Sobic003G038300 Sobic003G038300 Sobic008G164525--Sobic003G038300 Sobic001G434450--Sobic008G164525 Sobic001G434450--Sobic004G314750 Sobic001G434450--Sobic006G256801 Sobic001G434450--Sobic006G094400 Sobic001G434450--Sobic003G008850 Sobic009G094000 Sobic009G094000 Sobic001G434450--Sobic009G094000 Sobic010G244701 Sobic010G244701 Sobic001G434450--Sobic010G244701 Sobic001G120100 Sobic001G120100 Sobic001G434450--Sobic001G120100 Sobic001G434450--Sobic006G222800 Sobic006G256801--Sobic003G008850 Sobic006G256801--Sobic008G164525 Sobic006G256801--Sobic006G094400 Sobic006G256801--Sobic001G434450 Sobic006G180500 Sobic006G180500 Sobic006G256801--Sobic006G180500 Sobic006G256801--Sobic001G120100 Sobic006G256801--Sobic006G222800 Sobic006G256801--Sobic010G244701 Sobic002G165401 Sobic002G165401 Sobic006G256801--Sobic002G165401 Sobic004G314750--Sobic008G164525 Sobic004G314750--Sobic001G434450 Sobic004G314750--Sobic006G094400 Sobic004G314750--Sobic006G256801 Sobic002G114600 Sobic002G114600 Sobic004G314750--Sobic002G114600 Sobic004G314750--Sobic010G244701 Sobic004G314750--Sobic003G008850 Sobic004G314750--Sobic009G094000 Sobic004G314750--Sobic006G222800 Sobic001G537900 Sobic001G537900 Sobic003G008850--Sobic001G537900 Sobic003G008850--Sobic001G120100 Sobic003G008850--Sobic006G256801 Sobic003G008850--Sobic004G016600 Sobic008G020300 Sobic008G020300 Sobic003G008850--Sobic008G020300 Sobic003G008850--Sobic008G164525 Sobic007G204500 Sobic007G204500 Sobic003G008850--Sobic007G204500 Sobic003G008850--Sobic008G119000 Sobic004G251350 Sobic004G251350 Sobic003G008850--Sobic004G251350 Sobic006G094400--Sobic006G256801 Sobic006G094400--Sobic001G434450 Sobic006G094400--Sobic008G164525 Sobic006G094400--Sobic004G314750 Sobic006G094400--Sobic006G180500 Sobic004G001900 Sobic004G001900 Sobic006G094400--Sobic004G001900 Sobic006G094400--Sobic009G094000 Sobic006G094400--Sobic002G165401 Sobic006G094400--Sobic003G008850 Sobic006G222800--Sobic006G180500 Sobic006G222800--Sobic002G165401 Sobic006G222800--Sobic008G119000 Sobic006G222800--Sobic007G204500 Sobic007G161450 Sobic007G161450 Sobic006G222800--Sobic007G161450 Sobic006G222800--Sobic006G256801 Sobic006G222800--Sobic004G001900 Sobic009G085600 Sobic009G085600 Sobic006G222800--Sobic009G085600 Sobic006G222800--Sobic003G008850 Sobic008G119000--Sobic009G085600 Sobic008G119000--Sobic006G180500 Sobic008G119000--Sobic007G204500 Sobic008G119000--Sobic004G016600 Sobic003G167825 Sobic003G167825 Sobic008G119000--Sobic003G167825 Sobic007G116600 Sobic007G116600 Sobic008G119000--Sobic007G116600 Sobic008G119000--Sobic006G222800 Sobic009G082400 Sobic009G082400 Sobic008G119000--Sobic009G082400 Sobic008G119000--Sobic004G251350 Sobic004G016600--Sobic001G120100 Sobic001G016900 Sobic001G016900 Sobic004G016600--Sobic001G016900 Sobic004G016600--Sobic009G085600 Sobic004G016600--Sobic004G251350 Sobic004G016600--Sobic001G537900 Sobic007G013100 Sobic007G013100 Sobic004G016600--Sobic007G013100 Sobic004G016600--Sobic003G167825 Sobic007G111600 Sobic007G111600 Sobic004G016600--Sobic007G111600 Sobic009G152901 Sobic009G152901 Sobic004G016600--Sobic009G152901 Sobic003G126400 Sobic003G126400 Sobic003G038300--Sobic003G126400 Sobic003G038300--Sobic003G167825 Sobic003G038300--Sobic009G085600 Sobic006G069050 Sobic006G069050 Sobic003G038300--Sobic006G069050 Sobic001G115900 Sobic001G115900 Sobic003G038300--Sobic001G115900 Sobic003G038300--Sobic004G016600 Sobic010G201000 Sobic010G201000 Sobic003G038300--Sobic010G201000 Sobic003G038300--Sobic001G016900 Sobic004G152501 Sobic004G152501 Sobic003G038300--Sobic004G152501
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.