Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G119000.1
Synonym Sb08g017270
Functional annotation cysteine protease, putative, expressed
UniProt A0A1B6PD45
Pfam PF08246
Panther DB PTHR12411 PTHR12411:SF386
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0008234; cysteine-type peptidase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G50260 : Cysteine proteinases superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g18210.1 : cysteine protease, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.008G119000


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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20 Sobic.002G165401 - -


Gene co-expression network
sample Sobic008G119000 Sobic008G119000 Sobic009G085600 Sobic009G085600 Sobic008G119000--Sobic009G085600 Sobic006G180500 Sobic006G180500 Sobic008G119000--Sobic006G180500 Sobic007G204500 Sobic007G204500 Sobic008G119000--Sobic007G204500 Sobic004G016600 Sobic004G016600 Sobic008G119000--Sobic004G016600 Sobic003G167825 Sobic003G167825 Sobic008G119000--Sobic003G167825 Sobic007G116600 Sobic007G116600 Sobic008G119000--Sobic007G116600 Sobic006G222800 Sobic006G222800 Sobic008G119000--Sobic006G222800 Sobic009G082400 Sobic009G082400 Sobic008G119000--Sobic009G082400 Sobic004G251350 Sobic004G251350 Sobic008G119000--Sobic004G251350 Sobic009G085600--Sobic003G167825 Sobic009G085600--Sobic008G119000 Sobic002G004100 Sobic002G004100 Sobic009G085600--Sobic002G004100 Sobic009G085600--Sobic004G016600 Sobic009G085600--Sobic007G116600 Sobic009G085600--Sobic006G180500 Sobic007G111600 Sobic007G111600 Sobic009G085600--Sobic007G111600 Sobic009G085600--Sobic007G204500 Sobic001G016900 Sobic001G016900 Sobic009G085600--Sobic001G016900 Sobic006G180500--Sobic008G119000 Sobic006G180500--Sobic007G204500 Sobic006G180500--Sobic009G085600 Sobic006G180500--Sobic004G251350 Sobic006G180500--Sobic006G222800 Sobic006G256801 Sobic006G256801 Sobic006G180500--Sobic006G256801 Sobic002G165401 Sobic002G165401 Sobic006G180500--Sobic002G165401 Sobic006G180500--Sobic007G116600 Sobic006G180500--Sobic007G111600 Sobic007G204500--Sobic007G111600 Sobic007G204500--Sobic004G251350 Sobic010G179150 Sobic010G179150 Sobic007G204500--Sobic010G179150 Sobic007G161450 Sobic007G161450 Sobic007G204500--Sobic007G161450 Sobic007G204500--Sobic007G116600 Sobic007G204500--Sobic008G119000 Sobic001G537900 Sobic001G537900 Sobic007G204500--Sobic001G537900 Sobic007G204500--Sobic006G180500 Sobic001G120100 Sobic001G120100 Sobic007G204500--Sobic001G120100 Sobic004G016600--Sobic001G120100 Sobic004G016600--Sobic001G016900 Sobic004G016600--Sobic009G085600 Sobic004G016600--Sobic004G251350 Sobic004G016600--Sobic001G537900 Sobic007G013100 Sobic007G013100 Sobic004G016600--Sobic007G013100 Sobic004G016600--Sobic003G167825 Sobic004G016600--Sobic007G111600 Sobic009G152901 Sobic009G152901 Sobic004G016600--Sobic009G152901 Sobic003G167825--Sobic009G085600 Sobic001G460800 Sobic001G460800 Sobic003G167825--Sobic001G460800 Sobic003G167825--Sobic002G004100 Sobic003G167825--Sobic004G016600 Sobic003G167825--Sobic008G119000 Sobic003G038300 Sobic003G038300 Sobic003G167825--Sobic003G038300 Sobic003G167825--Sobic001G016900 Sobic002G285800 Sobic002G285800 Sobic003G167825--Sobic002G285800 Sobic003G126400 Sobic003G126400 Sobic003G167825--Sobic003G126400 Sobic007G116600--Sobic007G111600 Sobic007G116600--Sobic007G013100 Sobic003G099500 Sobic003G099500 Sobic007G116600--Sobic003G099500 Sobic007G116600--Sobic001G016900 Sobic007G116600--Sobic007G204500 Sobic004G239000 Sobic004G239000 Sobic007G116600--Sobic004G239000 Sobic008G131800 Sobic008G131800 Sobic007G116600--Sobic008G131800 Sobic007G116600--Sobic010G179150 Sobic007G116600--Sobic004G251350 Sobic006G222800--Sobic006G180500 Sobic006G222800--Sobic002G165401 Sobic006G222800--Sobic008G119000 Sobic006G222800--Sobic007G204500 Sobic006G222800--Sobic007G161450 Sobic006G222800--Sobic006G256801 Sobic004G001900 Sobic004G001900 Sobic006G222800--Sobic004G001900 Sobic006G222800--Sobic009G085600 Sobic003G008850 Sobic003G008850 Sobic006G222800--Sobic003G008850 Sobic009G082400--Sobic004G251350 Sobic005G076100 Sobic005G076100 Sobic009G082400--Sobic005G076100 Sobic009G082400--Sobic001G537900 Sobic009G082400--Sobic004G016600 Sobic009G082400--Sobic007G204500 Sobic001G481201 Sobic001G481201 Sobic009G082400--Sobic001G481201 Sobic009G082400--Sobic008G119000 Sobic009G082400--Sobic009G085600 Sobic004G354800 Sobic004G354800 Sobic009G082400--Sobic004G354800 Sobic004G251350--Sobic007G111600 Sobic004G251350--Sobic010G179150 Sobic004G251350--Sobic007G204500 Sobic004G251350--Sobic008G131800 Sobic004G251350--Sobic001G537900 Sobic004G251350--Sobic001G120100 Sobic004G251350--Sobic009G082400 Sobic004G251350--Sobic004G016600 Sobic004G251350--Sobic007G013100
Octagon: transcription factors


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