Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G180500.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PML4
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G119000 cysteine protease, putative, expressed -
2 Sobic.007G204500 expressed protein -
3 Sobic.009G085600 acetyltransferase, GNAT family, putative, expressed -
4 Sobic.004G251350 - -
5 Sobic.006G222800 NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed -
6 Sobic.006G256801 - -
7 Sobic.002G165401 - -
8 Sobic.007G116600 5-AMP-activated protein kinase beta-1 subunit-related, putative, expressed -
9 Sobic.007G111600 WRKY89, expressed -
10 Sobic.007G161450 - -
11 Sobic.004G016600 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
12 Sobic.009G082400 - -
13 Sobic.006G094400 - -
14 Sobic.003G167825 - -
15 Sobic.007G013100 OsFBX142 - F-box domain containing protein, expressed -
16 Sobic.004G001900 expressed protein -
17 Sobic.001G120100 DUF1295 domain containing protein, putative, expressed -
18 Sobic.010G179150 - -
19 Sobic.001G481201 - -
20 Sobic.001G537900 AGAP010609-PA, putative, expressed K17867: DPH4, diphthamide biosynthesis protein 4


Gene co-expression network
sample Sobic006G180500 Sobic006G180500 Sobic008G119000 Sobic008G119000 Sobic006G180500--Sobic008G119000 Sobic007G204500 Sobic007G204500 Sobic006G180500--Sobic007G204500 Sobic009G085600 Sobic009G085600 Sobic006G180500--Sobic009G085600 Sobic004G251350 Sobic004G251350 Sobic006G180500--Sobic004G251350 Sobic006G222800 Sobic006G222800 Sobic006G180500--Sobic006G222800 Sobic006G256801 Sobic006G256801 Sobic006G180500--Sobic006G256801 Sobic002G165401 Sobic002G165401 Sobic006G180500--Sobic002G165401 Sobic007G116600 Sobic007G116600 Sobic006G180500--Sobic007G116600 Sobic007G111600 Sobic007G111600 Sobic006G180500--Sobic007G111600 Sobic008G119000--Sobic009G085600 Sobic008G119000--Sobic006G180500 Sobic008G119000--Sobic007G204500 Sobic004G016600 Sobic004G016600 Sobic008G119000--Sobic004G016600 Sobic003G167825 Sobic003G167825 Sobic008G119000--Sobic003G167825 Sobic008G119000--Sobic007G116600 Sobic008G119000--Sobic006G222800 Sobic009G082400 Sobic009G082400 Sobic008G119000--Sobic009G082400 Sobic008G119000--Sobic004G251350 Sobic007G204500--Sobic007G111600 Sobic007G204500--Sobic004G251350 Sobic010G179150 Sobic010G179150 Sobic007G204500--Sobic010G179150 Sobic007G161450 Sobic007G161450 Sobic007G204500--Sobic007G161450 Sobic007G204500--Sobic007G116600 Sobic007G204500--Sobic008G119000 Sobic001G537900 Sobic001G537900 Sobic007G204500--Sobic001G537900 Sobic007G204500--Sobic006G180500 Sobic001G120100 Sobic001G120100 Sobic007G204500--Sobic001G120100 Sobic009G085600--Sobic003G167825 Sobic009G085600--Sobic008G119000 Sobic002G004100 Sobic002G004100 Sobic009G085600--Sobic002G004100 Sobic009G085600--Sobic004G016600 Sobic009G085600--Sobic007G116600 Sobic009G085600--Sobic006G180500 Sobic009G085600--Sobic007G111600 Sobic009G085600--Sobic007G204500 Sobic001G016900 Sobic001G016900 Sobic009G085600--Sobic001G016900 Sobic004G251350--Sobic007G111600 Sobic004G251350--Sobic010G179150 Sobic004G251350--Sobic007G204500 Sobic008G131800 Sobic008G131800 Sobic004G251350--Sobic008G131800 Sobic004G251350--Sobic001G537900 Sobic004G251350--Sobic001G120100 Sobic004G251350--Sobic009G082400 Sobic004G251350--Sobic004G016600 Sobic007G013100 Sobic007G013100 Sobic004G251350--Sobic007G013100 Sobic006G222800--Sobic006G180500 Sobic006G222800--Sobic002G165401 Sobic006G222800--Sobic008G119000 Sobic006G222800--Sobic007G204500 Sobic006G222800--Sobic007G161450 Sobic006G222800--Sobic006G256801 Sobic004G001900 Sobic004G001900 Sobic006G222800--Sobic004G001900 Sobic006G222800--Sobic009G085600 Sobic003G008850 Sobic003G008850 Sobic006G222800--Sobic003G008850 Sobic006G256801--Sobic003G008850 Sobic008G164525 Sobic008G164525 Sobic006G256801--Sobic008G164525 Sobic006G094400 Sobic006G094400 Sobic006G256801--Sobic006G094400 Sobic001G434450 Sobic001G434450 Sobic006G256801--Sobic001G434450 Sobic006G256801--Sobic006G180500 Sobic006G256801--Sobic001G120100 Sobic006G256801--Sobic006G222800 Sobic010G244701 Sobic010G244701 Sobic006G256801--Sobic010G244701 Sobic006G256801--Sobic002G165401 Sobic001G481201 Sobic001G481201 Sobic002G165401--Sobic001G481201 Sobic002G165401--Sobic006G222800 Sobic002G165401--Sobic004G001900 Sobic002G165401--Sobic006G180500 Sobic002G165401--Sobic009G082400 Sobic002G165401--Sobic006G256801 Sobic002G165401--Sobic007G204500 Sobic002G165401--Sobic003G008850 Sobic002G165401--Sobic006G094400 Sobic007G116600--Sobic007G111600 Sobic007G116600--Sobic007G013100 Sobic003G099500 Sobic003G099500 Sobic007G116600--Sobic003G099500 Sobic007G116600--Sobic001G016900 Sobic007G116600--Sobic007G204500 Sobic004G239000 Sobic004G239000 Sobic007G116600--Sobic004G239000 Sobic007G116600--Sobic008G131800 Sobic007G116600--Sobic010G179150 Sobic007G116600--Sobic004G251350 Sobic007G111600--Sobic008G131800 Sobic007G111600--Sobic010G179150 Sobic007G111600--Sobic004G251350 Sobic007G111600--Sobic007G204500 Sobic007G111600--Sobic007G116600 Sobic007G111600--Sobic004G239000 Sobic007G111600--Sobic003G099500 Sobic007G111600--Sobic001G016900 Sobic007G111600--Sobic007G013100
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.